<div dir='auto'>Hi<div dir="auto">Before or after does not make difference that info is used only for doing the projections. </div><div dir="auto">The pseudo names are written in two places. The one read by the program is the second. Have you changed that one?</div><div dir="auto">Regards </div><div dir="auto">Pietro</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">Il 14 set 2020 10:24 PM, Mohammad Moaddeli <mohammad.moaddeli@gmail.com> ha scritto:<br type="attribution" /><blockquote class="quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Dear 
Pietro,</div><div><br /></div><div>Thank you for technical advice.<br /></div><div>Should I copy the non-zero 
<span style="font-size:12pt">PP_PSWFC</span> from the original file before running SCF?</div><div><br /></div><div>Replacing the pseudo file name in 
data-file-schema.xml before running projwfc.x results in:</div><div><br /></div><div>%%%%%<br /></div><div>Error in routine projwave (1):<br />     Cannot project on zero atomic wavefunctions!</div><div>%%%%%</div><div><br /></div><div>Best,</div><div><br /></div><div>Mohammad<br /></div></div><br /><div class="elided-text"><div dir="ltr">On Sun, Sep 13, 2020 at 7:23 PM Pietro Delugas <<a href="mailto:pdelugas@sissa.it">pdelugas@sissa.it</a>> wrote:<br /></div><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb( 204 , 204 , 204 );padding-left:1ex"><div><div><p><span style="font-size:12pt"><u></u> <u></u></span></p><p><span style="font-size:12pt">Hello <u></u><u></u></span></p><p><span style="font-size:12pt"><u></u> <u></u></span></p><p><span style="font-size:12pt">Try to copy the PP_PSWFC from the original file </span>'Si.pbe-nl-rrkjus_psl.1.0.0.UPF' replacing the all 0s one contained in Si.PBE.0.25.UPF.  </p><p><u></u> <u></u></p><p>Other thing you can do is to replace the pseudo file name in data-file-schema.xml before running projwfc.x. </p><p><u></u> <u></u></p><p>Hope it helps</p><p>Greetings – Pietro <span style="font-size:12pt"><u></u><u></u></span></p><p><span style="font-size:12pt"><u></u> <u></u></span></p><p>Sent from <a href="https://go.microsoft.com/fwlink/?LinkId=550986">Mail</a> for Windows 10</p><p><span style="font-size:12pt"><u></u> <u></u></span></p><div style="border-color:rgb( 225 , 225 , 225 );border-style:solid none none;border-width:1pt medium medium;padding:3pt 0in 0in"><p style="border:medium none;padding:0in"><b>From: </b><a href="mailto:mohammad.moaddeli@gmail.com">Mohammad Moaddeli</a><br /><b>Sent: </b>Sunday, September 13, 2020 2:25 PM<br /><b>To: </b><a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org">Quantum ESPRESSO users Forum</a><br /><b>Subject: </b>Re: [QE-users] DFT-1/2 method</p></div><p><span style="font-size:12pt"><u></u> <u></u></span></p><div><div><p>Dear  Giuseppe,</p></div><div><p><u></u> <u></u></p></div><div><p>A pseudopotential from PSlibrary is applied:</p></div><div><p><u></u> <u></u></p></div><div><p>=============================</p></div><div><p>&input<br />       title='Si',<br />       zed=14.0,<br />       config='[Ne] 3s2 3p2 3d-1',<br />       iswitch=4<br />       dft='PBE'<br />       rel = 1,<br />/<br />&test<br />  file_pseudo='Si.pbe-nl-rrkjus_psl.1.0.0.UPF',<br />  file_pseudopw='Si.PBE.0.25.UPF',<br />  configts(1)='3s2 3p2 3d-1',<br />  configts(2)='3s2 3p1.75 3d-1',<br />  rcutv=1.0<br />/</p></div><div><p>============================= </p></div><div><p>SCF input:</p></div><div><p><u></u> <u></u></p></div><div><p>============================= </p></div><div><p> &control<br />    calculation = 'scf'<br />    restart_mode='from_scratch',<br />    prefix='silicon',<br />    tstress = .true.<br />    tprnfor = .true.<br />    pseudo_dir = './',<br />    outdir='tmp'<br />!   disk_io = 'none'<br /> /<br /> &system<br />    ibrav=  2, celldm(1) =10.20, nat=  2, ntyp= 1,<br />    ecutwfc =50.0,<br /> /<br /> &electrons<br />    diagonalization='david'<br />    mixing_mode = 'plain'<br />    mixing_beta = 0.7<br />    conv_thr =  1.0d-8<br /> /<br />ATOMIC_SPECIES<br /> Si  28.086  Si.PBE.0.25.UPF<br />ATOMIC_POSITIONS alat<br /> Si 0.00 0.00 0.00<br /> Si 0.25 0.25 0.25<br />K_POINTS<br />  10<br />   0.1250000  0.1250000  0.1250000   1.00<br />   0.1250000  0.1250000  0.3750000   3.00<br />   0.1250000  0.1250000  0.6250000   3.00<br />   0.1250000  0.1250000  0.8750000   3.00<br />   0.1250000  0.3750000  0.3750000   3.00<br />   0.1250000  0.3750000  0.6250000   6.00<br />   0.1250000  0.3750000  0.8750000   6.00<br />   0.1250000  0.6250000  0.6250000   3.00<br />   0.3750000  0.3750000  0.3750000   1.00<br />   0.3750000  0.3750000  0.6250000   3.00 </p></div><div><p>============================= </p></div><div><p>To the best of my knowledge ONCVPS could not be run using ld1.x, because of its format.</p></div><div><p><u></u> <u></u></p></div><div><p><u></u> <u></u></p></div><div><p>With best regards,</p></div><div><p><u></u> <u></u></p></div><div><p>Mohammad</p></div><div><p><u></u> <u></u></p></div><div><p>ShirazU</p></div></div><p><u></u> <u></u></p><div><div><p>On Sun, Sep 13, 2020 at 2:59 PM Giuseppe Mattioli <<a href="mailto:giuseppe.mattioli@ism.cnr.it">giuseppe.mattioli@ism.cnr.it</a>> wrote:</p></div></div><p style="margin-left:4.8pt"><br />Dear Mohammad<br />You are likely using a pseudopotential which does not include atomic  <br />pseudo-wavefunctions in the UPF file; maybe, as often reported, one of  <br />the ONCVPS contained in the sg15 database. Thus projwfc.x cannot find  <br />atomic wavefunctions suitable for performing projections of Kohn-Sham  <br />orbitals onto.<br /><br />You should look for PSP files containing the pseudowavefunctions, and  <br />if you are actually looking for ONCVPS files containing them, you  <br />should find what you need here:<br /><br /><a href="https://github.com/pipidog/ONCVPSP/tree/master/sg15">https://github.com/pipidog/ONCVPSP/tree/master/sg15</a><br /><br />HTH<br />Giuseppe<br /><br />Quoting Mohammad Moaddeli <<a href="mailto:mohammad.moaddeli@gmail.com">mohammad.moaddeli@gmail.com</a>>:<br /><br />> Dear all,<br />><br />> I am trying to run pdos for Si based on the dft-1/2 method implemented by<br />> Leonardo Matheus Marion Jorge. However, the following warning in the scf<br />> run is appeared:<br />><br />> ==================================<br />>      Program PWSCF v.6.6 starts on 13Sep2020 at 11:33:39<br />><br />>      This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite<br />>      for quantum simulation of materials; please cite<br />>          "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);<br />>          "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 29 465901 (2017);<br />>           URL <a href="http://www.quantum-espresso.org">http://www.quantum-espresso.org</a>",<br />>      in publications or presentations arising from this work. More details<br />> at<br />>      <a href="http://www.quantum-espresso.org/quote">http://www.quantum-espresso.org/quote</a><br />><br />>      Parallel version (MPI), running on     1 processors<br />><br />>      MPI processes distributed on     1 nodes<br />>      Fft bands division:     nmany     =       1<br />>      Reading input from <a href="http://scf_si.in">scf_si.in</a><br />><br />>      Current dimensions of program PWSCF are:<br />>      Max number of different atomic species (ntypx) = 10<br />>      Max number of k-points (npk) =  40000<br />>      Max angular momentum in pseudopotentials (lmaxx) =  3<br />>      WARNING: atomic wfc #  1 for atom typeSi has zero norm<br />>      WARNING: atomic wfc #  2 for atom typeSi has zero norm<br />>      WARNING: atomic wfc #  3 for atom typeSi has zero norm<br />><br />>      Subspace diagonalization in iterative solution of the eigenvalue<br />> problem:<br />>      a serial algorithm will be used<br />> .<br />> .<br />> .<br />> ==================================<br />><br />><br />><br />><br />> Therefore pdos could not be computed:<br />><br />><br />><br />><br />> ==================================<br />>      Program PROJWFC v.6.6 starts on 13Sep2020 at 11:33:50<br />><br />>      This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite<br />>      for quantum simulation of materials; please cite<br />>          "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);<br />>          "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 29 465901 (2017);<br />>           URL <a href="http://www.quantum-espresso.org">http://www.quantum-espresso.org</a>",<br />>      in publications or presentations arising from this work. More details<br />> at<br />>      <a href="http://www.quantum-espresso.org/quote">http://www.quantum-espresso.org/quote</a><br />><br />>      Parallel version (MPI), running on     1 processors<br />><br />>      MPI processes distributed on     1 nodes<br />>      Fft bands division:     nmany     =       1<br />><br />>      Reading xml data from directory:<br />><br />>      tmp/silicon.save/<br />>      WARNING: atomic wfc #  1 for atom typeSi has zero norm<br />>      WARNING: atomic wfc #  2 for atom typeSi has zero norm<br />>      WARNING: atomic wfc #  3 for atom typeSi has zero norm<br />><br />>      IMPORTANT: XC functional enforced from input :<br />>      Exchange-correlation= PBE<br />>                            (   1   4   3   4   0   0   0)<br />>      Any further DFT definition will be discarded<br />>      Please, verify this is what you really want<br />><br />><br />>      G-vector sticks info<br />>      --------------------<br />>      sticks:   dense  smooth     PW     G-vecs:    dense   smooth      PW<br />>      Sum         721     721    211                12627    12627    1989<br />><br />><br />>      Gaussian broadening (read from input): ngauss,degauss=   1    0.010000<br />><br />><br />>   <br />> %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br />>      Error in routine projwave (1):<br />>      Cannot project on zero atomic wavefunctions!<br />>   <br />> %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br />><br />>      stopping ...<br />> ==================================<br />><br />> Is it a limitation in the DFT-1/2 method?<br />><br />> Best regards,<br />><br />> Mohammad<br />><br />> Department of Materials Science and Engineering, School of Engineering,<br />> Shiraz University<br /><br /><br /><br />GIUSEPPE MATTIOLI<br />CNR - ISTITUTO DI STRUTTURA DELLA MATERIA<br />Via Salaria Km 29,300 - C.P. 10<br />I-00015 - Monterotondo Scalo (RM)<br />Mob (*preferred*) +39 373 7305625<br />Tel + 39 06 90672342 - Fax +39 06 90672316<br />E-mail: <<a href="mailto:giuseppe.mattioli@ism.cnr.it">giuseppe.mattioli@ism.cnr.it</a>><br /><br />_______________________________________________<br />Quantum ESPRESSO is supported by MaX (<a href="http://www.max-centre.eu/quantum-espresso">www.max-centre.eu/quantum-espresso</a>)<br />users mailing list <a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org">users@lists.quantum-espresso.org</a><br /><a href="https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users">https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users</a></p><p><span style="font-size:12pt"><u></u> <u></u></span></p></div></div>_______________________________________________<br />
Quantum ESPRESSO is supported by MaX (<a href="http://www.max-centre.eu/quantum-espresso">www.max-centre.eu/quantum-espresso</a>)<br />
users mailing list <a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org">users@lists.quantum-espresso.org</a><br />
<a href="https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users">https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users</a></blockquote></div>
</blockquote></div><br></div>