[Pw_forum] problem in parallel running

dev sharma decboy9 at gmail.com
Mon Aug 24 11:10:42 CEST 2009


Dear Sir,
 I am sending all the terminal commands to you. Please guide me.,

[devsharma at headnode ~]$ ls
espresso-4.0.2  pseudo  tmp  work
[devsharma at headnode ~]$ cd pseudo/
[devsharma at headnode pseudo]$ ls

0710.pdf                        Cr.pw91-sp-van.info
Li.pz-n-vbc.UPF                Pt.pw91-n-van.info
Ag.pbe-d-rrkjus.info            Cr.pw91-sp-van.UPF
Li.pz-s-mt.UPF                 Pt.pw91-n-van.UPF
Ag.pbe-d-rrkjus.UPF             Cs.pbe-mt_bw.info
Li.pz-s-van_ak.info
Pt.pz-nd-rrkjus.UPF
Ag.pz-d-rrkjus.UPF              Cs.pbe-mt_bw.UPF
Li.pz-s-van_ak.UPF             Pt.pz-rrkjus.UPF
Al.blyp-n-van_ak.info           C.tpss-mt.UPF
Mg.pw91-np-van.info
Pt.rel-pz-n-rrkjus.UPF
Al.blyp-n-van_ak.UPF            Cu.blyp-n-van_ak.info
Mg.pw91-np-van.UPF             Re.pw91-n-van.info
Al.bp-n-van_ak.info             Cu.blyp-n-van_ak.UPF
Mg.pz-bhs.UPF                  Re.pw91-n-van.UPF
Al.bp-n-van_ak.UPF              Cu.pbe-d-rrkjus.info
Mg.pz-n-vbc.info
Rh.pbe-nd-rrkjus.UPF
Al.pbe-n-van.info               Cu.pbe-d-rrkjus.UPF
Mg.pz-n-vbc.UPF                Rh.pbe-rrkjus.UPF
Al.pbe-n-van.UPF                Cu.pbe-n-van_ak.info
Mn.pbe-sp-van.info
Rh.pz-rrkjus.UPF
Al.pbe-rrkj.UPF                 Cu.pbe-n-van_ak.UPF
Mn.pbe-sp-van.UPF              Ru.pbe-n-van.info
Al.pw91-n-van.info              Cu.pw91-n-van_ak.info
Mo.pw91-n-van.info
Ru.pbe-n-van.UPF
Al.pw91-n-van.UPF               Cu.pw91-n-van_ak.UPF
Mo.pw91-n-van.UPF              Ru.pw91-n-van.info
Al.pz-vbc.UPF                   Cu.pz-d-rrkjus.UPF
Na.blyp-sp-van_ak.info         Ru.pw91-n-van.UPF
Ar.pz-rrkj.info                 Cu.pz-n-van_ak.info
Na.blyp-sp-van_ak.UPF          S.blyp-mt.info
Ar.pz-rrkj.UPF                  Cu.pz-n-van_ak.UPF
Na.bp-sp-van_ak.info
S.blyp-mt.UPF
As.pbe-n-van.info               Fe.blyp-sp-van_ak.info
Na.bp-sp-van_ak.UPF            S.blyp-van_ak.info
As.pbe-n-van.UPF                Fe.blyp-sp-van_ak.UPF
Na.pbe-n-mt_bw.info
S.blyp-van_ak.UPF
As.pw91-n-van.info              Fe.blyp-sp-van.info
Na.pbe-n-mt_bw.UPF             S.bp-van_ak.info
As.pw91-n-van.UPF               Fe.blyp-sp-van.UPF
Na.pbe-n-van.UPF               S.bp-van_ak.UPF
As.pz-bhs.info                  Fe.bp-sp-van_ak.info
Na.pbe-sp-van_ak.info          Sb.pw91-n-van.info
As.pz-bhs.UPF                   Fe.bp-sp-van_ak.UPF
Na.pbe-sp-van_ak.UPF           Sb.pw91-n-van.UPF
Au.blyp-van_ak.info             Fe.pbe-nd-rrkjus.UPF
Na.pw91-n-mt.UPF               Sb.pz-bhs.info
Au.blyp-van_ak.UPF              Fe.pbe-sp-van_ak.info
Na.pw91-n-van.UPF              Sb.pz-bhs.UPF
Au.bp-van_ak.info               Fe.pbe-sp-van_ak.UPF
Na.pw91-sp-van_ak.info         Sc.pbe-nsp-van.info
Au.bp-van_ak.UPF                Fe.pbe-sp-van.info
Na.pw91-sp-van_ak.UPF          Sc.pbe-nsp-van.UPF
Au.pbe-nd-rrkjus.UPF            Fe.pbe-sp-van_mit.info
Na.pz-n-vbc.info
Sc.pw91-nsp-van.info
Au.pbe-nd-van.info              Fe.pbe-sp-van_mit.UPF
Na.pz-n-vbc.UPF                Sc.pw91-nsp-van.UPF
Au.pbe-nd-van.UPF               Fe.pbe-sp-van.UPF
Na.pz-sp-van_ak.info
Se.pbe-van.info
Au.pbe-van_ak.info              Fe.pw91-sp-van_ak.info
Na.pz-sp-van_ak.UPF            Se.pbe-van.UPF
Au.pbe-van_ak.UPF               Fe.pw91-sp-van_ak.UPF
Nb.elastic_constant_tests.pdf  Se.pz-bhs.info
Au.pw91-d-van.UPF               Fe.pz-nd-rrkjus.UPF     N.blyp-mt.info
Se.pz-bhs.UPF
Au.pw91-van_ak.info             Fe.pz-sp-van_ak.info
N.blyp-mt.UPF                  Si.pbe-n-van.info
Au.pw91-van_ak.UPF              Fe.pz-sp-van_ak.UPF
N.blyp-van_ak.info
Si.pbe-n-van.UPF
Au.pz-d-rrkjus.UPF              filename.upf
N.blyp-van_ak.UPF              Si.pbe-rrkj.UPF
Au.pz-d-van.UPF                 F.pbe-n-van.info
Nb.pbe-nsp-van.info
Si.pw91-n-van.info
Au.pz-van_ak.info               F.pbe-n-van.UPF
Nb.pbe-nsp-van.UPF             Si.pw91-n-van.UPF
Au.pz-van_ak.UPF                F.pw91-n-van.info
N.bp-van_ak.info
Si.pz-vbc.UPF
Au.rel-pz-rrkjus.UPF            F.pw91-n-van.UPF
N.bp-van_ak.UPF                Si.tpss-mt.UPF
Ba.pbe-nsp-van.info             Ga.pbe-nsp-van.info
Nb.pw91-nsp-van.info
Sn.pw91-n-van.info
Ba.pbe-nsp-van.UPF              Ga.pbe-nsp-van.UPF
Nb.pw91-nsp-van.UPF            Sn.pw91-n-van.UPF
Ba.pw91-nsp-van.info            Ga.pw91-nsp-van.info
Nb.pz-sp-van.info
Sn.pz-bhs.info
Ba.pw91-nsp-van.UPF             Ga.pw91-nsp-van.UPF
Nb.pz-sp-van.UPF               Sn.pz-bhs.UPF
B.blyp-n-van_ak.info            Ga.pz-bhs.info
Ni.pbe-nd-rrkjus.UPF           S.pbe-van_bm.info
B.blyp-n-van_ak.UPF             Ga.pz-bhs.UPF
Ni.pz-nd-rrkjus.UPF            S.pbe-van_bm.UPF
B.bp-n-van_ak.info              Ge.pw91-n-van.info
N.pbe-rrkjus.UPF               S.pw91-n-mt.info
B.bp-n-van_ak.UPF               Ge.pw91-n-van.UPF
N.pbe-van_ak.info
S.pw91-n-mt.UPF
Be.pz-n-vbc.info                Ge.pz-bhs.info
N.pbe-van_ak.UPF               S.pw91-van_ak.info
Be.pz-n-vbc.UPF                 Ge.pz-bhs.UPF
N.pbe-van_bm.info
S.pw91-van_ak.UPF
Be.star1s-pz-n-vbc.UPF          Ge.tpss-n-mt.UPF
N.pbe-van_bm.UPF               S.pz-bhs.info
Bi.pbe-d-mt.info                H.blyp-van_ak.info
N.pw91-van_ak.info
S.pz-bhs.UPF
Bi.pbe-d-mt.UPF                 H.blyp-van_ak.UPF
N.pw91-van_ak.UPF              S.pz-van_ak.info
B.pbe-n-van_ak.info             H.blyp-vbc.info
N.pz-rrkjus.UPF                S.pz-van_ak.UPF
B.pbe-n-van_ak.UPF              H.blyp-vbc.UPF
N.pz-van_ak.info
Sr.pbe-nsp-van.info
B.pbe-n-van.info                H.bp-van_ak.info
N.pz-van_ak.UPF                Sr.pbe-nsp-van.UPF
B.pbe-n-van.UPF                 H.bp-van_ak.UPF         N.pz-vbc.info
Sr.pbe-sp-van.info
B.pw91-n-van_ak.info            He.pbe-mt_fhi.UPF
N.pz-vbc.UPF                   Sr.pbe-sp-van.UPF
B.pw91-n-van_ak.UPF             He.pz-mt_fhi.UPF        O.blyp-mt.info
Sr.pw91-nsp-van.info
B.pw91-n-van.info               H.pbe-rrkjus.UPF
O.blyp-mt.UPF                  Sr.pw91-nsp-van.UPF
B.pw91-n-van.UPF                H.pbe-van_ak.info
O.blyp-van_ak.info
Ta.pbe-nsp-van.info
B.pz-bhs.UPF                    H.pbe-van_ak.UPF
O.blyp-van_ak.UPF              Ta.pbe-nsp-van.UPF
B.pz-vbc.UPF                    H.pbe-van_bm.info
O.bp-van_ak.info
Ta.pw91-nsp-van.info
Br.pbe-van_mit.info             H.pbe-van_bm.UPF
O.bp-van_ak.UPF                Ta.pw91-nsp-van.UPF
Br.pbe-van_mit.UPF              H.pbe-vbc.UPF
O.pbe-mt.UPF                   Te.pbe-rrkj.UPF
Br.pw91-mt.info                 H.pw91-van_ak.info
O.pbe-rrkjus.UPF               Te.pz-bhs.info
Br.pw91-mt.UPF                  H.pw91-van_ak.UPF
O.pbe-van_ak.info
Te.pz-bhs.UPF
Br.pz-vbc.UPF                   H.pz-rrkjus.UPF
O.pbe-van_ak.UPF               Ti.blyp-sp-van_ak.info
Ca.pbe-nsp-van.info             H.pz-van_ak.info
O.pbe-van_bm.info
Ti.blyp-sp-van_ak.UPF
Ca.pbe-nsp-van.UPF              H.pz-van_ak.UPF
O.pbe-van_bm.UPF               Ti.bp-sp-van_ak.info
Ca.pw91-nsp-van.info            H.pz-vbc.UPF
O.pw91-van_ak.info
Ti.bp-sp-van_ak.UPF
Ca.pw91-nsp-van.UPF             H.tpss-mt.UPF
O.pw91-van_ak.UPF              Ti.pbe-sp-van_ak.info
Ca.pz-n-vbc.UPF                 In.pbe-d-rrkjus.info    O.pz-mt.info
Ti.pbe-sp-van_ak.UPF
C.blyp-mt.info                  In.pbe-d-rrkjus.UPF
O.pz-mt.UPF                    Ti.pw91-nsp-van.info
C.blyp-mt.UPF                   In.pz-bhs.info
O.pz-rrkjus.UPF                Ti.pw91-nsp-van.UPF
C.blyp-van_ak.info              In.pz-bhs.UPF
O.pz-van_ak.info
Ti.pw91-sp-van_ak.info
C.blyp-van_ak.UPF               In.pz-d-rrkjus.info
O.pz-van_ak.UPF                Ti.pw91-sp-van_ak.UPF
C.bp-van_ak.info                In.pz-d-rrkjus.UPF
O.rel-pz-rrkjus.UPF            Ti.pz-sp-van_ak.info
C.bp-van_ak.UPF                 In.pz-n-bhs.info
Os.pbe-n-van.info
Ti.pz-sp-van_ak.UPF
Cd.pbe-n-van.info               In.pz-n-bhs.UPF
Os.pbe-n-van.UPF               Ti.pz-sp-van.info
Cd.pbe-n-van.UPF                I.pbe-mt_bw.info
Os.pw91-n-van.info
Ti.pz-sp-van.UPF
Cd.pw91-n-van.info              I.pbe-mt_bw.UPF
Os.pw91-n-van.UPF              Tl.pz-d-van.info
Cd.pw91-n-van.UPF               Ir.pbe-n-rrkjus.info
O.tpss-mt.UPF                  Tl.pz-d-van.UPF
Ce4_ps_f1d1-pbe-rc1.0.uspp.UPF  Ir.pbe-n-rrkjus.UPF     P.blyp-mt.info
V.pbe-n-van.UPF
Cl.blyp-mt.info                 Ir.pbe-n-van.UPF
P.blyp-mt.UPF                  V.pbe-sp-van.UPF
Cl.blyp-mt.UPF                  Ir.pw91-n-van.UPF
P.blyp-van_ak.info
W.pbe-nsp-van.info
Cl.pbe-n-van.info               K.blyp-mt.info
P.blyp-van_ak.UPF              W.pbe-nsp-van.UPF
Cl.pbe-n-van.UPF                K.blyp-n-mt.UPF
Pb.pbe-d-van.info
W.pw91-nsp-van.info
Cl.pw91-mt.info                 K.pz-n-vbc.info
Pb.pbe-d-van.UPF               W.pw91-nsp-van.UPF
Cl.pw91-mt.UPF                  K.pz-n-vbc.UPF
P.bp-van_ak.info
W.pz-bhs.UPF
Cl.pz-bhs.info                  K.pz-sp-van.info
P.bp-van_ak.UPF                Xe.pw91-n-van.info
Cl.pz-bhs.UPF                   K.pz-sp-van.UPF
Pb.pz-bhs.UPF                  Xe.pw91-n-van.UPF
Co.pbe-nd-rrkjus.UPF            Kr.pw91-n-van.info
Pb.pz-d-van.info
Y.pbe-nsp-van.info
Co.pz-nd-rrkjus.UPF             Kr.pw91-n-van.UPF
Pb.pz-d-van.UPF                Y.pbe-nsp-van.UPF
Co.rel-pz-n-rrkjus.UPF          La.pbe-nsp-van.info
Pd.pbe-nd-rrkjus.UPF           Y.pw91-nsp-van.info
C.pbe-rrkjus.info               La.pbe-nsp-van.UPF
Pd.pbe-rrkjus.info
Y.pw91-nsp-van.UPF
C.pbe-rrkjus-test-diamond.pdf   La.pw91-nsp-van.info
Pd.pbe-rrkjus.UPF              Zn.blyp-van_ak.info
C.pbe-rrkjus-test-graphite.pdf  La.pw91-nsp-van.UPF
Pd.pz-nd-rrkjus.UPF            Zn.blyp-van_ak.UPF
C.pbe-rrkjus.UPF                Li.blyp-s-mt.UPF
Pd.pz-rrkjus.UPF               Zn.bp-van_ak.info
C.pbe-van_ak.info               Li.blyp-s-van_ak.info
P.pbe-n-van.info
Zn.bp-van_ak.UPF
C.pbe-van_ak.UPF                Li.blyp-s-van_ak.UPF
P.pbe-n-van.UPF                Zn.pbe-van.info
C.pbe-van_bm.info               Li.bp-s-mt.UPF
P.pbe-van_ak.info
Zn.pbe-van.UPF
C.pbe-van_bm.UPF                Li.bp-s-van_ak.info
P.pbe-van_ak.UPF               Zn.pw91-n-van.info
C.pw91-van_ak.info              Li.bp-s-van_ak.UPF
P.pw91-n-van.info
Zn.pw91-n-van.UPF
C.pw91-van_ak.UPF               Li.pbe-n-van.info
P.pw91-n-van.UPF               Zn.pw91-van_ak.info
C.pz-rrkjus.info                Li.pbe-n-van.UPF
P.pw91-van_ak.info
Zn.pw91-van_ak.UPF
C.pz-rrkjus.UPF                 Li.pbe-s-mt.UPF
P.pw91-van_ak.UPF              Zn.pz-van_ak.info
C.pz-van_ak.info                Li.pbe-s-van_ak.info    P.pz-bhs.info
Zn.pz-van_ak.UPF
C.pz-van_ak.UPF                 Li.pbe-s-van_ak.UPF
P.pz-bhs.UPF                   Zr.pbe-nsp-van.info
C.pz-vbc.info                   Li.pw91-n-van.info
P.pz-van_ak.info
Zr.pbe-nsp-van.UPF
C.pz-vbc.UPF                    Li.pw91-n-van.UPF
P.pz-van_ak.UPF                Zr.pw91-nsp-van.info
C.rel-pz-rrkjus.UPF             Li.pw91-s-mt.UPF
Pt.pbe-nd-rrkjus.UPF           Zr.pw91-nsp-van.UPF
Cr.pbe-sp-van.info              Li.pw91-s-van_ak.info
Pt.pbe-n-van.info
Zr.pw91-sp-rrkjus.info
Cr.pbe-sp-van.UPF               Li.pw91-s-van_ak.UPF
Pt.pbe-n-van.UPF               Zr.pw91-sp-rrkjus.UPF
[devsharma at headnode pseudo]$ vi Y.pbe-nsp-van.UPF
[devsharma at headnode pseudo]$ cd
[devsharma at headnode ~]$ cd work/yvo/
[devsharma at headnode yvo]$ ls
CRASH  scf.out  submit.sh  temp  yvo.inp
[devsharma at headnode yvo]$


On Mon, Aug 24, 2009 at 2:24 PM, Paolo Giannozzi <giannozz at democritos.it>wrote:

> dev sharma wrote:
>
> > Yes, /Y.pbe-nsp-van.UPF is present there in /home/devsharma/pseudo/.
>
> if the code says it isn't there, it isn't there. Remember that
> ALL processes must be able to access that file DURING PARALLEL
> EXECUTION
>
> P.
> --
> Paolo Giannozzi, Democritos and University of Udine, Italy
> _______________________________________________
> Pw_forum mailing list
> Pw_forum at pwscf.org
> http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum
>
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.quantum-espresso.org/pipermail/users/attachments/20090824/9d8306c8/attachment.html>


More information about the users mailing list