<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Dear Mohammed,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Have you computed your force constants for a supercell or are you inter/extrapolating q≠Gamma from the --dim=“1 1 1” force constants? If it’s 1 1 1, try to make a supercell that will give you access to the zone-boundary points so that your interpolation
 becomes better.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Best regards,</div>
<div class="">-uli</div>
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div class="" style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
--------------------------------------------------------------</div>
<div class="" style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
SNF Prof. Dr. Ulrich Aschauer<br class="">
Universität Bern<br class="">
Departement für Chemie und Biochemie<br class="">
Freiestrasse 3<br class="">
CH-3012 Bern<br class="">
Tel. +41 (0)31 631 5629<br class="">
<a href="mailto:ulrich.aschauer@dcb.unibe.ch" class="">ulrich.aschauer@dcb.unibe.ch</a><br class="">
<a href="http://www.dcb.unibe.ch" class="">www.dcb.unibe.ch</a><br class="">
Büro: N431</div>
</div>
<div class="" style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div class="" style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
--------------------------------------------------------------</div>
<div class=""><br class="">
</div>
</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
</div>
<br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On 5 Dec 2016, at 09:25, Pietro Delugas <<a href="mailto:pdelugas@sissa.it" class="">pdelugas@sissa.it</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
Hello Mohammed</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
If the phonon were computed with phononpy for any numerical problem maybe you will find more help in the forum of phononpy users.  <span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
Could you provide more information about the structure ?  Is it 3D or 2D ?<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
greetings - pietro   <span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
</div>
<br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<div class="moz-cite-prefix" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);">
On 05/12/2016 08:23, Mohammed Ghadiyali wrote:<br class="">
</div>
<blockquote cite="mid:BN6PR06MB3042D0952D6AE6BC86C0BCCACD830@BN6PR06MB3042.namprd06.prod.outlook.com" type="cite" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<div id="divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size: 12pt; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif;" class="">
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">Dear All,</span><br class="">
</div>
<div class="">
<div id="divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size: 12pt; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif;" class="">
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">I am working on a bilayer tin system and has performed geometry relaxation using Quantum Espresso 5.4.0 of the structure via:</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">1. One relax calculation - for coordinate relaxation </div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">2. One vc-relax calculation with cell_do_free as 2Dxy - for coordinate and cell shape relaxation</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><span style="font-size: 12pt;" class="">3. Two vc-relax calculation with cell_do_free as shape - </span><span style="font-size: 12pt;" class="">for coordinate and cell shape relaxation with constant
 volume.</span><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">these calculations were performed with, <span style="font-size: 12pt;" class="">ecutwfc = 60 Ry and K-point mesh as 10 10 1, 1 1 1.</span></div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">Further, phonon calculations were performed using the phononpy 1.11.0 package with the same parameters. The </div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">structure <span style="font-size: 12pt;" class="">seem to gotten relaxed but it still has some negative frequencies near the Gamma point, are these's negative </span></div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">frequencies numerical instabilities or the structure is unstable.</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">I am attaching the phonon dispersion file. Please advice.</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">Regards,</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">Ghadiyali Mohammed Kader.</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">Research Scholar,</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class=""><br class="">
</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">University of Mumbai.</div>
</div>
</div>
<br class="">
</div>
<br class="">
<fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset><br class="">
<pre wrap="" class="">_______________________________________________
Pw_forum mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a></pre>
</blockquote>
<br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255); float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255); float: none; display: inline !important;" class="">Pw_forum
 mailing list</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">Pw_forum@pwscf.org</a><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>