<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body dir="auto">
<div><br>
</div>
You need to be able to follow genuine diffusion - eg a liquid, a superionic, a fast interstitial...
<div><br>
</div>
<div>If you fold, your msd will always tend to a constant (rather than eg a straight line with finite slope, as a function of time).</div>
<div><br>
</div>
<div>Nic<br>
<br>
<div id="AppleMailSignature">Sent from a tiny keyboard... Contact info:
<div>
<div><a href="http://theossrv1.epfl.ch/Main/Contact">http://theossrv1.epfl.ch/Main/Contact</a></div>
</div>
</div>
<div><br>
On 30 Oct 2017, at 10:13, Lorenzo Paulatto <<a href="mailto:paulatz@gmail.com">paulatz@gmail.com</a>> wrote:<br>
<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div><span></span><br>
<span>On 30/10/17 10:09, Marzari Nicola wrote:</span><br>
<blockquote type="cite"><span>?? For MSD you should not fold back.</span><br>
</blockquote>
<span></span><br>
<span>Re-reading the question i think you are right. But I also think that it </span>
<br>
<span>should not matter, i.e. that each atom should always stay close to its </span>
<br>
<span>initial position. If it matters the displacements are too large, maybe </span>
<br>
<span>the timestep is too large if doing molecular dynamics?</span><br>
<span></span><br>
<span>cheers</span><br>
<span></span><br>
<span>-- </span><br>
<span>Lorenzo Paulatto - Paris</span><br>
<span>_______________________________________________</span><br>
<span>Pw_forum mailing list</span><br>
<span><a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a></span><br>
<span><a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a></span><br>
</div>
</blockquote>
</div>
</body>
</html>