<div dir="ltr">Dear Lorenzo and Michel,<div><br></div><div> thank you for your reply. Yes, unfortunately I am using a small cluster and,  for memory issues, I cannot use the SSD-based local scratch. Thus I am forced to use a</div> non-parallel NFS. From your answers, I understand that, given the situation,  the huge difference between the CPU and WALL time that I am observing is reasonable.<div>Since I am facing a hardware limitation I guess I cannot do much to improve the performances. I will try to find some solutions with the person in charge of the cluster.<div><div><br></div><div>Best Regards,</div><div>Raffaello Bianco</div><div>UPV/EHU - CFM</div><div></div></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, Sep 30, 2020 at 4:13 PM Michal Krompiec <<a href="mailto:michal.krompiec@gmail.com">michal.krompiec@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear Rafaello,<div>Are you using a local (preferably SSD-based) scratch drive, or a very fast parallel file system?</div><div>Best wishes,</div><div>Michal Krompiec</div><div>Merck KGaA</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, 30 Sep 2020 at 15:05, Raffaello Bianco <<a href="mailto:raffaello.bianco.it@gmail.com" target="_blank">raffaello.bianco.it@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear QE users and developers,<div><br></div><div> I am doing an electron-phonon coupling calculation in this way (I am using QE v 6.6).</div><div>First, I have done an scf calculation. Then, I have done a phonon calculation where I have printed the dvscf files, with</div><div><br></div><div>   fildvscf         = 'dvscf'<br></div><div>   </div><div>Subsequently, I have done the electron-phonon calculation changing the k-mesh grid, with</div><div><br></div><div>    trans            = .false.<br></div><div>    electron_phonon  = 'simple'<br></div><div><br></div><div>The calculation ends correctly, but for some q points I have noticed a huge difference between </div><div>CPU and Wall time, like</div><div><br></div><div>PHONON       :     15h55m CPU   3d18h56m WALL<br></div><div><br></div><div>From the report at the end of the output, the I/O davcio routine seems to be the</div><div>"guilty":</div><div><br><br><div>    General routines<br>     davcio       :    107.89s CPU 263856.08s WALL (  520331 calls)</div><div></div><br>     Parallel routines<br> <br>      Electron-phonon coupling<br>     elphon       :  41730.55s CPU 309708.87s WALL (       1 calls)<br>     elphel       :  41671.20s CPU 309625.04s WALL (      60 calls)<br> <br>      General routines<br>     davcio       :    107.89s CPU 263856.08s WALL (  520331 calls)</div><div><br> This calculation was done with 10 processors and npool = 10, if I use 40 processors and npool = 10 it is worse (as can probably be expected due to the higher number of I / O operations). I have looked at the documentation but I am not very familiar with these things, thus I still have several doubts. Any suggestions on tests to do or how to improve performance, or at least comments to clarify the problem, would be greatly appreciated. <br></div><div><br></div><div>Thank you for your time,</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Raffaello Bianco</div><div><br></div><div><br></div></div>
_______________________________________________<br>
Quantum ESPRESSO is supported by MaX (<a href="http://www.max-centre.eu" rel="noreferrer" target="_blank">www.max-centre.eu</a>)<br>
users mailing list <a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a><br>
<a href="https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users</a></blockquote></div>
_______________________________________________<br>
Quantum ESPRESSO is supported by MaX (<a href="http://www.max-centre.eu" rel="noreferrer" target="_blank">www.max-centre.eu</a>)<br>
users mailing list <a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a><br>
<a href="https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users</a></blockquote></div>