<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=windows-1256">
</head>
<body style="overflow-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;">
Any reason why ATOMIC POSITIONS are specified with crystal_b instead of crystal?
<div><br>
</div>
<div>Cheers,</div>
<div>Vahid<br>
<div><br>
<blockquote type="cite">
<div>On Apr 10, 2024, at 5:47 PM, Gal Cohen <galao@post.bgu.ac.il> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div>
<div><!-- START CAUTION Box Code -->
<table align="center" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="padding:10px 0 10px 0" width="100%">
<tbody>
<tr>
<td style="line-height:0px;font-size:0px;mso-line-height-rule:exactly;">
<table align="center" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="background:#707372;background-color:#707372;width:100%;border-radius:5px;overflow:hidden;">
<tbody>
<tr>
<td style="border-top:solid 8px #fbe122;padding:4px 8px;text-align:left;vertical-align:top;">
<table role="presentation" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
<tbody>
<tr>
<td align="left">
<div style="font-family:Arial,sans-serif;font-size:12px;line-height:16px;text-align:left;color:#ffffff;">
<span style="font-weight:bold;font-size:12px;">CAUTION:</span> The Sender of this email is not from within Dalhousie.</div>
</td>
</tr>
</tbody>
</table>
</td>
</tr>
</tbody>
</table>
</td>
</tr>
</tbody>
</table>
<!-- END CAUTION Box Code -->
<div>
<div dir="rtl">
<div dir="ltr">Dear QE users i try to run the scf calculation I provide below the program starts and then fails without outputting error list message aside mpi-abort on terminal.</div>
<div dir="ltr"><br>
</div>
<div dir="ltr"><u>The last lines in the output file:</u></div>
<div dir="ltr"><br>
     Estimated max dynamical RAM per process >       8.68 GB<br>
<br>
     Estimated total dynamical RAM >     138.87 GB</div>
<div dir="ltr"><u>The error message in the terminal:</u><br>
</div>
<div dir="ltr">Abort(15) on node 0 (rank 0 in comm 0): application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 15) - process 0</div>
<div dir="ltr"><br>
</div>
<div dir="ltr">  my version of qe is 7.3.1 compiled via make as per in the instructions on github other input files that doesn't contain La manage to run successfully, trying to change the cell size did not produce other outcome.</div>
<div dir="ltr">Any insight or help would be grateful.</div>
<div dir="ltr"><br>
</div>
<div dir="ltr">Best regards <br>
</div>
<div dir="ltr">Gal Cohen <br>
</div>
<div dir="ltr"><br>
</div>
<div dir="ltr">p.s <br>
</div>
<div dir="ltr">here is my input file<br>
</div>
<div dir="ltr">&control<br>
   calculation = 'scf'<br>
   restart_mode='from_scratch'<br>
   prefix = 'LaPtBi'<br>
   outdir = './outdir'<br>
   pseudo_dir = '/home/muntaser/Qe_calculations/LaPtBi'<br>
/<br>
&system<br>
   ibrav = 3 , a = 20.35, b = 20.35 , c = 20.35 ,<br>
   ecutwfc = 40 ,<br>
   ecutrho = 370 ,<br>
   occupations = 'smearing' ,<br>
   smearing = 'gaussian' ,<br>
   degauss = 0.02 ,<br>
   lspinorb=.true.,<br>
   noncolin=.true.,<br>
   nat = 40 , <br>
   ntyp = 3 , <br>
   nbnd = 500 ,<br>
/<br>
&electrons<br>
   conv_thr = 1.0d-10 ,<br>
   diagonalization = 'david' ,<br>
   mixing_mode = 'plain' ,<br>
   startingpot = 'atomic' ,<br>
   startingwfc = 'atomic+random' ,<br>
   mixing_beta = 0.6 ,<br>
/<br>
ATOMIC_SPECIES<br>
   La 138.90547 La.rel-pbe-spfn-kjpaw_psl.1.0.0.UPF<br>
   Pt 195.08400 Pt.rel-pbe-n-kjpaw_psl.1.0.0.UPF<br>
   Bi 208.98040 Bi.rel-pbe-dn-kjpaw_psl.1.0.0.UPF<br>
ATOMIC_POSITIONS crystal_b<br>
   La 0.12500 0.00000 0.75000<br>
   La 0.00000 0.25000 0.37500<br>
   La 0.00000 0.75000 0.12500<br>
   La 0.37500 1.00000 0.25000<br>
   La 0.25000 0.62500 0.50000<br>
   La 0.25000 0.37500 0.00000<br>
   La 0.50000 0.25000 0.62500<br>
   La 0.62500 0.50000 0.25000<br>
   La 0.50000 0.75000 0.87500<br>
   La 0.75000 0.87500 0.50000<br>
   La 0.87500 0.50000 0.75000<br>
   La 0.75000 0.12500 0.00000<br>
   Pt 0.00000 0.25000 0.87500<br>
   Pt 0.00000 0.75000 0.62500<br>
   Pt 0.25000 0.87500 0.00000<br>
   Pt 0.12500 0.50000 0.25000 <br>
   Pt 0.25000 0.12500 0.50000<br>
   Pt 0.37500 0.50000 0.75000<br>
   Pt 0.50000 0.75000 0.37500<br>
   Pt 0.50000 0.25000 0.12500<br>
   Pt 0.62500 0.00000 0.75000<br>
   Pt 0.75000 0.62500 0.00000 <br>
   Pt 0.75000 0.37500 0.50000<br>
   Pt 0.87500 0.00000 0.25000<br>
   Bi 0.08400 0.91600 0.41600<br>
   Bi 0.08400 0.08400 0.08400 <br>
   Bi 0.16600 0.66600 0.83400<br>
   Bi 0.16600 0.33400 0.66600<br>
   Bi 0.41600 0.91600 0.58400<br>
   Bi 0.33400 0.66600 0.16600<br>
   Bi 0.33400 0.33400 0.33400<br>
   Bi 0.41600 0.08400 0.91600 <br>
   Bi 0.66600 0.83400 0.16600<br>
   Bi 0.58400 0.58400 0.58400<br>
   Bi 0.58400 0.41600 0.91600<br>
   Bi 0.66600 0.16600 0.33400 <br>
   Bi 0.83400 0.83400 0.83400<br>
   Bi 0.91600 0.58400 0.41600<br>
   Bi 0.91600 0.41600 0.08400<br>
   Bi 0.83400 0.16600 0.66600<br>
K_POINTS automatic<br>
   3 3 3 0 0 0</div>
</div>
</div>
</div>
_______________________________________________<br>
The Quantum ESPRESSO community stands by the Ukrainian<br>
people and expresses its concerns about the devastating<br>
effects that the Russian military offensive has on their<br>
country and on the free and peaceful scientific, cultural,<br>
and economic cooperation amongst peoples<br>
_______________________________________________<br>
Quantum ESPRESSO is supported by MaX (www.max-centre.eu)<br>
users mailing list users@lists.quantum-espresso.org<br>
https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</body>
</html>