<div dir="ltr"><div>I don't think it will make any difference. What takes a lot of RAM is a buffer with all orbitals in real space, always kept in memory.</div><div><br></div><div>Paolo<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Wed, Dec 12, 2018 at 12:13 PM Alex.Durie <<a href="mailto:alex.durie@open.ac.uk">alex.durie@open.ac.uk</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif" dir="ltr">
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols" dir="ltr">
<p style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><br>
</p>
I would be tempted to try the flag </div>
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols" dir="ltr">
disk_io = 'medium'</div>
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols" dir="ltr">
if the RAM usage is still too large, try</div>
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols" dir="ltr">
disk_io = 'high'</div>
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols" dir="ltr">
in namelist &CONTROL</div>
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols" dir="ltr">
<br>
</div>
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols" dir="ltr">
Hope that helps,</div>
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols" dir="ltr">
<br>
</div>
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols" dir="ltr">
Alex Durie</div>
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols" dir="ltr">
PhD Student</div>
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols" dir="ltr">
Open University</div>
<div id="gmail-m_-1008470716640573331divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols" dir="ltr">
United Kingdom<br>
<br>
<div style="color:rgb(0,0,0)">
<div class="gmail-m_-1008470716640573331BodyFragment"><font size="2"><span style="font-size:11pt">
<div class="gmail-m_-1008470716640573331PlainText"><br>
Date: Wed, 12 Dec 2018 08:48:08 +0000<br>
From: LEUNG Clarence <<a href="mailto:liangxy123@hotmail.com" target="_blank">liangxy123@hotmail.com</a>><br>
To: Quantum Espresso users Forum <<a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a>><br>
Subject: [QE-users] ??:  Huge RAM required for HSE calculation<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:TY2PR04MB3630E51D9DCFAE413EF0002293A70@TY2PR04MB3630.apcprd04.prod.outlook.com" target="_blank">TY2PR04MB3630E51D9DCFAE413EF0002293A70@TY2PR04MB3630.apcprd04.prod.outlook.com</a>><br>
        <br>
Content-Type: text/plain; charset="gb2312"<br>
<br>
Dear federico,<br>
<br>
The error message is<br>
<br>
error: Exceeded job memory limit<br>
error: Step 5242.0 exceeded memory limit (130943908 > 128000000), being killed<br>
<br>
If reduce the number of Kpoint, the calculated Band structure will be not smooth enough.<br>
<br>
Thanks<br>
<br>
LIANG Xiongyi<br>
________________________________<br>
???: users <<a href="mailto:users-bounces@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users-bounces@lists.quantum-espresso.org</a>> ?? IORI, Federico <<a href="mailto:federico.iori@airliquide.com" target="_blank">federico.iori@airliquide.com</a>><br>
????: 2018?12?12? 16:44<br>
???: <a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a><br>
??: Re: [QE-users] Huge RAM required for HSE calculation<br>
<br>
Hi.<br>
<br>
Which is the output error message you get?<br>
<br>
<br>
I am not too expert with HSE in QE, but I suppose the kpoints number is quite large.<br>
Maybe try to reduce the number of kpoints to see if u reproduce the REM error.<br>
Start with a small kpoint mesh and try to increase it gradually until reaching convergence, I would say.<br>
<br>
HTH<br>
With the best<br>
federico<br>
<br>
<br>
On Wed, Dec 12, 2018 at 9:35 AM LEUNG Clarence <<a href="mailto:liangxy123@hotmail.com" target="_blank">liangxy123@hotmail.com</a><mailto:<a href="mailto:liangxy123@hotmail.com" target="_blank">liangxy123@hotmail.com</a>>> wrote:<br>
Dear QE users,<br>
<br>
Recently, I want to calculate the band structure by HSE method. However, the calculation will stop because huge RAM require. From the output file we know that:<br>
<br>
     Estimated static dynamical RAM per process >       8.46 GB<br>
<br>
     Estimated max dynamical RAM per process >       8.59 GB<br>
<br>
     Estimated total dynamical RAM >    1099.85 GB<br>
<br>
I think 1099.85 GB RAM is so huge that it is not reasonable to afford.<br>
<br>
BTW, our server is 2 nodes, 128 threads? 256G RAM. The QE version is 6.3.<br>
<br>
And my input file is<br>
<br>
<br>
&CONTROL<br>
  calculation='scf',<br>
  etot_conv_thr = 3.5D-6 ,<br>
  forc_conv_thr = 4.0D-4 ,<br>
  wf_collect = .true. ,<br>
  verbosity='high',<br>
/<br>
&SYSTEM<br>
  ibrav=14,<br>
  celldm(1)=36.1187133640d0, celldm(2)=0.6119121863d0, celldm(3)=1.3079965678d0,<br>
  celldm(4)=0.0000000000d0, celldm(5)=0.0000000000d0, celldm(6)=0.0000000000d0,<br>
  nat=63,<br>
  ntyp=2,<br>
  ecutwfc=50,<br>
  ecutrho=400,<br>
  input_dft='hse',<br>
  occupations='smearing',<br>
  smearing = 'gaussian' ,<br>
  degauss = 0.002 ,<br>
  vdw_corr = 'DFT-D3' ,<br>
  nspin = 2 ,<br>
  starting_magnetization(1) = 0.5 ,<br>
  nqx1 = 1,<br>
  nqx2 = 1 ,<br>
  nqx3 = 1 ,<br>
/<br>
&ELECTRONS<br>
  conv_thr=1d-06,<br>
  mixing_beta=0.7d0,<br>
  mixing_mode ='local-TF',<br>
/<br>
&IONS<br>
/<br>
ATOMIC_SPECIES<br>
  C 12.010700d0 C_pbe_v1.2.uspp.F.UPF<br>
  P  30.973800d0 P.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF<br>
ATOMIC_POSITIONS {crystal}<br>
P        0.207062953   0.994563394   0.532135751<br>
P        0.042823633   0.994796583   0.465770116<br>
C        0.157559602   0.119473623   0.509211511<br>
C        0.092142096   0.120398444   0.486938482<br>
P        0.453113260   0.016237452   0.533698293<br>
P        0.289980002   0.986689982   0.464529400<br>
C        0.399646081   0.133053286   0.505994952<br>
C        0.335858066   0.117232823   0.482213070<br>
P        0.704320783   0.007706925   0.532982064<br>
P        0.538824580   0.008408401   0.468045855<br>
C        0.654037234   0.132822314   0.511474768<br>
C        0.587848371   0.135094109   0.489114957<br>
P        0.956731588  -0.000006745   0.532145072<br>
P        0.791554157   0.002228032   0.466394516<br>
C        0.907495292   0.125510515   0.509696521<br>
C        0.841931621   0.126642797   0.487430517<br>
P        0.208266817   0.243782922   0.529541853<br>
P        0.043965854   0.246589308   0.464392818<br>
C        0.158728245   0.369838186   0.509463992<br>
C        0.093217169   0.370873210   0.486709312<br>
P        0.424177849   0.286343852   0.516852430<br>
P        0.290089532   0.244400471   0.459582516<br>
C        0.349540011   0.348792825   0.487513040<br>
P        0.705574516   0.255089554   0.532107492<br>
P        0.542012221   0.260506971   0.464249905<br>
C        0.656129286   0.380833823   0.512136142<br>
C        0.590214180   0.381152001   0.490082742<br>
P        0.957108151   0.250073183   0.531244245<br>
P        0.792998637   0.251922321   0.464998669<br>
C        0.907321789   0.375462368   0.510050868<br>
C        0.841746979   0.376334296   0.487596817<br>
P        0.208402877   0.492352243   0.532960869<br>
P        0.043963546   0.496372026   0.465432581<br>
C        0.160144417   0.618157610   0.509696507<br>
C        0.094342113   0.619600026   0.487659242<br>
P        0.471073678   0.513328655   0.548894023<br>
P        0.309129724   0.486227608   0.474070256<br>
C        0.414925399   0.629235003   0.523346545<br>
C        0.350961159   0.616373438   0.499640968<br>
P        0.705395802   0.505478539   0.534378721<br>
P        0.537192856   0.506995560   0.474222102<br>
C        0.656825419   0.631333460   0.511436510<br>
C        0.590845794   0.632466501   0.490389008<br>
P        0.956482750   0.499986748   0.532254831<br>
P        0.791270143   0.501641183   0.466922839<br>
C        0.906923580   0.625196225   0.510129362<br>
C        0.841214140   0.626345388   0.488309739<br>
P        0.207667541   0.743674910   0.533472131<br>
P        0.043998636   0.744658734   0.465730512<br>
C        0.158052412   0.868776604   0.510578825<br>
C        0.092761413   0.869723388   0.488195850<br>
P        0.461194613   0.761061943   0.539728957<br>
P        0.299530254   0.737206731   0.471960596<br>
C        0.407654987   0.881987587   0.515312903<br>
C        0.343486860   0.870097791   0.492007540<br>
P        0.706175574   0.757137135   0.532107627<br>
P        0.539960743   0.756974729   0.469099032<br>
C        0.655720285   0.882343139   0.510585276<br>
C        0.589586421   0.883272199   0.489712695<br>
P        0.956945276   0.749651294   0.531828394<br>
P        0.791991567   0.752132650   0.465926241<br>
C        0.907222485   0.875386768   0.509910655<br>
C        0.841486983   0.876756958   0.488249976<br>
<br>
K_POINTS crystal<br>
54<br>
          0          0.5447405 0.0000000      0.2222222<br>
          0.3333333 0          0.0000000 0.2222222<br>
          0.3333333 0.5447405 0.0000000 0.2222222<br>
         -0.333333333 0.5447405000 0.0000000000 0.2222222<br>
          0          0          0.0000000 0.1111111<br>
        0.0000000000    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.0555555556    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.1111111111    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.1666666667    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.2222222222    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.2777777778    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.3333333333    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.3888888889    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.4444444444    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.0333333333    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.0666666667    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.1000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.1333333333    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.1666666667    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.2000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.2333333333    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.2666666667    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.3000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.3333333333    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.3666666667    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.4000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.4333333333    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.4666666667    0.0000000000    0.0<br>
        0.5000000000    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.4444444444    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.3888888889    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.3333333333    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.2777777778    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.2222222222    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.1666666667    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.1111111111    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.0555555556    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.4666666667    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.4333333333    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.4000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.3666666667    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.3333333333    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.3000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.2666666667    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.2333333333    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.2000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.1666666667    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.1333333333    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.1000000000    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.0666666667    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.0333333333    0.0000000000    0.0<br>
        0.0000000000    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
<br>
Thanks in advance.<br>
<br>
LIANG Xiongyi<br>
City University of Hong Kong<br>
<br>
_______________________________________________<br>
users mailing list<br>
<a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a><mailto:<a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a>><br>
<a href="https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users" id="gmail-m_-1008470716640573331LPlnk938184" class="gmail-m_-1008470716640573331OWAAutoLink" target="_blank">https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users</a><br>
<br>
<br>
--<br>
Federico IORI<br>
<br>
Computational material scientist<br>
<br>
Paris-Saclay Research Center<br>
<br>
1 chemin de la Porte des Loges<<a href="https://www.google.com/maps/place/Air+Liquide/@48.8297381,2.2016685,11.75z/data=!4m5!3m4!1s0x47e67e61a4fbbdc7:0xca3bea9e80059880!8m2!3d48.7630415!4d2.1333045" id="gmail-m_-1008470716640573331LPlnk559746" class="gmail-m_-1008470716640573331OWAAutoLink" target="_blank">https://www.google.com/maps/place/Air+Liquide/@48.8297381,2.2016685,11.75z/data=!4m5!3m4!1s0x47e67e61a4fbbdc7:0xca3bea9e80059880!8m2!3d48.7630415!4d2.1333045</a>><br>
Les Loges en Josas ? 78354 Jouy en Josas cedex<br>
Mail: <a href="mailto:federico.iori@airliquide.com" target="_blank">federico.iori@airliquide.com</a><mailto:<a href="mailto:federico.iori@airliquide.com" target="_blank">federico.iori@airliquide.com</a>><br>
<br>
Phone: +33 7 621 605 15<br>
<br>
[<a href="https://lh5.googleusercontent.com/jWge08q7BtEKOlxuBF_cj804ywzhJmkjw9rEb5dBZLKyUL_HQkVwhcwNi9vtzVTj-EiY-wQhE18VPSACNFaAFCAWvxp6bEwkTDR6-IjGBqp-Y3Afzx-OxN8OHxXYPLS0Dz9tP8fr" id="gmail-m_-1008470716640573331LPlnk567258" class="gmail-m_-1008470716640573331OWAAutoLink" target="_blank">https://lh5.googleusercontent.com/jWge08q7BtEKOlxuBF_cj804ywzhJmkjw9rEb5dBZLKyUL_HQkVwhcwNi9vtzVTj-EiY-wQhE18VPSACNFaAFCAWvxp6bEwkTDR6-IjGBqp-Y3Afzx-OxN8OHxXYPLS0Dz9tP8fr</a>]<br>
<br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://lists.quantum-espresso.org/pipermail/users/attachments/20181212/c8e07893/attachment-0001.html" id="gmail-m_-1008470716640573331LPlnk909470" class="gmail-m_-1008470716640573331OWAAutoLink" target="_blank">http://lists.quantum-espresso.org/pipermail/users/attachments/20181212/c8e07893/attachment-0001.html</a>><br>
<br>
</div>
</span></font></div>
</div>
</div>
</div>
</div>

_______________________________________________<br>
users mailing list<br>
<a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a><br>
<a href="https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users</a></blockquote></div><br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>Paolo Giannozzi, Dip. Scienze Matematiche Informatiche e Fisiche,<br>Univ. Udine, via delle Scienze 208, 33100 Udine, Italy<br>Phone +39-0432-558216, fax +39-0432-558222<br><br></div></div></div></div></div>