<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=utf-8"><meta name=Generator content="Microsoft Word 15 (filtered medium)"><style><!--
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Is it the normal behavior for “vc-relax” calculation that we cannot fix selected atomic positions or am I doing some mistake in the input file?<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>My input file looks like this:<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>&CONTROL<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> calculation = "vc-relax"<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> forc_conv_thr = 1.00000e-03<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> max_seconds = 1.72800e+05<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> nstep = 100<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> pseudo_dir = "/home/pseudo"<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>/<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>&SYSTEM<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> a = 5.01090e+00<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> b = 8.66290e+00<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> c = 5.09222e+00<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cosac = -3.33412e-01<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> degauss = 1.00000e-02<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> ecutrho = 2.20000e+02<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> ecutwfc = 5.50000e+01<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> hubbard_u(2) = 3.90000e+00<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> ibrav = 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> lda_plus_u = .TRUE.<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> nat = 24<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> nspin = 2<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> ntyp = 3<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> occupations = "smearing"<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> smearing = "gaussian"<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> starting_magnetization(1) = 0.00000e+00<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> starting_magnetization(2) = 2.00000e-01<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> starting_magnetization(3) = 0.00000e+00<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>/<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>&ELECTRONS<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> conv_thr = 1.00000e-06<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> electron_maxstep = 200<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> mixing_beta = 4.00000e-01<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> startingpot = "atomic"<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> startingwfc = "atomic+random"<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>/<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>&IONS<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> ion_dynamics = "bfgs"<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>/<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>&CELL<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cell_dynamics = "bfgs"<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> press_conv_thr = 5.00000e-01<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>/<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>K_POINTS {automatic}<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> 2 1 2 0 0 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>CELL_PARAMETERS {angstrom}<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> 5.010900 0.000000 0.000000<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> 0.000000 8.662900 0.000000<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> -1.697807 0.000000 4.800849<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>ATOMIC_SPECIES<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Li 6.94100 Li.pbe-s-kjpaw_psl.1.0.0.UPF<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Mn 54.93805 Mn.pbe-spn-kjpaw_psl.1.0.0.UPF<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 15.99940 O.pbe-n-kjpaw_psl.1.0.0.UPF<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>ATOMIC_POSITIONS {crystal}<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Li 0.000000 0.338869 0.500000 0 1 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Li 0.000000 0.661131 0.500000 0 1 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Li 0.500000 0.838869 0.500000 0 1 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Li 0.500000 0.161131 0.500000 0 1 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Li 0.000000 0.000000 0.500000 0 0 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Li 0.500000 0.500000 0.500000 0 0 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Li 0.000000 0.500000 0.000000 0 0 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Li 0.500000 0.000000 0.000000 0 0 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Mn 0.000000 0.167106 0.000000 0 1 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Mn 0.000000 0.832894 0.000000 0 1 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Mn 0.500000 0.667106 0.000000 0 1 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Mn 0.500000 0.332894 0.000000 0 1 0<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 0.245825 0.178664 0.776064<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 0.754168 0.821336 0.223935<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 0.754168 0.178664 0.223935<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 0.245825 0.821336 0.776064<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 0.745825 0.678664 0.776064<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 0.254167 0.321336 0.223935<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 0.254167 0.678664 0.223935<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 0.745825 0.321336 0.776064<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 0.219093 0.000000 0.227663 1 0 1<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 0.780899 0.000000 0.772336 1 0 1<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 0.719094 0.500000 0.227663 1 0 1<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>O 0.280899 0.500000 0.772336 1 0 1<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>Thanks,<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>Shoaib Muhammad<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Post-Doctoral Research Fellow<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Department of Energy Science<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Sungkyunkwan University<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Korea<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p></div></body></html>