
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-2">

<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>

</head>

<body dir="ltr">

<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">

<p>Dear QE users,</p>

<p><br>

</p>

<p>I'm performing calculations on organic molecular crystal structures using pw.x. For organic molecular structures, it is quite common that a part of a molecule is positioned across a boundary of two neighboring cells (meaning not all atoms are positioned

 inside the basic cell). When I use pw.x (doing SCF calculations), the atoms that do not lie inside the basic cell are automatically re-positioned so that they do lie inside the basic cell (I came to this conclusion by analyzing the pw.x output file). As a

 result, the molecules of the structure get cut into pieces. I wasn't sure if this had to do with the symmetry specification - I tried to specify symmetry using either the "space_group" keyword or using "ibrav = 0", but I ended with the same result for either

 approach.<br>

<br>

This is a little bit troublesome for me, because I later use the SCF results to plot the charge density using pp.x and I would very much like if the molecules were preserved. If I understand correctly, I could potentially fix this by editing the pp.x output

 manually, however, is there another way to bypass this problem? The version I'm using is "<span>PWSCF v.6.4.1</span>".<br>

<br>

Thank you for any recommendations.<br>

<br>

Sincerely,</p>

<p>F.Fòukal</p>

<p>UCT Prague</p>

</div>

</body>

</html>