<div dir="ltr">Dear Dr. Thomas,<div><br></div><div>Let me try setting the eamp = 0 for this system. I'll update you on how it's been working. </div><div><br></div><div>I've read about applying electric field in the blogs of QE users. Can't remember which site but someone recommended not to set zero for eamp but a very low number, thus I decided for 0.001. One particular blog was on the materials square website. I think I have misinterpreted the blog. My apologies.</div><div><br></div><div>Best regards,</div><div>Jayfe</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, Apr 16, 2021 at 9:03 PM Thomas Brumme <<a href="mailto:tbrumme@msx.tu-dresden.de">tbrumme@msx.tu-dresden.de</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
  
    
  
  <div>
    <p>Dear Jayfe,</p>
    <p>eamp gives the amplitude of the external electric field. Since
      the dipole is internal it is correct to set eamp = 0<br>
      The dipole correction will self consistently determine the
      required dipole - how do you want to know this before?</p>
    <p>Regards</p>
    <p>Thomas<br>
    </p>
    <div>On 4/16/21 1:43 PM, Jayfe Anthony Abrea
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite">
      
      
      
      <div>
        <p class="MsoNormal">Hello Dr. Thomas,<u></u><u></u></p>
        <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
        <p class="MsoNormal">[I am still adjusting with this QE mailing
          list. Thus, I made duplicate reply. Please bear with me Dr.
          Thomas]<u></u><u></u></p>
        <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
        <p class="MsoNormal">I’m glad that you took notice on my
          predicament. Thank you Dr. Thomas. My appreciations.<u></u><u></u></p>
        <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
        <p class="MsoNormal">The input file I placed in this email
          contains my initial positions of the atoms. The initial
          distance between H and surface is actually that “bad” or that
          far. I used the optimized positions of the slab with Fe
          instead of Mn and applied it to my Pt/Mn slab in the hopes
          that the atomic positions are closer to optimization. The z
          atomic position of H went down from 0.618734 to 0.607984. It
          still gave a similar oscillating result. =(<u></u><u></u></p>
        <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
        <p class="MsoNormal">As for the applied external electric field,
          I’ve read that eamp, along with edir, emaxpos, and eopreg are
          adjusted for dipole correction of my slab system. I am not
          sure if making eamp to zero can still provide dipole
          correction. Will it still be OK to make it zero?<u></u><u></u></p>
        <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
        <p class="MsoNormal">Best regards,<u></u><u></u></p>
        <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
        <p class="MsoNormal">Jayfe<u></u><u></u></p>
        <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
        <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
        <p class="MsoNormal">Sent from <a href="https://go.microsoft.com/fwlink/?LinkId=550986" target="_blank">Mail</a> for Windows 10</p>
        <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
        <div style="border-right:none;border-bottom:none;border-left:none;border-top:1pt solid rgb(225,225,225);padding:3pt 0in 0in">
          <p class="MsoNormal" style="border:none;padding:0in"><b>From:
            </b><a href="mailto:tbrumme@msx.tu-dresden.de" target="_blank">Thomas Brumme</a><br>
            <b>Sent: </b>Friday, April 16, 2021 4:03 PM<br>
            <b>To: </b><a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">Quantum ESPRESSO users Forum</a>; <a href="mailto:06302408@usc.edu.ph" target="_blank">Jayfe
              Anthony Abrea</a><br>
            <b>Subject: </b>Re: [QE-users] My slab system does not
            converge during optimization.Can you help me?</p>
        </div>
        <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
        <p>Hi Jayfe,</p>
        <p>Maybe the initial distance between hydrogen and the surface
          is just "bad"? Maybe reduce it a bit and see if this helps.<br>
          Another thing I noticed:<br>
          Do you really want an external electric field? Because the
          eamp is nonzero...</p>
        <p>Regards</p>
        <p>Thomas</p>
        <div>
          <p class="MsoNormal">On 4/15/21 4:05 PM, Jayfe Anthony Abrea
            wrote:<u></u><u></u></p>
        </div>
        <blockquote style="margin-top:5pt;margin-bottom:5pt">
          <div>
            <p class="MsoNormal">Hello fellow QE users and developers, <u></u><u></u></p>
            <div>
              <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal">I am new to Quantum Espresso and I am
                doing calculations on adsorption energy. I am using
                BURAI 1.3 GUI to aid in my QE setup thus I am not sure
                of the QE version that I am using. I am trying to do
                optimization on the hydrogen atom on the bimetallic slab
                (see attached input file). I have already employed
                several tweakings since the calculations never
                converged, such as:<u></u><u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal">- changed the mixing_mode to local-TF
                since it is suited for inhomogeneous system like my slab
                system<u></u><u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal">- lowering the mixing_beta to 0.1<u></u><u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal">- changing the ecutrho, ecutwfc, and
                starting_magnetization to the ones recommended by this
                website: <a href="http://www.materialscloud.org/work/tools/qeinputgenerator" target="_blank">http://www.materialscloud.org/work/tools/qeinputgenerator</a><u></u><u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal">These tweakings are made based on
                what I have read so far in this forum. After
                calculations, the slab-adsorbate system didn't achieve
                convergence in optimization (as seen in attached pics on
                SCF and accuracy). Manganese in my system seems to be
                problematic since when I tried replacing Mn with other
                metals (e.g. Fe and Co in particular), it reaches
                convergence and becomes optimized. I don't know now how
                to resolve this issue. I am hoping that you have great
                insights to address my plight.<u></u><u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal">I would really appreciate your help
                in this regard. Thank you!<u></u><u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal">Cheers,<u></u><u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal">Jayfe Anthony<u></u><u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal">Student<u></u><u></u></p>
            </div>
            <div>
              <p class="MsoNormal">University of San Carlos<u></u><u></u></p>
            </div>
          </div>
          <p class="MsoNormal"><br>
            <br>
            <u></u><u></u></p>
          <pre>_______________________________________________</pre>
          <pre>Quantum ESPRESSO is supported by MaX (<a href="http://www.max-centre.eu" target="_blank">www.max-centre.eu</a>)</pre>
          <pre>users mailing list <a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a></pre>
          <pre><a href="https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users" target="_blank">https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users</a><u></u><u></u></pre>
        </blockquote>
        <pre>-- </pre>
        <pre>Dr. rer. nat. Thomas Brumme</pre>
        <pre>Theoretical chemistry</pre>
        <pre>TU Dresden - BAR / II49</pre>
        <pre>Helmholtzstr. 18</pre>
        <pre>01069 Dresden</pre>
        <pre><u></u> <u></u></pre>
        <pre>Tel:  +49 (0)351 463 40844</pre>
        <pre><u></u> <u></u></pre>
        <pre>email: <a href="mailto:thomas.brumme@tu-dresden.de" target="_blank">thomas.brumme@tu-dresden.de</a></pre>
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:10pt;font-family:"Courier New""><u></u> <u></u></span></p>
      </div>
    </blockquote>
    <pre cols="72">-- 
Dr. rer. nat. Thomas Brumme
Theoretical chemistry
TU Dresden - BAR / II49
Helmholtzstr. 18
01069 Dresden

Tel:  +49 (0)351 463 40844

email: <a href="mailto:thomas.brumme@tu-dresden.de" target="_blank">thomas.brumme@tu-dresden.de</a></pre>
  </div>

</blockquote></div>