<div dir="ltr"><br><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">---------- Forwarded message ---------<br>From: <strong class="gmail_sendername" dir="auto">SPPU/05097P/2021 OYOMO BILL C</strong> <span dir="auto"><<a href="mailto:billclintone44@students.tukenya.ac.ke">billclintone44@students.tukenya.ac.ke</a>></span><br>Date: Sun, Apr 9, 2023 at 8:37 PM<br>Subject: error in routine check atoms(1)<br>To:  <<a href="mailto:users-request@lists.quantum-espresso.org">users-request@lists.quantum-espresso.org</a>><br></div><br><br><div dir="ltr">Hello everyone,<div>I get the following error I try to run an MD calculation using a supercell created by xcrysden:</div><div>%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br>     Error in routine check_atoms (1):<br>     atoms #   1 and #  25 differ by lattice vector ( 0,-1, 0) in crystal axis<br> %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br><br>     stopping ...<br>How do I solve the problem? Kindly look at the attached input file. Also, please let me know If there is any other tool for generating a supercell with atoms of the same unit cell arranged together rather than atoms of the same type of elements arranged together, which is what phonopy generates.</div><div>Thank you,</div><div>Bill C Oyomo.</div></div>
</div></div>