<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body>
    <p>Dear Kenan,</p>
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix">the Wannier Hamiltonian that you get 
      is a num_wann x num_wann matrix H_mn(R) which depends on an R
      vector, which means that the hopping connects orbital nin unit
      cell 0 to the orbital m in unit cell R (or exchange indices n,m,
      not sure).  In a supercell the same matrix would correspond to
      connceting primitive cells R' and R'+R (where R' runs over all
      10000 primitive cells in oyur supercell)</div>
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix">Such things are implemented, for
      instance , in pythTB <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.physics.rutgers.edu/pythtb/">http://www.physics.rutgers.edu/pythtb/</a>
      package, (which however may be very slow, but you may look to have
      an idea)</div>
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix">Also Wanniertools
      <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.wanniertools.com/">http://www.wanniertools.com/</a> may be useful.</div>
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix">Regards,</div>
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix">Stepan Tsirkin,</div>
    <div class="moz-cite-prefix">University of Zurich.</div>
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix">P.S. (I think it is a rule of this
      mailing list to specify your affiliation )<br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix">On 28.01.21 08:07, Kenan Song wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:CAMbJXZ_+0tSsboopaonHaWnUCbs5NK8fEGrptXg2nmfjWEBDMA@mail.gmail.com">
      <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=UTF-8">
      <div dir="ltr">
        <div>Dear All,</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>I extracted the wannier Hamiltonian for a 2D system after
          the wannierization is done. Now, I want to expand this wannier
          Hamiltonian to that for the supercell (e.g. 100 by 100) of the
          original 2D system.</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Can I just copy the wannier Hamiltonian of the original 2D
          system and paste it onto the diagonal part in the supercell
          Hamiltonian matrix 10000 times?</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>If so, would anyone please tell me how to deal with the
          off-diagonal part in the supercell Hamiltonian matrix?</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Would anyone please tell me how to account the hopping
          between different atoms in different neighbour unit cells?</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Would anyone please recommend some solutions or reference
          papers, discussing the expansion of the wannier Hamiltonian?<br>
        </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Thank you all very much in advance.</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Kind regards,</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Kenan Song<br>
        </div>
      </div>
      <br>
      <div>
        <hr></div>
      <font size="1" face="Arial">This message and its contents,
        including attachments are intended solely for the original
        recipient. If you are not the intended recipient or have
        received this message in error, please notify me immediately and
        delete this message from your computer system. Any unauthorized
        use or distribution is prohibited. Please consider the
        environment before printing this email.</font>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <pre class="moz-quote-pre" wrap="">_______________________________________________
Wannier mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Wannier@lists.quantum-espresso.org">Wannier@lists.quantum-espresso.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/wannier">https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/wannier</a>
</pre>
    </blockquote>
  </body>
</html>