<html xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
{font-family:"Cambria Math";
panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
{font-family:Calibri;
panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
{margin:0in;
font-size:11.0pt;
font-family:"Calibri",sans-serif;
mso-ligatures:standardcontextual;}
span.EmailStyle17
{mso-style-type:personal-compose;
font-family:"Calibri",sans-serif;
color:windowtext;}
.MsoChpDefault
{mso-style-type:export-only;}
@page WordSection1
{size:8.5in 11.0in;
margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
{page:WordSection1;}
--></style>
</head>
<body lang="EN-US" link="#0563C1" vlink="#954F72" style="word-wrap:break-word">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">I am getting an error message: <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Abort(1) on node 0 (rank 0 in comm 0): application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">This happens when I try to run the full graphene file, as well as a single carbon atom, so possibly there’s a problem with my input file? My input file (graphene.in) is as follows (I commented out the pseudo_dir and just put a copy of C.rel-pbesol-n-rrkus_psl.0.1.UPF
in the directory I’m running from): <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">&control<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> calculation='scf'<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> prefix='graphene'<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> outdir='./tmp'<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">! pseudo_dir='/work/fqy302/pseudos'<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> verbosity='high'<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">/<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&system<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> ibrav=4<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> celldm(1)=4.663<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> celldm(3)=20.0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> nat=2<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> ntyp=1<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> ecutwfc=40.0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> ecutrho=320.0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> occupations='smearing'<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> smearing='gaussian'<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> degauss=0.02<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">/<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&electrons<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> conv_thr=1.0d-8<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> mixing_beta=0.7<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">/<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">ATOMIC_SPECIES<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C 12.0107 C.rel-pbesol-n-rrkus_psl.0.1.UPF<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">ATOMIC_POSITIONS (angstrom)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C 1.2124 0.7000 3.54 <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C 0.0000 1.4000 3.54<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C -1.2124 0.7000 3.54<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C -1.2124 -0.7000 3.54<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C 0.0000 -1.4000 3.54<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C 1.2124 -0.7000 3.54<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C 3.7124 0.7100 3.54<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C 2.5000 1.4000 3.54<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C 2.5000 -1.4000 3.54<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C 3.7124 -0.7100 3.54<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C 0.0000 2.8000 3.54<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C 2.5000 2.8000 3.54<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C 1.2124 3.500 3.54<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">K_POINTS (automatic)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">6 6 1 0 0 0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
</body>
</html>