<div dir="ltr"><div>Dear 
Takahiro Chiba,</div><div>normally I don't set the max_seconds option expecting that the job runs undefinitively.</div><div>The large number of steps is due to difficulties in convergence.</div><div>I'm going to verify if the problem is due to the batch 
queue system.</div><div>Best regards,</div><div>Mauro.<br>

</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Il giorno mar 21 set 2021 alle ore 06:54 Takahiro Chiba <<a href="mailto:takahiro_chiba@eis.hokudai.ac.jp">takahiro_chiba@eis.hokudai.ac.jp</a>> ha scritto:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear Sgroi,<br>
<br>
Because "max_seconds" is not written in the "&control" section, I<br>
think this is related to your batch queue. Could you make sure that<br>
your job is not interrupted or paused by the batch queue?<br>
<br>
P.S.<br>
I am surprised to see your huge nstep_path. Is it intentional?<br>
<br>
---Sender---<br>
Takahiro Chiba<br>
1st-year student at grad. school of chem. sci. and eng., Hokkaido Univ.<br>
Expected graduation date: Mar. 2023<br>
<a href="mailto:takahiro_chiba@eis.hokudai.ac.jp" target="_blank">takahiro_chiba@eis.hokudai.ac.jp</a><br>
-----<br>
<br>
2021年9月21日(火) 0:52 Mauro Sgroi <<a href="mailto:maurofrancesco.sgroi@gmail.com" target="_blank">maurofrancesco.sgroi@gmail.com</a>>:<br>
><br>
> Dear QE users,<br>
> I'm writing to point out a strange behavior I'm facing using PWNEB.<br>
><br>
> I'm trying to calculate the activation energy related to the movement of a Li-ion in NiO doped with one cobalt atom.<br>
><br>
> My input is the following:<br>
> BEGIN<br>
> BEGIN_PATH_INPUT<br>
> &PATH<br>
>   restart_mode      = 'from_scratch'<br>
>   string_method     = 'neb'<br>
>   nstep_path        = 2500<br>
>   ds                = 1.D0<br>
>   opt_scheme        = "broyden"<br>
>   num_of_images     = 12<br>
>   CI_scheme         = "no-CI"<br>
>   path_thr          = 0.05D0<br>
>   use_freezing      = .true.<br>
>   minimum_image     = .true.<br>
>   first_last_opt    = .true.<br>
>   opt_scheme        ='broyden'<br>
> /<br>
> END_PATH_INPUT<br>
> BEGIN_ENGINE_INPUT<br>
> &CONTROL<br>
>     outdir = '/workhpc/FCA/FCA_CRF_STRUT/sgroi/tmp/modalis2/NEB_CO_no_CI'<br>
>     prefix = 'R_3m_ODH_NEB_Co'<br>
>     pseudo_dir = '/workhpc/FCA/FCA_CRF_STRUT/sgroi/DATABASE/ESPRESSO'<br>
> /<br>
> &SYSTEM<br>
>     degauss                   =  1.00000e-02<br>
>     ecutrho                   =  3.25000e+02<br>
>     ecutwfc                   =  5.00000e+01<br>
>     ibrav                     = 0<br>
>     nat                       = 47<br>
>     nspin                     = 2<br>
>     ntyp                      = 4<br>
>     occupations               = "smearing"<br>
>     smearing                  = "gaussian"<br>
>     starting_magnetization(1) =  0.00000e+00<br>
>     starting_magnetization(2) =  0.50000e-01<br>
>     starting_magnetization(3) =  0.00000e+00<br>
>     starting_magnetization(4) =  0.00000e-01<br>
>     lda_plus_u = .true.<br>
>     Hubbard_U(2) = 6.2<br>
>     Hubbard_U(4) = 6.2<br>
> /<br>
> &ELECTRONS<br>
>     conv_thr         =  1.00000e-07<br>
>     electron_maxstep =  300<br>
>     mixing_beta      =  1.00000e-01<br>
>     startingpot      = "atomic"<br>
>     startingwfc      = "atomic+random"<br>
> /<br>
> &IONS<br>
> /<br>
> ATOMIC_SPECIES<br>
> Li      6.94100  Li.pbe-sl-rrkjus_psl.1.0.0.UPF<br>
> Ni     58.69340  Ni.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF<br>
> O      15.99940  O.pbe-nl-rrkjus_psl.1.0.0.UPF<br>
> Co     58.93319  Co.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF<br>
> BEGIN_POSITIONS<br>
> FIRST_IMAGE<br>
> ATOMIC_POSITIONS {angstrom}<br>
> Ni      -1.678337       2.906965        -4.880813       0 0 0<br>
> Ni      2.517505        -1.453482       0.000000        1 1 1<br>
> Co      1.678337        -2.906965       4.880813        1 1 1<br>
> Ni      0.845922        1.465179        -4.802724       0 0 0<br>
> Ni      2.517505        1.453482        0.000000        1 1 1<br>
> Ni      1.691843        0.000000        4.802724        1 1 1<br>
> Ni      0.845922        -1.465179       -4.802724       0 0 0<br>
> Ni      0.000000        2.906965        0.000000        1 1 1<br>
> Co      0.000000        0.000000        0.000000        1 1 1<br>
> Ni      -0.845922       -1.465179       4.802724        1 1 1<br>
> Ni      -0.845922       1.465179        4.802724        1 1 1<br>
> Ni      -1.691843       0.000000        -4.802724       0 0 0<br>
> O       1.755223        0.000000        -5.980511       0 0 0<br>
> O       0.820882        -1.421809       -1.166320       0 0 0<br>
> O       0.086732        2.906965        3.715693        1 1 1<br>
> O       -0.877611       1.520067        -5.980511       0 0 0<br>
> O       0.820882        1.421809        -1.166320       0 0 0<br>
> O       0.000000        0.000000        3.926037        1 1 1<br>
> O       -0.877611       -1.520067       -5.980511       0 0 0<br>
> O       -1.678337       2.906965        -0.877278       0 0 0<br>
> O       -1.641764       0.000000        -1.166320       0 0 0<br>
> O       2.474140        1.528594        3.715693        1 1 1<br>
> O       2.474140        -1.528594       3.715693        1 1 1<br>
> O       1.678337        -2.906965       -5.671852       0 0 0<br>
> O       2.560871        -1.378371       -3.715693       0 0 0<br>
> O       1.678337        -2.906965       0.877278        1 1 1<br>
> O       0.877611        1.520067        5.980511        0 0 0<br>
> O       0.000000        0.000000        -3.926037       0 0 0<br>
> O       1.641764        0.000000        1.166320        1 1 1<br>
> O       0.877611        -1.520067       5.980511        0 0 0<br>
> O       -0.086732       2.906965        -3.715693       0 0 0<br>
> O       -0.820882       1.421809        1.166320        1 1 1<br>
> O       -0.820882       -1.421809       1.166320        1 1 1<br>
> O       -1.678337       2.906965        5.671852        0 0 0<br>
> O       -1.755223       0.000000        5.980511        0 0 0<br>
> O       2.560871        1.378371        -3.715693       0 0 0<br>
> Li      2.517505        -1.453482       7.240013        0 0 0<br>
> Li      1.678337        -2.906965       -2.350686       0 0 0<br>
> Li      0.000000        0.000000        7.240013        0 0 0<br>
> Li      1.671002        0.000000        -2.405763       0 0 0<br>
> Li      0.835501        -1.447130       2.405763        1 1 1<br>
> Li      0.000000        2.906965        7.240013        0 0 0<br>
> Li      -0.835501       1.447130        -2.405763       0 0 0<br>
> Li      -0.835501       -1.447130       -2.405763       0 0 0<br>
> Li      -1.678337       2.906965        2.350686        1 1 1<br>
> Li      -1.671002       0.000000        2.405763        1 1 1<br>
> Li      2.517505        1.453482        7.240013        0 0 0<br>
> LAST_IMAGE<br>
> ATOMIC_POSITIONS {angstrom}<br>
> Ni      -1.678337       2.906965        -4.880813       0 0 0<br>
> Ni      2.517505        -1.453482       0.000000         1 1 1<br>
> Co      1.678337        -2.906965       4.880813         1 1 1<br>
> Ni      0.845922        1.465179        -4.802724       0 0 0<br>
> Ni      2.517505        1.453482        0.000000         1 1 1<br>
> Ni      1.691843        0.000000        4.802724         1 1 1<br>
> Ni      0.845922        -1.465179       -4.802724       0 0 0<br>
> Ni      0.000000        2.906965        0.000000         1 1 1<br>
> Co      0.000000        0.000000        0.000000         1 1 1<br>
> Ni      -0.845922       -1.465179       4.802724         1 1 1<br>
> Ni      -0.845922       1.465179        4.802724         1 1 1<br>
> Ni      -1.691843       0.000000        -4.802724       0 0 0<br>
> O       1.755223        0.000000        -5.980511       0 0 0<br>
> O       0.820882        -1.421809       -1.166320       0 0 0<br>
> O       0.086732        2.906965        3.715693         1 1 1<br>
> O       -0.877611       1.520067        -5.980511       0 0 0<br>
> O       0.820882        1.421809        -1.166320       0 0 0<br>
> O       0.000000        0.000000        3.926037         1 1 1<br>
> O       -0.877611       -1.520067       -5.980511       0 0 0<br>
> O       -1.678337       2.906965        -0.877278       0 0 0<br>
> O       -1.641764       0.000000        -1.166320       0 0 0<br>
> O       2.474140        1.528594        3.715693         1 1 1<br>
> O       2.474140        -1.528594       3.715693         1 1 1<br>
> O       1.678337        -2.906965       -5.671852       0 0 0<br>
> O       2.560871        -1.378371       -3.715693       0 0 0<br>
> O       1.678337        -2.906965       0.877278         1 1 1<br>
> O       0.877611        1.520067        5.980511         0 0 0<br>
> O       0.000000        0.000000        -3.926037       0 0 0<br>
> O       1.641764        0.000000        1.166320         1 1 1<br>
> O       0.877611        -1.520067       5.980511         0 0 0<br>
> O       -0.086732       2.906965        -3.715693       0 0 0<br>
> O       -0.820882       1.421809        1.166320         1 1 1<br>
> O       -0.820882       -1.421809       1.166320         1 1 1<br>
> O       -1.678337       2.906965        5.671852         0 0 0<br>
> O       -1.755223       0.000000        5.980511         0 0 0<br>
> O       2.560871        1.378371        -3.715693       0 0 0<br>
> Li      2.517505        -1.453482       7.240013         0 0 0<br>
> Li      1.678337        -2.906965       -2.350686       0 0 0<br>
> Li      0.000000        0.000000        7.240013         0 0 0<br>
> Li      1.671002        0.000000        -2.405763       0 0 0<br>
> Li      0.835501        -1.447130       2.405763         1 1 1<br>
> Li      0.000000        2.906965        7.240013         0 0 0<br>
> Li      -0.835501       1.447130        -2.405763       0 0 0<br>
> Li      -0.835501       -1.447130       -2.405763       0 0 0<br>
> Li      -1.678337       2.906965        2.350686         1 1 1<br>
> Li      0.835501        1.447130        2.405763         1 1 1<br>
> Li      2.517505        1.453482        7.240013         0 0 0<br>
> END_POSITIONS<br>
> K_POINTS { gamma }<br>
> CELL_PARAMETERS {angstrom}<br>
>   5.813929   0.000000   0.000000<br>
>   0.000000   5.813929   0.000000<br>
>   0.000000   0.000000   14.48002<br>
> END_ENGINE_INPUT<br>
> END<br>
><br>
> The calculation stops with the following message:<br>
><br>
> WARNING :  scf convergence NOT achieved on image  11<br>
>      cleaning-up extrapolation files<br>
>      NEB          :   5m11.32s CPU   5m16.54s WALL<br>
>    This run was terminated on:  17:33: 4  20Sep2021<br>
><br>
> but in image 11 output I've:<br>
>  iteration #116     ecut=    50.00 Ry     beta= 0.10<br>
>      Davidson diagonalization with overlap<br>
>      ethr =  1.92E-10,  avg # of iterations =  1.0<br>
><br>
>      total cpu time spent up to now is      301.9 secs<br>
><br>
>      total energy              =   -2097.24718498 Ry<br>
>      estimated scf accuracy    <       0.00000057 Ry<br>
><br>
>      total magnetization       =     9.00 Bohr mag/cell<br>
>      absolute magnetization    =    16.79 Bohr mag/cell<br>
><br>
>      iteration #117     ecut=    50.00 Ry     beta= 0.10<br>
>      Davidson diagonalization with overlap<br>
><br>
>      Program stopped by user request<br>
>      Calculation stopped in k-point loop, point #     1<br>
>      Calculation stopped in scf loop at iteration #   116<br>
><br>
> What does " Program stopped by user request" it mean?<br>
> Is there a way to fix this behaviour?<br>
><br>
> Thanks a lot and best regards,<br>
> Mauro Sgroi.<br>
> _______________________________________________<br>
> Quantum ESPRESSO is supported by MaX (<a href="http://www.max-centre.eu" rel="noreferrer" target="_blank">www.max-centre.eu</a>)<br>
> users mailing list <a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a><br>
> <a href="https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users</a><br>
_______________________________________________<br>
Quantum ESPRESSO is supported by MaX (<a href="http://www.max-centre.eu" rel="noreferrer" target="_blank">www.max-centre.eu</a>)<br>
users mailing list <a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a><br>
<a href="https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users</a></blockquote></div>