<div dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">Dear all,</span><div style="font-size:12.8px">I am doing the calculations of water confinement between graphene sheets. I have done all the relaxation calculations. After relaxation I found the total energy of the graphene sheet, I also need  to find the total energy of the water molecule to get the total binding energy of the system.</div><div style="font-size:12.8px">My question is, to find the total energy of the water molecule what should be the crystal structure of water and how I create the unit cell of water.</div><div style="font-size:12.8px">Thanks in advance.</div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d" style="font-size:12.8px"><i>Mohammad Ubaid</i></font><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d"><i>PhD Research Scholar</i></font></div><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d"><i>Department of Physics</i></font></div><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d"><i>Jamia Millia Islamia University</i></font></div><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d"><i>New Delhi - 110025</i></font></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Mon, Jun 19, 2017 at 3:51 PM, Ubaid Mohd <span dir="ltr"><<a href="mailto:onlymubaid@gmail.com" target="_blank">onlymubaid@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Thanks Sir<div><br></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d" style="font-size:12.8px"><i>Mohammad Ubaid</i></font><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d"><i>PhD Research Scholar</i></font></div><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d"><i>Department of Physics</i></font></div><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d"><i>Jamia Millia Islamia University</i></font></div><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d"><i>New Delhi - 110025</i></font></div></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="m_-9065789144720307752gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d" style="font-size:12.8px"><i>Mohammad Ubaid</i></font><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d"><i>PhD Research Scholar</i></font></div><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d"><i>Department of Physics</i></font></div><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d"><i>Jamia Millia Islamia University</i></font></div><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#0c343d"><i>New Delhi - 110025</i></font></div></div></div></div><div><div class="h5">
<br><div class="gmail_quote">On Mon, Jun 19, 2017 at 3:50 PM, Giovanni Cantele <span dir="ltr"><<a href="mailto:giovanni.cantele@spin.cnr.it" target="_blank">giovanni.cantele@spin.cnr.it</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word">Users of this forum are usually kindly requested to provide their name and affiliation, when posting messages!!!!!!!!  ;-)<br><div><br></div><div>The scf run reads the position in the input file, whichever run has come before. nscf read positions from outdir, if any</div><span class="m_-9065789144720307752HOEnZb"><font color="#888888"><div><br></div><div>Giovanni</div></font></span><div><div class="m_-9065789144720307752h5"><div><br><blockquote type="cite"><div>On 19 Jun 2017, at 12:14, Ubaid Mohd <<a href="mailto:onlymubaid@gmail.com" target="_blank">onlymubaid@gmail.com</a>> wrote:</div><br class="m_-9065789144720307752m_2013373869659069848Apple-interchange-newline"><div><div dir="ltr">Then only for scf run, following the relaxation run, whether we use initial coordinates or optimized coordinates</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jun 19, 2017 at 3:29 PM, Giovanni Cantele <span dir="ltr"><<a href="mailto:giovanni.cantele@spin.cnr.it" target="_blank">giovanni.cantele@spin.cnr.it</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Users of this forum are usually kindly requested to provide their name and affiliation, when posting messages!  ;-)<br>
<br>
If, after a relaxation run, you execute an nscf (e.g. for band structure or DOS ) calculation, the code will automatically read optimised positions from outdir, even though the input file contains the initial coordinates. On the other hand, for an scf run, following a relaxation run, even though the outdir contains information about the relaxed coordinates, pw.x will always use the positions specified in the input file (you might want to calculate total energy and other properties at geometries other than the relaxed one).<br>
<br>
Giovanni<br>
<span><br>
<br>
> On 19 Jun 2017, at 09:58, Ubaid Mohd <<a href="mailto:onlymubaid@gmail.com" target="_blank">onlymubaid@gmail.com</a>> wrote:<br>
><br>
> Dear all,<br>
> I have run some relaxed calculations. In case of scf /nscf/band calculations what coordinates should I be use, optimized coordinates from relaxed output file or by default it takes from prefix<br>
</span>> ______________________________<wbr>_________________<br>
> Pw_forum mailing list<br>
> <a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
> <a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" rel="noreferrer" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listi<wbr>nfo/pw_forum</a><br>
<br>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" rel="noreferrer" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listi<wbr>nfo/pw_forum</a><br>
</blockquote></div><br></div>
______________________________<wbr>_________________<br>Pw_forum mailing list<br><a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a><br><a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listi<wbr>nfo/pw_forum</a></div></blockquote></div><br></div></div></div><br>______________________________<wbr>_________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" rel="noreferrer" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listi<wbr>nfo/pw_forum</a><br></blockquote></div><br></div></div></div>
</blockquote></div><br></div>