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<body dir="ltr">
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 11pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Hello</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 11pt; color: rgb(0, 0, 0);">
The compiler complains about a failure to read the hdf5.mod file that the hdf5 library provides.  </div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 11pt; color: rgb(0, 0, 0);">
There's probably been some unnoticed problem when they installed it, and the Fortran support is not working.</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 11pt; color: rgb(0, 0, 0);">
You could reinstall it and check that the compilation was successful. It's pretty easy and quick to do. </div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 11pt; color: rgb(0, 0, 0);">
I hope it helps.</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 11pt; color: rgb(0, 0, 0);">
best regards</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 11pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Pietro</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 11pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div id="appendonsend"></div>
<hr style="display:inline-block;width:98%" tabindex="-1">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" style="font-size:11pt" color="#000000"><b>From:</b> users <users-bounces@lists.quantum-espresso.org> on behalf of Vahid Askarpour <vh261281@dal.ca><br>
<b>Sent:</b> Wednesday, December 18, 2024 00:15<br>
<b>To:</b> Quantum ESPRESSO users Forum <users@lists.quantum-espresso.org><br>
<b>Subject:</b> [QE-users] Compilation error with QE-7.3.1+hdf5</font>
<div> </div>
</div>
<div class="BodyFragment"><font size="2"><span style="font-size:11pt;">
<div class="PlainText">Dear QE Community,<br>
<br>
With gcc/12.3, openmpi/4.1.5, mkl, and hdf5 modules loaded, I configure QE-7.3.1 with<br>
<br>
./configure --prefix=/home/vaskarpo/bin/qe-7.3.1 --with-hdf5=yes --with-hdf5-libs='-L/cvmfs/soft.computecanada.ca/easybuild/software/2023/x86-64-v4/Compiler/intel2023/hdf5/1.14.2/lib -lhdf5 -lhdf5_fortran' --with-hdf5-include=/cvmfs/soft.computecanada.ca/easybuild/software/2023/x86-64-v4/Compiler/intel2023/hdf5/1.14.2/include<br>
<br>
When executing “make pw”, I get the following error:<br>
<br>
mpif90 -O3 -g -fallow-argument-mismatch -cpp -D__DFTI -D__MPI -D__SCALAPACK -D__HDF5_SERIAL -D__HDF5  -I/home/vaskarpo/bin/qe-7.3.1//external/devxlib/src -I. -I/home/vaskarpo/bin/qe-7.3.1//include -I/cvmfs/soft.computecanada.ca/easybuild/software/2023/x86-64-v3/Core/imkl/2023.2.0/mkl/2023.2.0/include
 -I/cvmfs/soft.computecanada.ca/easybuild/software/2023/x86-64-v4/Compiler/intel2023/hdf5/1.14.2/include -I/home/vaskarpo/bin/qe-7.3.1//upflib -I/home/vaskarpo/bin/qe-7.3.1//XClib -I/home/vaskarpo/bin/qe-7.3.1//Modules -I/home/vaskarpo/bin/qe-7.3.1//FFTXlib/src
 -I/home/vaskarpo/bin/qe-7.3.1//LAXlib -I/home/vaskarpo/bin/qe-7.3.1//UtilXlib -I/home/vaskarpo/bin/qe-7.3.1//MBD -I/home/vaskarpo/bin/qe-7.3.1//KS_Solvers  -c qeh5_module.f90<br>
f951: Fatal Error: Reading module ‘/cvmfs/soft.computecanada.ca/easybuild/software/2023/x86-64-v4/Compiler/intel2023/hdf5/1.14.2/include/hdf5.mod’ at line 1 column 2: Unexpected EOF<br>
compilation terminated.<br>
make[1]: *** [../make.inc:16: qeh5_module.o] Error 1<br>
make[1]: Leaving directory '/home/vaskarpo/bin/qe-7.3.1/Modules'<br>
make: *** [Makefile:194: mods] Error 1<br>
<br>
Is this a bug or an error on my part?<br>
<br>
Thanks,<br>
Vahid<br>
<br>
Vahid Askarpour<br>
Department of Physics and Atmospheric Science<br>
Dalhousie University<br>
Halifax, NS, CANADA<br>
_______________________________________________________________________________<br>
The Quantum ESPRESSO Foundation stands in solidarity with all civilians worldwide who are victims of terrorism, military aggression, and indiscriminate warfare.<br>
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