<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">Hi</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">I want to know if I have correctly built qe with openmpi-4.0. So, I ran the following command and got this error</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">[root@rocks7 q-e-qe-6.4]# ./configure --prefix=/share/apps/softwares/q-e-qe-6.4 MPIF90=/share/apps/softwares/openmpi-4.0.1/bin/mpif90</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">...</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">
[root@rocks7 q-e-qe-6.4]# make all</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">...<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">[mahmood@rocks7 job]$ /share/apps/softwares/openmpi-4.0.1/bin/mpirun /share/apps/softwares/q-e-qe-6.4/bin/pw.x<br>--------------------------------------------------------------------------<br>As of version 3.0.0, the "sm" BTL is no longer available in Open MPI.<br><br>Efficient, high-speed same-node shared memory communication support in<br>Open MPI is available in the "vader" BTL.  To use the vader BTL, you<br>can re-run your job with:<br><br>    mpirun --mca btl vader,self,... your_mpi_application<br>--------------------------------------------------------------------------<br>--------------------------------------------------------------------------<br>A requested component was not found, or was unable to be opened.  This<br>means that this component is either not installed or is unable to be<br>used on your system (e.g., sometimes this means that shared libraries<br>that the component requires are unable to be found/loaded).  Note that<br>Open MPI stopped checking at the first component that it did not find.<br><br>Host:      <a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com">rocks7.jupiterclusterscu.com</a><br>Framework: btl<br>Component: sm<br>--------------------------------------------------------------------------<br>--------------------------------------------------------------------------<br>It looks like MPI_INIT failed for some reason; your parallel process is<br>likely to abort.  There are many reasons that a parallel process can<br>fail during MPI_INIT; some of which are due to configuration or environment<br>problems.  This failure appears to be an internal failure; here's some<br>additional information (which may only be relevant to an Open MPI<br>developer):<br><br>  mca_bml_base_open() failed<br>  --> Returned "Not found" (-13) instead of "Success" (0)<br>--------------------------------------------------------------------------<br>[rocks7:19796] *** An error occurred in MPI_Init<br>[rocks7:19796] *** reported by process [85917697,3255307776955514882]<br>[rocks7:19796] *** on a NULL communicator<br>[rocks7:19796] *** Unknown error<br>[rocks7:19796] *** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (processes in this communicator will now abort,<br>[rocks7:19796] ***    and potentially your MPI job)<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] PMIX ERROR: UNREACHABLE in file server/pmix_server.c at line 2079<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] 31 more processes have sent help message help-mpi-btl-sm.txt / btl sm is dead<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] 8 more processes have sent help message help-mca-base.txt / find-available:not-valid<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] 4 more processes have sent help message help-mpi-runtime.txt / mpi_init:startup:internal-failure<br>[<a href="http://rocks7.jupiterclusterscu.com:19784">rocks7.jupiterclusterscu.com:19784</a>] 3 more processes have sent help message help-mpi-errors.txt / mpi_errors_are_fatal unknown handle<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif">Is that normal and need input file? I also tried with a sample input file but got the same error.</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif"><br></div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><font face="tahoma,sans-serif">Regards,<br>Mahmood</font><br><br><br></div></div></div></div></div></div>