<div dir="ltr"><div><b>Hi Dear QE experts,</b></div><div><b><br></b></div><div><b>I ran a job file of silicon (4*4*4) supercell (total 128 atoms) and ended up with the following error.</b></div><div><br></div><div>Abort(336148997) on node 40 (rank 40 in comm 0): Fatal error in PMPI_Comm_free: Invalid communicator, error stack:<br>PMPI_Comm_free(137): MPI_Comm_free(comm=0x7ffc4cef5528) failed<br>PMPI_Comm_free(85).: Null communicator<br>Abort(940128773) on node 44 (rank 44 in comm 0): Fatal error in PMPI_Comm_free: Invalid communicator, error stack:<br>PMPI_Comm_free(137): MPI_Comm_free(comm=0x7ffd12d17fa8) failed<br>PMPI_Comm_free(85).: Null communicator<br>Abort(940128773) on node 56 (rank 56 in comm 0): Fatal error in PMPI_Comm_free: Invalid communicator, error stack:<br>PMPI_Comm_free(137): MPI_Comm_free(comm=0x7fff2e304428) failed<br>PMPI_Comm_free(85).: Null communicator<br>slurmstepd: error: *** STEP 1982493.0 ON node-146 CANCELLED AT 2024-07-22T12:49:17 ***<br>srun: Job step aborted: Waiting up to 32 seconds for job step to finish.<br>srun: error: node-149: tasks 48-71: Killed<br>srun: error: node-146: tasks 0-23: Killed<br>srun: error: node-147: tasks 24-47: Killed</div><div><br></div><div><b>Here is my job file. I have also attached the input file <a href="http://si.scf.in">si.scf.in</a> for your kind perusal. </b><br></div><div><br></div><div><br></div><div>#!/usr/bin/env bash<br>#SBATCH --job-name=hasanjob<br>#SBATCH --nodes=3                       # node count<br>#SBATCH --ntasks-per-node=24         # number of tasks per node<br>#SBATCH --cpus-per-task=1           # cpu-cores per task (>1 if multi-threaded tasks)<br>#SBATCH --mem-per-cpu=5gb                    # Job memory request<br>#SBATCH --time=120:00:00               # Time limit hrs:min:sec<br>#SBATCH --output=sdc_save.txt              # Standard output and error log<br>#SBATCH --partition=skylake           # MOAB/Torque called these queues<br></div><div><br></div><div>module unload mvapich2<br>module load mvapich2-intel/2.3.5<br>module load quantum-espresso<br>srun pw.x < <a href="http://si.scf.in">si.scf.in</a> > si.scf.out<br></div><div><br></div><div><br></div><div><b>Would you please help me to solve the problem? I have opened the structure in xcrysden and it looks fine to me.</b></div><div><br></div><div><br></div><div>Best</div><div>Md Jahid Hasan</div><div>PhD student</div><div>Mechanical Engineering</div><div>University of Maine<br></div><div><br><br></div></div>