<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=gb2312">
<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>
</head>
<body dir="ltr">
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Dear <span style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: "Microsoft Yahei UI", Verdana, Simsun, "Segoe UI", -apple-system, BlinkMacSystemFont, Roboto, "Helvetica Neue", sans-serif; font-size: 15px; background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline !important">federico,</span></div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<span style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: "Microsoft Yahei UI", Verdana, Simsun, "Segoe UI", -apple-system, BlinkMacSystemFont, Roboto, "Helvetica Neue", sans-serif; font-size: 15px; background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline !important"><br>
</span></div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<span style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: "Microsoft Yahei UI", Verdana, Simsun, "Segoe UI", -apple-system, BlinkMacSystemFont, Roboto, "Helvetica Neue", sans-serif; font-size: 15px; background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline !important">The
 error message is </span></div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<span style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: "Microsoft Yahei UI", Verdana, Simsun, "Segoe UI", -apple-system, BlinkMacSystemFont, Roboto, "Helvetica Neue", sans-serif; font-size: 15px; background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline !important"><br>
</span></div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<span style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: "Microsoft Yahei UI", Verdana, Simsun, "Segoe UI", -apple-system, BlinkMacSystemFont, Roboto, "Helvetica Neue", sans-serif; font-size: 15px; background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline !important"><span>error:
 Exceeded job memory limit<br>
</span><span>error: Step 5242.0 exceeded memory limit (130943908 > 128000000), being killed</span><br>
</span></div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<span style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: "Microsoft Yahei UI", Verdana, Simsun, "Segoe UI", -apple-system, BlinkMacSystemFont, Roboto, "Helvetica Neue", sans-serif; font-size: 15px; background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline !important"><span><br>
</span></span></div>
<div style=""><font color="#212121"><span style="font-size: 15px;">If reduce the number of Kpoint, the calculated Band structure will be not smooth enough.</span></font></div>
<div style=""><font color="#212121"><span style="font-size: 15px;"><br>
</span></font></div>
<div style=""><font color="#212121"><span style="font-size: 15px;">Thanks</span></font></div>
<div style=""><font color="#212121"><span style="font-size: 15px;"><br>
</span></font></div>
<div style=""><font color="#212121"><span style="font-size: 15px;">LIANG Xiongyi</span></font></div>
<div id="appendonsend"></div>
<hr style="display:inline-block;width:98%" tabindex="-1">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" style="font-size:11pt" color="#000000"><b>发件人:</b> users <users-bounces@lists.quantum-espresso.org> 代表 IORI, Federico <federico.iori@airliquide.com><br>
<b>发送时间:</b> 2018年12月12日 16:44<br>
<b>收件人:</b> users@lists.quantum-espresso.org<br>
<b>主题:</b> Re: [QE-users] Huge RAM required for HSE calculation</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div dir="ltr">Hi.
<div><br>
</div>
<div>Which is the output error message you get? </div>
<div> <br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>I am not too expert with HSE in QE, but I suppose the kpoints number is quite large.</div>
<div>Maybe try to reduce the number of kpoints to see if u reproduce the REM error. </div>
<div>Start with a small kpoint mesh and try to increase it gradually until reaching convergence, I would say.</div>
<div><br>
</div>
<div>HTH</div>
<div>With the best</div>
<div>federico <br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div class="x_gmail_quote">
<div dir="ltr">On Wed, Dec 12, 2018 at 9:35 AM LEUNG Clarence <<a href="mailto:liangxy123@hotmail.com" target="_blank">liangxy123@hotmail.com</a>> wrote:<br>
</div>
<blockquote class="x_gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex; border-left:1px solid rgb(204,204,204); padding-left:1ex">
<div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
Dear QE users,</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
Recently, I want to calculate the band structure by HSE method. However, the calculation will stop because huge RAM require. From the output file we know that:</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<span>     Estimated static dynamical RAM per process >       8.46 GB<br>
</span>
<div><br>
</div>
<div>     Estimated max dynamical RAM per process >       8.59 GB<br>
</div>
<div><br>
</div>
<span>     Estimated total dynamical RAM >    1099.85 GB</span><br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<span><br>
</span></div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<span>I think <span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; background-color:rgb(255,255,255); display:inline">1099.85 GB RAM is so huge that it is not reasonable to afford.</span></span></div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<span><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; background-color:rgb(255,255,255); display:inline"><br>
</span></span></div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<span><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; background-color:rgb(255,255,255); display:inline">BTW, our server is 2 nodes, 128 threads, 256G RAM. The QE version is 6.3.</span></span></div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<span><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; background-color:rgb(255,255,255); display:inline"><br>
</span></span></div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<span><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; background-color:rgb(255,255,255); display:inline">And my input file is </span></span></div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<span><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; background-color:rgb(255,255,255); display:inline"><br>
</span></span></div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<span><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; background-color:rgb(255,255,255); display:inline"><span><br>
</span>
<div>&CONTROL<br>
</div>
<div>  calculation='scf',</div>
<div>  etot_conv_thr = 3.5D-6 ,<br>
</div>
<div>  forc_conv_thr = 4.0D-4 ,</div>
<div>  wf_collect = .true. ,<br>
</div>
<div>  verbosity='high',</div>
<div>/</div>
<div>&SYSTEM<br>
</div>
<div>  ibrav=14,<br>
</div>
<div>  celldm(1)=36.1187133640d0, celldm(2)=0.6119121863d0, celldm(3)=1.3079965678d0,<br>
</div>
<div>  celldm(4)=0.0000000000d0, celldm(5)=0.0000000000d0, celldm(6)=0.0000000000d0,<br>
</div>
<div>  nat=63,<br>
</div>
<div>  ntyp=2,<br>
</div>
<div>  ecutwfc=50,<br>
</div>
<div>  ecutrho=400,<br>
</div>
<div>  input_dft='hse',<br>
</div>
<div>  occupations='smearing',<br>
</div>
<div>  smearing = 'gaussian' ,<br>
</div>
<div>  degauss = 0.002 ,<br>
</div>
<div>  vdw_corr = 'DFT-D3' ,<br>
</div>
<div>  nspin = 2 ,<br>
</div>
<div>  starting_magnetization(1) = 0.5 ,<br>
</div>
<div>  nqx1 = 1,<br>
</div>
<div>  nqx2 = 1 ,<br>
</div>
<div>  nqx3 = 1 ,<br>
</div>
<div>/<br>
</div>
<div>&ELECTRONS<br>
</div>
<div>  conv_thr=1d-06,<br>
</div>
<div>  mixing_beta=0.7d0,<br>
</div>
<div>  mixing_mode ='local-TF',<br>
</div>
<div>/<br>
</div>
<div>&IONS<br>
</div>
<div>/</div>
<div>ATOMIC_SPECIES<br>
</div>
<div>  C 12.010700d0 C_pbe_v1.2.uspp.F.UPF<br>
</div>
<div>  P  30.973800d0 P.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF</div>
<div>ATOMIC_POSITIONS {crystal}<br>
</div>
<div>P        0.207062953   0.994563394   0.532135751<br>
</div>
<div>P        0.042823633   0.994796583   0.465770116<br>
</div>
<div>C        0.157559602   0.119473623   0.509211511<br>
</div>
<div>C        0.092142096   0.120398444   0.486938482<br>
</div>
<div>P        0.453113260   0.016237452   0.533698293<br>
</div>
<div>P        0.289980002   0.986689982   0.464529400<br>
</div>
<div>C        0.399646081   0.133053286   0.505994952<br>
</div>
<div>C        0.335858066   0.117232823   0.482213070<br>
</div>
<div>P        0.704320783   0.007706925   0.532982064<br>
</div>
<div>P        0.538824580   0.008408401   0.468045855<br>
</div>
<div>C        0.654037234   0.132822314   0.511474768<br>
</div>
<div>C        0.587848371   0.135094109   0.489114957<br>
</div>
<div>P        0.956731588  -0.000006745   0.532145072<br>
</div>
<div>P        0.791554157   0.002228032   0.466394516<br>
</div>
<div>C        0.907495292   0.125510515   0.509696521<br>
</div>
<div>C        0.841931621   0.126642797   0.487430517<br>
</div>
<div>P        0.208266817   0.243782922   0.529541853<br>
</div>
<div>P        0.043965854   0.246589308   0.464392818<br>
</div>
<div>C        0.158728245   0.369838186   0.509463992<br>
</div>
<div>C        0.093217169   0.370873210   0.486709312<br>
</div>
<div>P        0.424177849   0.286343852   0.516852430<br>
</div>
<div>P        0.290089532   0.244400471   0.459582516<br>
</div>
<div>C        0.349540011   0.348792825   0.487513040<br>
</div>
<div>P        0.705574516   0.255089554   0.532107492<br>
</div>
<div>P        0.542012221   0.260506971   0.464249905<br>
</div>
<div>C        0.656129286   0.380833823   0.512136142<br>
</div>
<div>C        0.590214180   0.381152001   0.490082742<br>
</div>
<div>P        0.957108151   0.250073183   0.531244245<br>
</div>
<div>P        0.792998637   0.251922321   0.464998669<br>
</div>
<div>C        0.907321789   0.375462368   0.510050868<br>
</div>
<div>C        0.841746979   0.376334296   0.487596817<br>
</div>
<div>P        0.208402877   0.492352243   0.532960869<br>
</div>
<div>P        0.043963546   0.496372026   0.465432581<br>
</div>
<div>C        0.160144417   0.618157610   0.509696507<br>
</div>
<div>C        0.094342113   0.619600026   0.487659242<br>
</div>
<div>P        0.471073678   0.513328655   0.548894023<br>
</div>
<div>P        0.309129724   0.486227608   0.474070256<br>
</div>
<div>C        0.414925399   0.629235003   0.523346545<br>
</div>
<div>C        0.350961159   0.616373438   0.499640968<br>
</div>
<div>P        0.705395802   0.505478539   0.534378721<br>
</div>
<div>P        0.537192856   0.506995560   0.474222102<br>
</div>
<div>C        0.656825419   0.631333460   0.511436510<br>
</div>
<div>C        0.590845794   0.632466501   0.490389008<br>
</div>
<div>P        0.956482750   0.499986748   0.532254831<br>
</div>
<div>P        0.791270143   0.501641183   0.466922839<br>
</div>
<div>C        0.906923580   0.625196225   0.510129362<br>
</div>
<div>C        0.841214140   0.626345388   0.488309739<br>
</div>
<div>P        0.207667541   0.743674910   0.533472131<br>
</div>
<div>P        0.043998636   0.744658734   0.465730512<br>
</div>
<div>C        0.158052412   0.868776604   0.510578825<br>
</div>
<div>C        0.092761413   0.869723388   0.488195850<br>
</div>
<div>P        0.461194613   0.761061943   0.539728957<br>
</div>
<div>P        0.299530254   0.737206731   0.471960596<br>
</div>
<div>C        0.407654987   0.881987587   0.515312903<br>
</div>
<div>C        0.343486860   0.870097791   0.492007540<br>
</div>
<div>P        0.706175574   0.757137135   0.532107627<br>
</div>
<div>P        0.539960743   0.756974729   0.469099032<br>
</div>
<div>C        0.655720285   0.882343139   0.510585276<br>
</div>
<div>C        0.589586421   0.883272199   0.489712695<br>
</div>
<div>P        0.956945276   0.749651294   0.531828394<br>
</div>
<div>P        0.791991567   0.752132650   0.465926241<br>
</div>
<div>C        0.907222485   0.875386768   0.509910655<br>
</div>
<div>C        0.841486983   0.876756958   0.488249976<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>K_POINTS crystal<br>
</div>
<div>54<br>
</div>
<div>          0          0.5447405 0.0000000      0.2222222<br>
</div>
<div>          0.3333333 0          0.0000000 0.2222222<br>
</div>
<div>          0.3333333 0.5447405 0.0000000 0.2222222<br>
</div>
<div>         -0.333333333 0.5447405000 0.0000000000 0.2222222<br>
</div>
<div>          0          0          0.0000000 0.1111111<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0555555556    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.1111111111    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.1666666667    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.2222222222    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.2777777778    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.3333333333    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.3888888889    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.4444444444    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.0333333333    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.0666666667    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.1000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.1333333333    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.1666666667    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.2000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.2333333333    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.2666666667    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.3000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.3333333333    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.3666666667    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.4000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.4333333333    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.4666666667    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.5000000000    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.4444444444    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.3888888889    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.3333333333    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.2777777778    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.2222222222    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.1666666667    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.1111111111    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0555555556    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.5000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.4666666667    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.4333333333    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.4000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.3666666667    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.3333333333    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.3000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.2666666667    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.2333333333    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.2000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.1666666667    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.1333333333    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.1000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.0666666667    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.0333333333    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div>        0.0000000000    0.0000000000    0.0000000000    0.0<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks in advance.</div>
<div><br>
</div>
<div>LIANG Xiongyi</div>
<div>City University of Hong Kong</div>
<span></span><br>
</span></span></div>
</div>
_______________________________________________<br>
users mailing list<br>
<a href="mailto:users@lists.quantum-espresso.org" target="_blank">users@lists.quantum-espresso.org</a><br>
<a href="https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users</a></blockquote>
</div>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
<div dir="ltr" class="x_m_-7766243420722969835gmail_signature">
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div><span style="background-color:transparent; font-family:Arial; font-size:10pt; font-weight:700; white-space:pre-wrap">Federico IORI</span><br>
</div>
<div><span>
<p dir="ltr" style="line-height:1.38; margin-top:0pt; margin-bottom:0pt"><span style="font-size:10pt; font-family:Arial; background-color:transparent; font-style:italic; vertical-align:baseline; white-space:pre-wrap">Computational material scientist</span></p>
<p style="line-height:1.38; margin-top:0pt; margin-bottom:0pt"><span style="background-color:transparent; color:rgb(61,133,198); font-family:Arial; font-size:11pt; font-style:italic; font-weight:700; white-space:pre-wrap">Paris-Saclay Research Center</span></p>
<p dir="ltr" style="line-height:1.38; margin-top:0pt; margin-bottom:0pt"><span style="font-size:9pt; font-family:Arial; background-color:transparent; vertical-align:baseline; white-space:pre-wrap"><a href="https://www.google.com/maps/place/Air+Liquide/@48.8297381,2.2016685,11.75z/data=!4m5!3m4!1s0x47e67e61a4fbbdc7:0xca3bea9e80059880!8m2!3d48.7630415!4d2.1333045" target="_blank" style="color:rgb(17,85,204); font-family:arial,sans-serif; font-size:12.8px; white-space:normal">1
 chemin de la Porte des Loges</a><br style="font-family:arial,sans-serif; font-size:12.8px; white-space:normal">
<span style="font-family:arial,sans-serif; font-size:12.8px; white-space:normal">Les Loges en Josas – 78354 Jouy en Josas cedex</span><br style="font-family:arial,sans-serif; font-size:12.8px; white-space:normal">
<span style="font-family:arial,sans-serif; font-size:12.8px; white-space:normal">Mail</span><span style="font-family:arial,sans-serif; font-size:12.8px; white-space:normal">: <a href="mailto:federico.iori@airliquide.com" target="_blank">federico.iori@airliquide.com</a></span><br>
</span></p>
<p dir="ltr" style="line-height:1.38; margin-top:0pt; margin-bottom:0pt"><span style="font-size:9pt; font-family:Arial; background-color:transparent; vertical-align:baseline; white-space:pre-wrap">Phone: +33 7 621 605 15</span></p>
<p dir="ltr" style="line-height:1.38; margin-top:0pt; margin-bottom:0pt"><span style="font-size:9pt; font-family:Arial; background-color:transparent; vertical-align:baseline; white-space:pre-wrap"><img width="165" height="40" style="border:none" src="https://lh5.googleusercontent.com/jWge08q7BtEKOlxuBF_cj804ywzhJmkjw9rEb5dBZLKyUL_HQkVwhcwNi9vtzVTj-EiY-wQhE18VPSACNFaAFCAWvxp6bEwkTDR6-IjGBqp-Y3Afzx-OxN8OHxXYPLS0Dz9tP8fr"></span></p>
<p dir="ltr" style="line-height:1.38; margin-top:0pt; margin-bottom:0pt"><br>
</p>
</span></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>