<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:arial black,sans-serif"><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jun 12, 2017 at 3:24 PM, SMITH, BRIGETTE <span dir="ltr"><<a href="mailto:basmith@coe.edu" target="_blank">basmith@coe.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello,<div>I am an undergraduate student looking to find a way to calculate Lennard-Jones  potentials for Uranium for Molecular Dynamics simulations. I am looking for the potentials between Uranium and Uranium, Uranium and Nitrogen, Uranium and Hydrogen, etc. If anyone could direct me to an example it would be sincerely appreciated.</div></div></blockquote><div><br></div><div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif">​brigette,</div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif">sorry, if this is not the kind of answer that you want to hear, but what you are describing is work for experienced domain experts, not an undergraduate student. force-field parameterization is not a simple black box process, but can be quite tedious and complicated. even if you would have an example procedure for a given system, it may not be transferable for your target.</div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif">especially classical potentials like lennard-jones are only applicable to specific compounds and usually not transferable to any combination of elements.​</div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif">​uranium is a particularly difficult element, that cannot be simply mapped to a spherical point potential, but requires to include complex manybody interactions. hell, it is already difficult to build well transferable and ghost state free uranium pseudopotentials for quantum chemical calculations ​with plain DFT functionals.</div><br></div><div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif">do you have somebody overseeing your work? you should talk to that person or have that person put you in contact with an expert and discuss your project. from your description it looks like it is rather ill-conceived. </div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif">axel.</div><br></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Thank you,</div><div>Brigette Smith</div></div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" rel="noreferrer" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/<wbr>listinfo/pw_forum</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">Dr. Axel Kohlmeyer  <a href="mailto:akohlmey@gmail.com" target="_blank">akohlmey@gmail.com</a>  <a href="http://goo.gl/1wk0" target="_blank">http://goo.gl/1wk0</a><br>College of Science & Technology, Temple University, Philadelphia PA, USA<br>International Centre for Theoretical Physics, Trieste. Italy.</div>
</div></div>