[QE-users] computational efficiency with CPMD
Lu Hailin
415005271 at qq.com
Mon Apr 8 16:23:25 CEST 2019
Dear all,
the cpmd calculation costs too much time .The model contains 112 atoms,72 of them are Fe atoms .
If the model runs 10ps of md with 12 CPU,it may need 1600h,it's amazing and not realistic.so,I doubt that if some parameters are not reasonable .follwing is my input file,any suggestions would appreciate.
&control calculation = 'cp', title = ' MD Simulation' , restart_mode = 'reset_counters', ndr =93,ndw =94, nstep = 20000,iprint = 50,isave = 50, dt = 5.D0, tstress = .TRUE., tprnfor = .TRUE., prefix = 'FeGrFe', pseudo_dir = '/public/--/pseudo/ ', outdir = '/public/--/tmp/' etot_conv_thr = 1.d-3, ekin_conv_thr = 1.d-3, forc_conv_thr = 1.d-2 / &system ibrav = 0, nat = 112, ntyp = 2,nspin=2, nr1b = 24,nr2b = 24,nr3b = 24, ecutwfc = 40.0, ecutrho = 235.0, vdw_corr='DFT-D', london_s6 = 0.75 / &electrons electron_dynamics = 'verlet', emass = 300, emass_cutoff = 2.5, ortho_max=500, / &ions ion_dynamics='verlet', ion_velocities = 'from_input', ion_temperature='nose', tempw=300, fnosep=4., ion_radius(1) = 0.7, ion_radius(2) = 0.4, / CELL_PARAMETERS angstrom 8.599200000000000 0.000000000000001 0.000000000000001 0.000000000000000 12.161105265558700 0.000000000000001 0.000000000000000 0.000000000000000 20.000000000000000 ATOMIC_SPECIES Fe 55.847 Fe.rel-pbe-spn-rrkjus_psl.0.2.1.UPF C 12.0107 C.pbe-n-rrkjus_psl.0.1.UPF ATOMIC_POSITIONS crystal Fe 0.0000000000000000 0.1666666666666660 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.0000000000000000 0.4999999999999990 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.0000000000000000 0.8333333333333330 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.1666666666666660 0.0000000000000004 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.1666666666666660 0.3333333333333330 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.1666666666666660 0.6666666666666660 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.3333333333333340 0.1666666666666660 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.3333333333333340 0.4999999999999990 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.3333333333333340 0.8333333333333330 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.5000000000000000 0.0000000000000004 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.5000000000000000 0.3333333333333330 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.5000000000000000 0.6666666666666660 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.6666666666666670 0.1666666666666660 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.6666666666666670 0.4999999999999990 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.6666666666666670 0.8333333333333330 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.8333333333333330 0.0000000000000004 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.8333333333333330 0.3333333333333330 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.8333333333333330 0.6666666666666660 0.0629999995231628 0 0 0 Fe 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.1643425434028180 Fe 0.0000000000000000 0.3333333333333320 0.1643425434028180 Fe 0.0000000000000000 0.6666666666666660 0.1643425434028180 Fe 0.1666666666666660 0.1666666666666660 0.1643425434028180 Fe 0.1666666666666660 0.4999999999999990 0.1643425434028180 Fe 0.1666666666666660 0.8333333333333330 0.1643425434028180 Fe 0.3333333333333340 0.0000000000000000 0.1643425434028180 Fe 0.3333333333333340 0.3333333333333320 0.1643425434028180 Fe 0.3333333333333340 0.6666666666666660 0.1643425434028180 Fe 0.5000000000000000 0.1666666666666660 0.1643425434028180 Fe 0.5000000000000000 0.4999999999999990 0.1643425434028180 Fe 0.5000000000000000 0.8333333333333330 0.1643425434028180 Fe 0.6666666666666670 0.0000000000000000 0.1643425434028180 Fe 0.6666666666666670 0.3333333333333320 0.1643425434028180 Fe 0.6666666666666670 0.6666666666666660 0.1643425434028180 Fe 0.8333333333333330 0.1666666666666660 0.1643425434028180 Fe 0.8333333333333330 0.4999999999999990 0.1643425434028180 Fe 0.8333333333333330 0.8333333333333330 0.1643425434028180 Fe 0.0000000000000000 0.8333333333333330 0.3953425469999990 Fe 0.1666666666666660 0.6666666666666660 0.3953425469999990 Fe 0.3333333333333330 0.8333333333333330 0.3953425469999990 Fe 0.4999999999999990 0.6666666666666660 0.3953425469999990 Fe 0.6666666666666670 0.4999999999999990 0.3953425469999990 Fe 0.6666666666666670 0.8333333333333330 0.3953425469999990 Fe 0.8333333333333330 0.3333333333333330 0.3953425469999990 Fe 0.8333333333333330 0.6666666666666660 0.3953425469999990 Fe 0.0000000000000000 0.1666666666666670 0.3953425470000000 Fe 0.0000000000000000 0.4999999999999990 0.3953425470000000 Fe 0.1666666666666660 0.0000000000000003 0.3953425470000000 Fe 0.1666666666666660 0.3333333333333330 0.3953425470000000 Fe 0.3333333333333330 0.1666666666666660 0.3953425470000000 Fe 0.3333333333333330 0.4999999999999990 0.3953425470000000 Fe 0.4999999999999990 0.0000000000000003 0.3953425470000000 Fe 0.4999999999999990 0.3333333333333330 0.3953425470000000 Fe 0.6666666666666670 0.1666666666666670 0.3953425470000000 Fe 0.8333333333333330 0.0000000000000003 0.3953425470000000 Fe 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.0000000000000000 0.3333333333333320 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.0000000000000000 0.6666666666666660 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.1666666666666660 0.1666666666666670 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.1666666666666660 0.4999999999999990 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.1666666666666660 0.8333333333333330 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.3333333333333330 0.0000000000000000 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.3333333333333330 0.3333333333333320 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.3333333333333330 0.6666666666666660 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.4999999999999990 0.1666666666666670 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.4999999999999990 0.4999999999999990 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.4999999999999990 0.8333333333333330 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.6666666666666670 0.0000000000000000 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.6666666666666670 0.3333333333333320 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.6666666666666670 0.6666666666666660 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.8333333333333330 0.1666666666666670 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.8333333333333330 0.4999999999999990 0.4966850909999990 0 0 1 Fe 0.8333333333333330 0.8333333333333330 0.4966850910000000 0 0 1 C 0.0000000000000000 0.7999999999999990 0.2789999999999990 C 0.0833333333333340 0.7000000000000000 0.2789999999999990 C 0.0833333333333340 0.8999999999999990 0.2789999999999990 C 0.2499999999999980 0.7000000000000000 0.2789999999999990 C 0.2499999999999980 0.8999999999999990 0.2789999999999990 C 0.3333333333333340 0.6000000000000000 0.2789999999999990 C 0.3333333333333340 0.7999999999999990 0.2789999999999990 C 0.5000000000000010 0.3999999999999990 0.2789999999999990 C 0.5000000000000010 0.6000000000000000 0.2789999999999990 C 0.5000000000000010 0.7999999999999990 0.2789999999999990 C 0.5833333333333330 0.4999999999999990 0.2789999999999990 C 0.5833333333333330 0.7000000000000000 0.2789999999999990 C 0.5833333333333330 0.8999999999999990 0.2789999999999990 C 0.7500000000000010 0.3000000000000000 0.2789999999999990 C 0.7500000000000010 0.4999999999999990 0.2789999999999990 C 0.7500000000000010 0.7000000000000000 0.2789999999999990 C 0.7500000000000010 0.8999999999999990 0.2789999999999990 C 0.8333333333333350 0.2000000000000000 0.2789999999999990 C 0.8333333333333350 0.3999999999999990 0.2789999999999990 C 0.8333333333333350 0.7999999999999990 0.2789999999999990 C 0.8333333333333380 0.6000000000000000 0.2789999999999990 C 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.2790000000000000 C 0.0000000000000000 0.2000000000000000 0.2790000000000000 C 0.0000000000000000 0.3999999999999990 0.2790000000000000 C 0.0000000000000000 0.6000000000000000 0.2790000000000000 C 0.0833333333333304 0.1000000000000000 0.2790000000000000 C 0.0833333333333340 0.3000000000000000 0.2790000000000000 C 0.0833333333333340 0.4999999999999990 0.2790000000000000 C 0.2499999999999980 0.1000000000000000 0.2790000000000000 C 0.2499999999999980 0.3000000000000000 0.2790000000000000 C 0.2499999999999990 0.4999999999999990 0.2790000000000000 C 0.3333333333333340 0.0000000000000000 0.2790000000000000 C 0.3333333333333340 0.2000000000000000 0.2790000000000000 C 0.3333333333333340 0.3999999999999990 0.2790000000000000 C 0.5000000000000000 0.0000000000000000 0.2790000000000000 C 0.5000000000000010 0.2000000000000000 0.2790000000000000 C 0.5833333333333330 0.1000000000000000 0.2790000000000000 C 0.5833333333333330 0.3000000000000000 0.2790000000000000 C 0.7500000000000010 0.1000000000000000 0.2790000000000000 C 0.8333333333333350 0.0000000000000000 0.2790000000000000 ATOMIC_VELOCITIES Fe 0 0 0 Fe 0 0 0 ... Fe 0 3.98d-6 0 Fe 0 3.98d-6 0 ... C 0 0 0 C 0 0 0 ...
ATOMIC_FORCES Fe 0 0 0 Fe 0 0 0 ... Fe 0 0 -1.41d-2 Fe 0 0 -1.41d-2
...
C 0 0 0 C 0 0 0
thank you!
Best regards,
------
LU Hailin, Graduate Student
State Key Laboratory of Mechanical Transmission, Chongqing University
Chongqing 400044, China
Tel: (+86) 18362360286
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.quantum-espresso.org/pipermail/users/attachments/20190408/836675bf/attachment.html>
More information about the users
mailing list