
<html>


<head>


<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">


</head>


<body dir="auto">


<div><br>


</div>


<div><br>


</div>


?? For MSD you should not fold back.<br>


<br>


<div id="AppleMailSignature">Sent from a tiny keyboard... Contact info:


<div>


<div><a href="http://theossrv1.epfl.ch/Main/Contact">http://theossrv1.epfl.ch/Main/Contact</a></div>


</div>


</div>


<div><br>


On 30 Oct 2017, at 09:19, Nam Tran <<a href="mailto:vnt981@uowmail.edu.au">vnt981@uowmail.edu.au</a>> wrote:<br>


<br>


</div>


<blockquote type="cite">


<div>


<meta name="Generator" content="Microsoft Exchange Server">


<!-- converted from text --><style><!-- .EmailQuote { margin-left: 1pt; padding-left: 4pt; border-left: #800000 2px solid; } --></style>


<meta content="text/html; charset=UTF-8">


<div dir="ltr">


<div id="x_divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt; color:#000000; font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif">


<p>Dear Lorenzo and Pascal</p>


<p><br>


</p>


<p>Thank you so much for your kind replies. </p>


<p><br>


</p>


<p>Best Regards, </p>


<p>Nam Tran</p>


</div>


<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">


<div id="x_divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b>


<a href="mailto:pw_forum-bounces@pwscf.org">pw_forum-bounces@pwscf.org</a> <<a href="mailto:pw_forum-bounces@pwscf.org">pw_forum-bounces@pwscf.org</a>> on behalf of Lorenzo Paulatto <<a href="mailto:paulatz@gmail.com">paulatz@gmail.com</a>><br>


<b>Sent:</b> Monday, October 30, 2017 7:10:17 PM<br>


<b>To:</b> <a href="mailto:pw_forum@pwscf.org">pw_forum@pwscf.org</a><br>


<b>Subject:</b> Re: [Pw_forum] How to calculate Mean Square Displacement (MSD)</font>


<div> </div>


</div>


</div>


<font size="2"><span style="font-size:10pt;">


<div class="PlainText">On 30/10/17 08:29, Nam Tran wrote:<br>


> I do not know whether I should consider the distance with atom that goes <br>


> about outside the box (a) or its image (b). Please check the image below <br>


<br>


Usually the right thing is to consider the smallest of all the possible <br>


distances. I.e. you put the red atom in all the positions which are <br>


equivalent by periodic boundary conditions, these in principle are <br>


infinite but going up to the second neighboring cell is usually more <br>


than enough; for each case you take the distance with the blue atom, and <br>


you take the minimum of all the distances.<br>


<br>


kind regards<br>


<br>


<br>


-- <br>


Lorenzo Paulatto - Paris<br>


_______________________________________________<br>


Pw_forum mailing list<br>


<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br>


<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>


</div>


</span></font></div>


</blockquote>


<blockquote type="cite">


<div><span>_______________________________________________</span><br>


<span>Pw_forum mailing list</span><br>


<span><a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a></span><br>


<span><a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a></span></div>


</blockquote>


</body>


</html>