[Wannier] TB hopping integral from Wannier90

Riemann Derakhshan riemann.derakhshan at gmail.com
Wed Oct 12 10:20:13 CEST 2016


Dear Users and developers,

I've done the wannier90 calculations for extracting TB parameters of
graphene as a toy example. I've put only P_z in each carbon atoms (Two P_z
orbitals in the unit cell).

I've done the calculations without any warning and error.  But now I have
two question about the output of Wannier90 package as listed below.

1. Real space hopping integrals and Onsite terms are stored in a
seedname_hr.dat file, what is the energy unit for this hopping and Onsite
values ( Ry or eV?)?

2. Since I've interested in the hopping and Onsite terms in the original
unit cell, I've found them in my seedname_hr.dat file as below:

    0    0    0    1    1   -1.662862    0.000000
    0    0    0    2    1   -2.796273    0.000000
    0    0    0    1    2   -2.796273    0.000000
    0    0    0    2    2   -1.662863    0.000000

now my question is this,  which of above rows corresponding to the Onsite
term and hopping between P_z orbitals (V_pp\pi)?

It would be a great help if You give me a detailed guidance about my
questions and I'll appreciate it. Herewith I've attached my QE and
Wannier90 input files.

Sincerely Yours
Riemann

====================================  SCF INPUT
=========================================================================
 &CONTROL
                 calculation = 'scf' ,
                  wf_collect = .true. ,
                      outdir = './' ,
                  pseudo_dir = './' ,
                      prefix = 'calc' ,
                   verbosity = 'high' ,
                     tstress = .true. ,
                     tprnfor = .true. ,
 /
 &SYSTEM
                       ibrav = 4,
                   celldm(1) = 4.6509939378d0,
                   celldm(3) = 8.1261173411d0,
                         nat = 2,
                        ntyp = 1,
                   input_dft = 'PBE',
                     ecutwfc = 60.0d0 ,
                 occupations = 'smearing' ,
                     degauss = 0.002000d0 ,
                    smearing = 'gaussian' ,
 /
 &ELECTRONS
                    conv_thr = 1.0e-8,
                 mixing_mode = 'plain' ,
                 mixing_beta = 0.200d0 ,
             diagonalization = 'david' ,
 /
ATOMIC_SPECIES
    C   12.01070  C.rel-pbe-nc.UPF
ATOMIC_POSITIONS {alat}
  C    0.0000000000d0   0.0000000000d0   4.0630586706d0
  C    0.5000000000d0   0.2886751346d0   4.0630586706d0
K_POINTS automatic
  12 12 1   0 0 0

========================================   NSCF INPUT
=================================================================

 &CONTROL
                 calculation = 'nscf' ,
                  wf_collect = .true. ,
                      outdir = './' ,
                  pseudo_dir = './' ,
                      prefix = 'calc' ,
                   verbosity = 'high' ,
                     tstress = .true. ,
                     tprnfor = .true. ,
 /
 &SYSTEM
                       ibrav = 4,
                   celldm(1) = 4.6509939378d0,
                   celldm(3) = 8.1261173411d0,
                         nat = 2,
                        ntyp = 1,
                        nbnd = 20,
                   input_dft = 'PBE',
                     ecutwfc = 60.0d0 ,
                 occupations = 'smearing' ,
                     degauss = 0.002000d0 ,
                    smearing = 'gaussian' ,
 /
 &ELECTRONS
                    conv_thr = 1.0e-8,
                 mixing_mode = 'plain' ,
                 mixing_beta = 0.200d0 ,
             diagonalization = 'david' ,
 /
ATOMIC_SPECIES
    C   12.01070  C.rel-pbe-nc.UPF
ATOMIC_POSITIONS {alat}
  C    0.0000000000d0   0.0000000000d0   4.0630586706d0
  C    0.5000000000d0   0.2886751346d0   4.0630586706d0
K_POINTS crystal
144
  0.00000000  0.00000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.00000000  0.08333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.00000000  0.16666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.00000000  0.25000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.00000000  0.33333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.00000000  0.41666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.00000000  0.50000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.00000000  0.58333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.00000000  0.66666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.00000000  0.75000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.00000000  0.83333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.00000000  0.91666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.08333333  0.00000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.08333333  0.08333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.08333333  0.16666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.08333333  0.25000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.08333333  0.33333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.08333333  0.41666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.08333333  0.50000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.08333333  0.58333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.08333333  0.66666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.08333333  0.75000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.08333333  0.83333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.08333333  0.91666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.16666667  0.00000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.16666667  0.08333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.16666667  0.16666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.16666667  0.25000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.16666667  0.33333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.16666667  0.41666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.16666667  0.50000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.16666667  0.58333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.16666667  0.66666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.16666667  0.75000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.16666667  0.83333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.16666667  0.91666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.25000000  0.00000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.25000000  0.08333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.25000000  0.16666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.25000000  0.25000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.25000000  0.33333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.25000000  0.41666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.25000000  0.50000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.25000000  0.58333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.25000000  0.66666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.25000000  0.75000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.25000000  0.83333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.25000000  0.91666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.33333333  0.00000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.33333333  0.08333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.33333333  0.16666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.33333333  0.25000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.33333333  0.33333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.33333333  0.41666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.33333333  0.50000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.33333333  0.58333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.33333333  0.66666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.33333333  0.75000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.33333333  0.83333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.33333333  0.91666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.41666667  0.00000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.41666667  0.08333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.41666667  0.16666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.41666667  0.25000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.41666667  0.33333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.41666667  0.41666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.41666667  0.50000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.41666667  0.58333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.41666667  0.66666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.41666667  0.75000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.41666667  0.83333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.41666667  0.91666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.50000000  0.00000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.50000000  0.08333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.50000000  0.16666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.50000000  0.25000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.50000000  0.33333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.50000000  0.41666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.50000000  0.50000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.50000000  0.58333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.50000000  0.66666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.50000000  0.75000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.50000000  0.83333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.50000000  0.91666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.58333333  0.00000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.58333333  0.08333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.58333333  0.16666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.58333333  0.25000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.58333333  0.33333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.58333333  0.41666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.58333333  0.50000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.58333333  0.58333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.58333333  0.66666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.58333333  0.75000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.58333333  0.83333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.58333333  0.91666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.66666667  0.00000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.66666667  0.08333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.66666667  0.16666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.66666667  0.25000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.66666667  0.33333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.66666667  0.41666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.66666667  0.50000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.66666667  0.58333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.66666667  0.66666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.66666667  0.75000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.66666667  0.83333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.66666667  0.91666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.75000000  0.00000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.75000000  0.08333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.75000000  0.16666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.75000000  0.25000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.75000000  0.33333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.75000000  0.41666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.75000000  0.50000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.75000000  0.58333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.75000000  0.66666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.75000000  0.75000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.75000000  0.83333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.75000000  0.91666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.83333333  0.00000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.83333333  0.08333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.83333333  0.16666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.83333333  0.25000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.83333333  0.33333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.83333333  0.41666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.83333333  0.50000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.83333333  0.58333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.83333333  0.66666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.83333333  0.75000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.83333333  0.83333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.83333333  0.91666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.91666667  0.00000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.91666667  0.08333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.91666667  0.16666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.91666667  0.25000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.91666667  0.33333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.91666667  0.41666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.91666667  0.50000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.91666667  0.58333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.91666667  0.66666667  0.00000000  6.944444e-03
  0.91666667  0.75000000  0.00000000  6.944444e-03
  0.91666667  0.83333333  0.00000000  6.944444e-03
  0.91666667  0.91666667  0.00000000  6.944444e-03

========================================    .Win INPUT
 =================================================================
num_bands         =   20
num_wann          =   2
num_iter             =   200


hr_plot = .true.
bands_plot = true

begin kpoint_path
G 0.0000000000     0.0000000000     0.0000000000  M 0.5000000000
0.0000000000     0.0000000000
M 0.5000000000     0.0000000000     0.0000000000  K 0.3333333333
0.3333333333     0.0000000000
K 0.3333333333     0.3333333333     0.0000000000  G 0.0000000000
0.0000000000     0.0000000000
end kpoint_path

Begin Atoms_Frac
C1  0.0000000  0.0000000  0.5000000
C2  0.6666667  0.3333333  0.5000000
End Atoms_Frac

Begin Projections
C1:pz
C2:pz
End Projections

Begin Unit_Cell_Cart
bohr
 4.650993937800000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
-2.325496968900000E+000  4.027878902982507E+000  0.000000000000000E+000
 0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  3.779452249130756E+001
End Unit_Cell_Cart

mp_grid      = 12 12 1

begin kpoints
  0.00000000  0.00000000  0.00000000
  0.00000000  0.08333333  0.00000000
  0.00000000  0.16666667  0.00000000
  0.00000000  0.25000000  0.00000000
  0.00000000  0.33333333  0.00000000
  0.00000000  0.41666667  0.00000000
  0.00000000  0.50000000  0.00000000
  0.00000000  0.58333333  0.00000000
  0.00000000  0.66666667  0.00000000
  0.00000000  0.75000000  0.00000000
  0.00000000  0.83333333  0.00000000
  0.00000000  0.91666667  0.00000000
  0.08333333  0.00000000  0.00000000
  0.08333333  0.08333333  0.00000000
  0.08333333  0.16666667  0.00000000
  0.08333333  0.25000000  0.00000000
  0.08333333  0.33333333  0.00000000
  0.08333333  0.41666667  0.00000000
  0.08333333  0.50000000  0.00000000
  0.08333333  0.58333333  0.00000000
  0.08333333  0.66666667  0.00000000
  0.08333333  0.75000000  0.00000000
  0.08333333  0.83333333  0.00000000
  0.08333333  0.91666667  0.00000000
  0.16666667  0.00000000  0.00000000
  0.16666667  0.08333333  0.00000000
  0.16666667  0.16666667  0.00000000
  0.16666667  0.25000000  0.00000000
  0.16666667  0.33333333  0.00000000
  0.16666667  0.41666667  0.00000000
  0.16666667  0.50000000  0.00000000
  0.16666667  0.58333333  0.00000000
  0.16666667  0.66666667  0.00000000
  0.16666667  0.75000000  0.00000000
  0.16666667  0.83333333  0.00000000
  0.16666667  0.91666667  0.00000000
  0.25000000  0.00000000  0.00000000
  0.25000000  0.08333333  0.00000000
  0.25000000  0.16666667  0.00000000
  0.25000000  0.25000000  0.00000000
  0.25000000  0.33333333  0.00000000
  0.25000000  0.41666667  0.00000000
  0.25000000  0.50000000  0.00000000
  0.25000000  0.58333333  0.00000000
  0.25000000  0.66666667  0.00000000
  0.25000000  0.75000000  0.00000000
  0.25000000  0.83333333  0.00000000
  0.25000000  0.91666667  0.00000000
  0.33333333  0.00000000  0.00000000
  0.33333333  0.08333333  0.00000000
  0.33333333  0.16666667  0.00000000
  0.33333333  0.25000000  0.00000000
  0.33333333  0.33333333  0.00000000
  0.33333333  0.41666667  0.00000000
  0.33333333  0.50000000  0.00000000
  0.33333333  0.58333333  0.00000000
  0.33333333  0.66666667  0.00000000
  0.33333333  0.75000000  0.00000000
  0.33333333  0.83333333  0.00000000
  0.33333333  0.91666667  0.00000000
  0.41666667  0.00000000  0.00000000
  0.41666667  0.08333333  0.00000000
  0.41666667  0.16666667  0.00000000
  0.41666667  0.25000000  0.00000000
  0.41666667  0.33333333  0.00000000
  0.41666667  0.41666667  0.00000000
  0.41666667  0.50000000  0.00000000
  0.41666667  0.58333333  0.00000000
  0.41666667  0.66666667  0.00000000
  0.41666667  0.75000000  0.00000000
  0.41666667  0.83333333  0.00000000
  0.41666667  0.91666667  0.00000000
  0.50000000  0.00000000  0.00000000
  0.50000000  0.08333333  0.00000000
  0.50000000  0.16666667  0.00000000
  0.50000000  0.25000000  0.00000000
  0.50000000  0.33333333  0.00000000
  0.50000000  0.41666667  0.00000000
  0.50000000  0.50000000  0.00000000
  0.50000000  0.58333333  0.00000000
  0.50000000  0.66666667  0.00000000
  0.50000000  0.75000000  0.00000000
  0.50000000  0.83333333  0.00000000
  0.50000000  0.91666667  0.00000000
  0.58333333  0.00000000  0.00000000
  0.58333333  0.08333333  0.00000000
  0.58333333  0.16666667  0.00000000
  0.58333333  0.25000000  0.00000000
  0.58333333  0.33333333  0.00000000
  0.58333333  0.41666667  0.00000000
  0.58333333  0.50000000  0.00000000
  0.58333333  0.58333333  0.00000000
  0.58333333  0.66666667  0.00000000
  0.58333333  0.75000000  0.00000000
  0.58333333  0.83333333  0.00000000
  0.58333333  0.91666667  0.00000000
  0.66666667  0.00000000  0.00000000
  0.66666667  0.08333333  0.00000000
  0.66666667  0.16666667  0.00000000
  0.66666667  0.25000000  0.00000000
  0.66666667  0.33333333  0.00000000
  0.66666667  0.41666667  0.00000000
  0.66666667  0.50000000  0.00000000
  0.66666667  0.58333333  0.00000000
  0.66666667  0.66666667  0.00000000
  0.66666667  0.75000000  0.00000000
  0.66666667  0.83333333  0.00000000
  0.66666667  0.91666667  0.00000000
  0.75000000  0.00000000  0.00000000
  0.75000000  0.08333333  0.00000000
  0.75000000  0.16666667  0.00000000
  0.75000000  0.25000000  0.00000000
  0.75000000  0.33333333  0.00000000
  0.75000000  0.41666667  0.00000000
  0.75000000  0.50000000  0.00000000
  0.75000000  0.58333333  0.00000000
  0.75000000  0.66666667  0.00000000
  0.75000000  0.75000000  0.00000000
  0.75000000  0.83333333  0.00000000
  0.75000000  0.91666667  0.00000000
  0.83333333  0.00000000  0.00000000
  0.83333333  0.08333333  0.00000000
  0.83333333  0.16666667  0.00000000
  0.83333333  0.25000000  0.00000000
  0.83333333  0.33333333  0.00000000
  0.83333333  0.41666667  0.00000000
  0.83333333  0.50000000  0.00000000
  0.83333333  0.58333333  0.00000000
  0.83333333  0.66666667  0.00000000
  0.83333333  0.75000000  0.00000000
  0.83333333  0.83333333  0.00000000
  0.83333333  0.91666667  0.00000000
  0.91666667  0.00000000  0.00000000
  0.91666667  0.08333333  0.00000000
  0.91666667  0.16666667  0.00000000
  0.91666667  0.25000000  0.00000000
  0.91666667  0.33333333  0.00000000
  0.91666667  0.41666667  0.00000000
  0.91666667  0.50000000  0.00000000
  0.91666667  0.58333333  0.00000000
  0.91666667  0.66666667  0.00000000
  0.91666667  0.75000000  0.00000000
  0.91666667  0.83333333  0.00000000
  0.91666667  0.91666667  0.00000000
End Kpoints

-- 
PhD. student of Physics
Physics Department of Damghan University
Tel : +98 938 903 6759
P.O.Box:36716-41167
Damghan, Iran



 Sent with Mailtrack
<https://mailtrack.io/install?source=signature&lang=en&referral=riemann.derakhshan@gmail.com&idSignature=22>
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.quantum-espresso.org/pipermail/wannier/attachments/20161012/125e7e6f/attachment.html>


More information about the Wannier mailing list