<div dir="ltr"><div dir="ltr">It was fixed on Dec. 3: <a href="https://gitlab.com/QEF/q-e/commit/98d6147e9206ed0affe8415c3c4a2ad9f8eca60a">https://gitlab.com/QEF/q-e/commit/98d6147e9206ed0affe8415c3c4a2ad9f8eca60a</a> but not backported to 6.3 because it did not look like a serious issue.<br></div><div dir="ltr"><br></div><div>Paolo<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Mar 12, 2019 at 2:26 PM RAPHAEL LONGUINHOS MONTEIRO LOBATO <<a href="mailto:raphael.lobato@ufla.br">raphael.lobato@ufla.br</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default">Hi,</div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default">Thanks for be working to fix it.</div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"> The other subject of the message ... "wrong celldm values"  ... was previously replied at <br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"><a href="http://lists.quantum-espresso.org/pipermail/users/2018-October/041419.html" target="_blank">http://lists.quantum-espresso.org/pipermail/users/2018-October/041419.html</a></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default">which thought it was solved with the modification reported in:<br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"><a href="https://gitlab.com/QEF/q-e/commit/9a579539b65bd1502d1f28747e483a1d1059f5f8" target="_blank">https://gitlab.com/QEF/q-e/commit/9a579539b65bd1502d1f28747e483a1d1059f5f8</a></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default">In the pw_restart_new.f90 of qe-6.3-bkp I see as reported above<br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default">1199 CALL at2celldm (ibrav,1.0_dp,at(:,1),at(:,2),at(:,3),celldm) ! chance to 1.0_dp in the place of the removed alat<br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default">Yet,
 the ph.x reads wrong celldm values, prints them wrongly in the dyn 
header, and the issue of rescaling some quantities from dynmat.x 
remains.<br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default">best,</div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"><br></div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default">Sorry ... I forgot to mention in previous post I'm from:</div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default">Associate Professor Raphael Longuinhos Monteiro Lobato
<br>CV:<a class="gmail-m_-2157578591865708541gmail-m_2511768992879587542gmail-moz-txt-link-freetext" href="http://lattes.cnpq.br/1475483971471395" target="_blank">http://lattes.cnpq.br/1475483971471395</a>.
<br>Research Group site:<a class="gmail-m_-2157578591865708541gmail-m_2511768992879587542gmail-moz-txt-link-freetext" href="http://jenainassoares2.wixsite.com/nanomat" target="_blank">http://jenainassoares2.wixsite.com/nanomat</a>  (Portuguese only - English version on the way)
<br>Departamento de Fisica, Universidade Federal de Lavras
<br>Av. Dr. Silvio Menicucci 1001, bairro Kenedy
<br>Post office box 3037
<br>37200-000 - Lavras, MG, Brazil
</div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small" class="gmail_default"><br></div></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
------------------------------<br>
<br>
Message: 8<br>
Date: Tue, 12 Mar 2019 11:04:58 +0100<br>
From: Pietro Davide Delugas <<a href="mailto:pdelugas@sissa.it" target="_blank">pdelugas@sissa.it</a>><br>
To: <a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a><br>
Subject: Re: [QE-users] pw_readschema_file failed retrieving input<br>
        info from xml file ph.x using grid in qe-6.3-bkp and 2D cutoff<br>
Message-ID: <<a href="mailto:a89d561d-1029-5416-7229-da026757a704@sissa.it" target="_blank">a89d561d-1029-5416-7229-da026757a704@sissa.it</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset=utf-8; format=flowed<br>
<br>
Hi<br>
<br>
Thanks for reporting the issue.<br>
<br>
As for the message about the missing input element, no problem it is the <br>
desired behavior, run_nscf started bby ph would not be able to fill <br>
correctly the<br>
input element because the variable in input_parameters are not <br>
initialized, so the element is? not printed at all.<br>
<br>
The isseus comes from the fact that in writing the status of the 2D <br>
cutoff we are currenlty using the value stored in input_parameters <br>
which, not being initialized, has in this case a wrong .false. value.<br>
<br>
I will fix the issue in the develop, for further information check this <br>
issue on gitlab <a href="https://gitlab.com/QEF/q-e/issues/102" rel="noreferrer" target="_blank">https://gitlab.com/QEF/q-e/issues/102</a><br>
<br>
Pietro<br>
<br>
<br>
<br>
On 03/11/2019 09:11 PM, Raphael Longuinhos Monteiro Lobato wrote:<br>
> Hi,<br>
><br>
> Using ph.x with grid may lead to<br>
><br>
> ????? Reading data from directory:<br>
> ????? scratch/X.Y/_ph0/test.save/<br>
> ????? Message from routine pw_readschema_file:<br>
> ????? failed retrieving input info from xml file, check it !!!<br>
><br>
> and wrong results.<br>
><br>
> In more details (sorry if not too methodical ... but I tried ... spent <br>
> all day on it):<br>
><br>
> There is no problem with Gamma calculations ... as there is no bands <br>
> to be read from /scratch/_ph0/ ... I guess.<br>
><br>
> Single-q, out Gamma (say X Y 0 instead 0. 0. 0.): tests without grid <br>
> (without breaking in start_irr) in qe-6.3-bkp (3D), and in qe-5.1.1 <br>
> without/with grid leads to same results (as expected).<br>
><br>
> Using grid in qe-6.3-bkp (2D):<br>
><br>
> ? + using only_init true leads to the message of error above ... the <br>
> calculations goes on as if all were all right, and the frequencies are <br>
> all wrong at the end (after collect).<br>
><br>
> ? + using only_init true and reduce_io true (thus repeating the band <br>
> structure calculations done at only_init calculations each time ... <br>
> the xml is not saved in /scratch/_ph0/) leads to frequencies as <br>
> expected when comparison to without grid calculations.<br>
><br>
> Using grid in qe-6.3-bkp (3D):<br>
> ? + using only_init true leads to the expected results (comparison <br>
> with previous 3D cases).<br>
><br>
> For me, it indicates it may be a problem when reading the information <br>
> of 2D cutoff in the in /scrath/_ph0/test.save/data-file-schema.xml <br>
> (same as /scrath/_ph0/test.xml).<br>
><br>
> The comparison between the scrathc/test.xml and /scratch/_ph0/test.xml <br>
> when using the only_init true and reduce_io false shows indeed some <br>
> unexpected discrepancies (e.g., from what I could get, it misses the <br>
> fact that the scf was performed with assume isolated flag)<br>
><br>
> (note ... I use wf_collect false in the scf calculation and norm <br>
> conserving pseudopotentials)<br>
><br>
> The above were single-q calculations. For the case of dispersion <br>
> calculations using 2D, reading from /scratch/X.Y/test.save/ does not <br>
> display the message. However, when reading the bands (reading from <br>
> /scratch/X.Y/_ph0/test.q_X/test.save/data-file-schema.xml) it does <br>
> display it (except for the 0. 0. 0. point ... in this case the bands <br>
> are read from /scratch/test.save/ ) ... surprisingly, the calculations <br>
> are correct ... I guess because in this case the code, somehow, does <br>
> not miss the 2D flag, as it informs on the output of out.X.Y it is <br>
> using 2D... the question remains "what is the information it misses <br>
> when reading the bands from xml ... and when it will lead to error on <br>
> the results ? "<br>
><br>
> Also, a previous post <br>
> <a href="http://lists.quantum-espresso.org/pipermail/users/2018-October/041419.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.quantum-espresso.org/pipermail/users/2018-October/041419.html</a><br>
> ... the celldm problem in the dyn header remains in 6.3-backports ... <br>
> and one have to correct it by hand on the .dyn<br>
><br>
> If these are indeed unexpected error (not my ...? if someone can <br>
> reproduce it) yet not solved (sorry if I miss the solution in older <br>
> posts), the real problem is ... I don't have idea to help solving them <br>
> ...? although I could give it a try with some guide.<br>
><br>
> best,<br>
><br>
</blockquote></div></div>
_______________________________________________<br>
users mailing list<br>
<a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a><br>
<a href="https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users</a></blockquote></div><br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>Paolo Giannozzi, Dip. Scienze Matematiche Informatiche e Fisiche,<br>Univ. Udine, via delle Scienze 208, 33100 Udine, Italy<br>Phone +39-0432-558216, fax +39-0432-558222<br><br></div></div></div></div></div>