<div dir="ltr"><div><p>Hi,</p><p>I am currently working on plotting the phonon dispersion for gold (Au). When using a unit cell with a single atom, I was able to generate the dispersion easily by following the steps: <code>pw.x</code>, <code>ph.x</code>, <code>q2r.x</code>, and <code>matdyn.x</code>. However, when I used a 3x3x3 supercell containing 27 atoms, the calculation became significantly slower during the <code>ph.x</code> step. Additionally, I cannot take advantage of symmetry to simplify the calculations because the atomic positions I am using are temperature-dependent and not in equilibrium, meaning the symmetry conditions are not obeyed.</p><p>To provide some context, I ran the <code>ph.x</code> calculation on 2 nodes with 32 CPUs each (a total of 64 processors). Despite this setup, the computation time is still extremely long. I am sharing the input and output details of my calculations and would greatly appreciate any advice or suggestions on how to optimize and accelerate the process.</p></div><div><br></div><div>pw.x (input)</div><div><br></div><div><img src="cid:ii_m6b8vds81" alt="image.png" width="310" height="402" class="gmail-CToWUd gmail-a6T" tabindex="0" style="cursor: pointer; outline: 0px;"><br></div><div><br></div><div>ph.x (input)</div><div><img src="cid:ii_m6b8w08c2" alt="image.png" width="211" height="179" class="gmail-CToWUd"><br></div><div><br></div><div>HPC setup:</div><div><i>nodes=2</i></div><div><i>ntaskes-per-node=32</i></div><div><i>cpus-per-task=1</i></div><div><i>mem-per-cpu=20gb</i></div><div><i>time=360:00:00</i></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div>And ph.out is attached herewith.</div><div><br></div><div>Thank you</div><div><br></div><div>Best Regards</div><font color="#888888"><div>Md Jahid Hasan Sagor</div><div>PhD student, Mechanical Engineering</div><div>University of Maine</div></font></div>