<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head>
<title></title>
</head>
<body>
<div name="messageBodySection" style="font-size: 14px; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, sans-serif;">Dear TaeHwan Moon,
<div><br /></div>
<div>I’m sorry for the typo(ion_positions->atomic_positions )</div>
<div><br /></div>
<div>Did you check your output?</div>
<div><br /></div>
<div>In the standard output, you can find “estimated …..RAM ….” lines.</div>
<div><br /></div>
<div>and you can check real memory usage of your computer via linux command “free”</div>
<div><br /></div>
<div>If physical memory of your computer is not enough, “Swap” will be increased</div>
<div><br /></div>
<div>Sincerly,</div>
</div>
<div name="messageSignatureSection" style="font-size: 14px; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, sans-serif;"><br />
Minho Lee<br />
------------------------<br />
Minho Lee<br />
CEO/Developer<br />
T. 02-3293-0204 | C. 010-2770-4080<br />
E. mino@virtuallab.co.kr | H. http://www.virtuallab.co.kr<br />
<br />
On-demand Materials Simulation<br />
https://www.materialssquare.com</div>
<div name="messageReplySection" style="font-size: 14px; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, sans-serif;">On 7 Sep 2018, 9:51 AM +0900, 문태환 <th4512@cau.ac.kr>, wrote:<br />
<blockquote type="cite" style="margin: 5px 5px; padding-left: 10px; border-left: thin solid #1abc9c;">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"></p>
<div>Dear Minho Lee, </div>
<div><br /></div>
<div>Thank you for your kind reply.</div>
<div><br /></div>
<div>If you are talking about ATOMIC_POSITIONS, I thought I took a lot of text, so I excluded it when I wrote!</div>
<div><br /></div>
<div>I have run the calculations by reducing the Processes (MPI) to 4, but the calculations are still going smoothly without exceeding the memory.</div>
<div><br /></div>
<div>But my PC does not use CPU well and calculation speed is slow.</div>
<div><br /></div>
<div>Like the Gaussian program,</div>
<div><br /></div>
<div>Do you know how to control the memory while allocating a lot of CPU in the calculation?</div>
<br />
<p></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br /></p>
<div id="Signature">
<div id="divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif, EmojiFont, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols;">
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0">-------------------------------------</p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0">Moon TaeHwan</p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0">Chung-Ang University</p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0">th4512@cau.ac.kr</p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:16px"><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:16px">-------------------------------------</span></span><br /></p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><br /></p>
</div>
</div>
</div>
<hr style="display:inline-block;width:98%" tabindex="-1" />
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" style="font-size:11pt" color="#000000"><b>보낸 사람:</b> Minho Lee <mino@simulation.re.kr> 대신 users <users-bounces@lists.quantum-espresso.org><br />
<b>보낸 날짜:</b> 2018년 9월 6일 목요일 오후 8:17:16<br />
<b>받는 사람:</b> users@lists.quantum-espresso.org; Quantum Espresso users Forum<br />
<b>제목:</b> Re: [QE-users] (no subject)</font>
<div> </div>
</div>
<meta content="text/html; charset=utf-8" />
<div>
<div name="x_messageBodySection" style="font-size:14px">Dear Taehwan Moon,
<div><br /></div>
<div>I can’t find the &ION namelist in your script,</div>
<div><br /></div>
<div>I think you need to set ion_positions</div>
<div><br /></div>
<div>Sincerely,</div>
</div>
<div name="x_messageSignatureSection" style="font-size:14px"><br />
Minho Lee<br />
------------------------<br />
Minho Lee<br />
CEO/Developer<br />
T. 02-3293-0204 | C. 010-2770-4080<br />
E. mino@virtuallab.co.kr | H. http://www.virtuallab.co.kr<br />
<br />
On-demand Materials Simulation<br />
https://www.materialssquare.com</div>
<div name="x_messageReplySection" style="font-size:14px">On 2018년 9월 6일 PM 7:48 +0900, 문태환 <th4512@cau.ac.kr>, wrote:<br />
<blockquote type="cite" style="margin: 5px 5px; padding-left: 10px; border-left: thin solid #e67e22;">
<div id="x_divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt; color:#000000; font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif">
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"></p>
<div>Hello! Quantum espresso users.</div>
<div>I am a beginner user of QE and Linux, and I am having a lot of computation difficulties.</div>
<div>I need to calculate the SCF, DOS, and Band structure using a CIF file with zero-dimensional organic-inorganic hybrid materials.</div>
<div>However, when the SCF calculation starts and after an hour or so has elapsed, the memory problem causes an error.</div>
<div>My computer has 32 core CPU and 64GB of memory.  <span>In the case of the CPU, there is room for using 8 cores when executing calculations.</span></div>
<div><span><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">(Processes (MPI) and Threads (openMP) use 8 and 4, respectively.)</span><br /></span></div>
<div><span><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px"><br /></span></span></div>
<div>The input file looks like this:</div>
<div><br /></div>
<div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">Can you give me advice to solve this problem?</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">Please help me .. Thank you.</div>
<br /></div>
<div><br /></div>
<div>&CONTROL</div>
<div>    calculation  = "scf"</div>
<div>    max_seconds  =  8.64000e+04</div>
<div>    pseudo_dir   = "/home/user/.burai/.pseudopot"</div>
<div>    restart_mode = "from_scratch"</div>
<div>    tprnfor      = .FALSE.</div>
<div>    tstress      = .FALSE.</div>
<div>/</div>
<div><br /></div>
<div>&SYSTEM</div>
<div>    a                         =  1.19962e+01</div>
<div>    b                         =  1.46765e+01</div>
<div>    c                         =  1.38899e+01</div>
<div>    constrained_magnetization = "none"</div>
<div>    cosac                     = -5.92053e-02</div>
<div>    degauss                   =  1.00000e-02</div>
<div>    ecutrho                   =  5.06000e+02</div>
<div>    ecutwfc                   =  5.62066e+01</div>
<div>    ibrav                     = -12</div>
<div>    lda_plus_u                = .FALSE.</div>
<div>    nat                       = 192</div>
<div>    nosym                     = .FALSE.</div>
<div>    nspin                     = 1</div>
<div>    ntyp                      = 5</div>
<div>    occupations               = "smearing"</div>
<div>    smearing                  = "guassian"</div>
<div>    starting_magnetization(1) =  0.00000e+00</div>
<div>/</div>
<div><br /></div>
<div>&ELECTRONS</div>
<div>    conv_thr         =  1.00000e-06</div>
<div>    diago_david_ndim = 4</div>
<div>    diagonalization  = "david"</div>
<div>    electron_maxstep = 100</div>
<div>    mixing_beta      =  7.00000e-01</div>
<div>    mixing_mode      = "plain"</div>
<div>    mixing_ndim      = 8</div>
<div>    startingpot      = "atomic"</div>
<div>    startingwfc      = "atomic+random"</div>
<div>/</div>
<div><br /></div>
<div>K_POINTS {automatic}</div>
<div> 3  3  3  0 0 0</div>
<div><br /></div>
<div>ATOMIC_SPECIES</div>
<div>Bi    208.98038  Bi.pbe-dn-kjpaw_psl.1.0.0.UPF</div>
<div>Br     79.90400  Br.pbe-dn-kjpaw_psl.1.0.0.UPF</div>
<div>N      14.00674  N.pbe-n-kjpaw_psl.1.0.0.UPF</div>
<div>H       1.00794  H.pbe-kjpaw_psl.1.0.0.UPF</div>
<div>C      12.01070  C.pbe-n-kjpaw_psl.1.0.0.UPF</div>
<div><br /></div>
<br />
<p></p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><br /></p>
<div id="x_Signature">
<div id="x_divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt; color:rgb(0,0,0); font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0">-------------------------------------</p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0">Moon TaeHwan</p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0">Chung-Ang University</p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0">th4512@cau.ac.kr</p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:16px"><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:16px">-------------------------------------</span></span><br /></p>
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><br /></p>
</div>
</div>
</div>
_______________________________________________<br />
users mailing list<br />
users@lists.quantum-espresso.org<br />
https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users<br /></blockquote>
<div></div>
</div>
</div>
_______________________________________________<br />
users mailing list<br />
users@lists.quantum-espresso.org<br />
https://lists.quantum-espresso.org/mailman/listinfo/users<br /></blockquote>
</div>
</body>
</html>