[Pw_forum] Getting NaN values in QHA calculations
Peram sreenivasa reddy
peramsreenivas at gmail.com
Wed May 29 07:08:04 CEST 2013
Dear Users,
While i am doing QHA calculations I am not able to get mean
square displacements and in case.QHA.out file NaN values are coming in
F_vibration and entropy places. While running it is showing as below..
forrtl: severe (24): end-of-file during read, unit 5, file stdin
Image PC Routine Line
Source
Mean_square_displ 000000000047D58D Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 000000000047C095 Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 0000000000434CF0 Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 000000000040537F Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 0000000000404BB2 Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 000000000041A24C Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 0000000000401349 Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 00000000004011CC Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 0000000000488554 Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 00000000004010A1 Unknown Unknown Unknown
mv: cannot stat `Displacements': No such file or directory
equivalent atomic symbols are not found
forrtl: severe (24): end-of-file during read, unit 5, file stdin
Image PC Routine Line
Source
Mean_square_displ 000000000047D58D Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 000000000047C095 Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 0000000000434CF0 Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 000000000040537F Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 0000000000404BB2 Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 000000000041A24C Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 0000000000401349 Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 00000000004011CC Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 0000000000488554 Unknown Unknown Unknown
Mean_square_displ 00000000004010A1 Unknown Unknown Unknown
mv: cannot stat `Displacements': No such file or directory
ndiv from file === 343
ndiv=== 343
5.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
10.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
15.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
20.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
25.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
30.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
35.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
40.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
45.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
50.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
55.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
60.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
65.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
70.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
75.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
80.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
85.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
90.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
95.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
100.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
105.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
110.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
115.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
120.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
125.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
130.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
135.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
140.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
145.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
150.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
155.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
160.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
165.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
170.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
175.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
180.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
185.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
190.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
195.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
200.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
205.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
210.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
215.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
220.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
225.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
230.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
235.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
240.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
245.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
250.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
255.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
260.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
265.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
270.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
275.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
280.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
285.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
290.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
295.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
300.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
305.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
310.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
315.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
320.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
325.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
330.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
335.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
340.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
345.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
350.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
355.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
360.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
365.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
370.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
375.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
380.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
385.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
390.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
395.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
400.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
405.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
410.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
415.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
420.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
425.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
430.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
435.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
440.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
445.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
450.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
455.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
460.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
465.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
470.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
475.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
480.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
485.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
490.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
495.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
500.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
505.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
510.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
515.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
520.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
525.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
530.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
535.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
540.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
545.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
550.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
555.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
560.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
565.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
570.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
575.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
580.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
585.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
590.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
595.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
600.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
605.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
610.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
615.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
620.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
625.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
630.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
635.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
640.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
645.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
650.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
655.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
660.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
665.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
670.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
675.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
680.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
685.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
690.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
695.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
700.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
705.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
710.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
715.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
720.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
725.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
730.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
735.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
740.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
745.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
750.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
755.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
760.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
765.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
770.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
775.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
780.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
785.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
790.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
795.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
800.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
805.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
810.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
815.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
820.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
825.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
830.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
835.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
840.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
845.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
850.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
855.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
860.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
865.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
870.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
875.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
880.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
885.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
890.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
895.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
900.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
905.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
910.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
915.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
920.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
925.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
930.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
935.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
940.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
945.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
950.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
955.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
960.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
965.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
970.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
975.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
980.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
985.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
990.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
995.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
1000.00 12.04392410 0.00783003 NaN NaN
Phonon DOS and Quasiharmonic calculations have finished.
Now you can analyse these data using Gnuplot or xmgrace
Enjoy!
Can any one give solution to my problem...
thank you in advance....
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.quantum-espresso.org/pipermail/users/attachments/20130529/c7936d62/attachment.html>
More information about the users
mailing list