<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body>
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p>Thank you for your email! I did forget to add it. But after I added it, the calculation was still unable to switch on the environment function. The executable line in my script is like this:</p>
<p><br>
</p>
<p><span>mpirun -n 16 $BIN_DIR/pw.x --environ < LiCoO2.relax.in > LiCoO2.relax.out</span><br>
</p>
<p><span><br>
</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;">I also tried other ways like:</span><br>
</p>
<p><span style="font-size: 12pt;"><span>mpirun -n 16 $BIN_DIR/pw.x -environ < LiCoO2.relax.in > LiCoO2.relax.out</span><br>
</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;"><span>mpirun -n 16 $BIN_DIR/pw.x --environ environ.in < LiCoO2.relax.in > LiCoO2.relax.out</span><br>
</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;"><span>mpirun -n 16 $BIN_DIR/pw.x -environ <span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols; font-size: 16px;">
environ.in </span>< LiCoO2.relax.in > LiCoO2.relax.out</span><br>
</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;"><br>
</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;">However, none of them worked for my slabz-water calculation. I wonder if it's because the solvent model function wasn't installed at all. But then I found that if I use those choices for isolated clusters, the environ can be
 switched on:</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;"><span><span>assume_isolated = '</span>makov-payne' or '<span>martyna-tuckerman'</span></span><br>
</span></p>
<p><br>
</p>
<p>But if it is <span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols; font-size: 16px;">assume_isolated = 'pcc</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols; font-size: 16px;">',
 it still couldn't switch on the environ.</span></p>
<p><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols; font-size: 16px;"><br>
</span></p>
<p><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols; font-size: 16px;">Is there anything I need to add to the executable line?</span></p>
<p><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols; font-size: 16px;"><br>
</span></p>
<p><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols; font-size: 16px;">Thank you,</span></p>
<p><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols; font-size: 16px;">Xu Huang</span></p>
</div>
<hr style="display:inline-block;width:98%" tabindex="-1">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" style="font-size:11pt" color="#000000"><b>From:</b> pw_forum-bounces@pwscf.org <pw_forum-bounces@pwscf.org> on behalf of Paolo Giannozzi <p.giannozzi@gmail.com><br>
<b>Sent:</b> Tuesday, November 1, 2016 3:14:18 PM<br>
<b>To:</b> huangxu1706@sina.com; PWSCF Forum<br>
<b>Subject:</b> Re: [Pw_forum] Solvent model did not switch on</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div dir="ltr">"pw.x --environ"?<br>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Tue, Nov 1, 2016 at 5:02 PM, <span dir="ltr"><<a href="mailto:huangxu1706@sina.com" target="_blank">huangxu1706@sina.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div> Dear all,</div>
<div><br>
</div>
<div>I'm using QE-5.4.0 solvent model for the LiCoO2 surface simulation under water background. The structural optimization and
<a href="http://environ.in" target="_blank">environ.in</a> are both listed below. The surface slab is packed along z-direction, so I put assume_isolated = 'slabz'. However, I found that the output seemed didn't recognize the environ parameters at all and the
 output file is just a relaxation without environ function. And there is no error message about the environ, either. Do you know what's wrong with my input files? Is there any other parameter I should add to switch on this function?</div>
<div><br>
</div>
<div>Thank you,</div>
<div>Xu Huang</div>
<div><br>
</div>
<div>------------------------------<wbr>-----------</div>
<div>1. Relaxation input-> <a href="http://LiCoO2.relax.in" target="_blank">LiCoO2.relax.in</a></div>
<div>------------------------------<wbr>-----------</div>
<div>
<div>&CONTROL</div>
<div>  calculation = 'relax',</div>
<div>  pseudo_dir = '/home1/04482/tg837818/pwf/',</div>
<div>  prefix = 'LiCoO2',</div>
<div>  outdir = './temp',</div>
<div>!  restart_mode = 'restart',</div>
<div>/</div>
</div>
<div>
<div>&SYSTEM</div>
<div>  ibrav = 4,</div>
<div>  celldm(1) = 5.366161805,</div>
<div>  celldm(3) = 12.00000000,</div>
<div>  nat = 11,</div>
<div>  ntyp = 3,</div>
<div>  ecutwfc = 40,</div>
<div>  ecutrho = 320,</div>
<div>  occupations = 'smearing',</div>
<div>  smearing = 'mv',</div>
<div>  degauss = 0.02,</div>
<div>  nspin = 2,</div>
<div>  starting_magnetization(2) = 0.01,</div>
<div>  lda_plus_u = .true.,</div>
<div>  Hubbard_U(1) = 4.91,</div>
<div>  Hubbard_U(2) = 1.0d-10,</div>
<div>  assume_isolated = 'slabz'</div>
<div>/</div>
<div>&ELECTRONS</div>
<div>  electron_maxstep = 100,</div>
<div>  diagonalization = 'david',</div>
<div>  conv_thr = 3.0d-7,</div>
<div>  mixing_beta = 0.2,</div>
<div>/</div>
<div>&IONS</div>
<div>/</div>
<div>ATOMIC_SPECIES</div>
<div>  Co  1.00   Co.pbe-nd-rrkjus.UPF</div>
<div>  O   1.00   O.pbe-rrkjus.UPF</div>
<div>  Li  1.00   Li.pbe-s-van_ak.UPF</div>
<div>ATOMIC_POSITIONS {crystal}</div>
<div>O       -0.333333333  -0.666666667  -0.163633536</div>
<div>Co      -0.666666667  -0.333333333  -0.138069939</div>
<div>O        0.000000000   0.000000000  -0.107235071</div>
<div>Li      -0.333333333  -0.666666667  -0.068185624</div>
<div>O       -0.666666667  -0.333333333  -0.029980859</div>
<div>Co       0.000000000   0.000000000   0.000000000</div>
<div>O        0.666666667   0.333333333   0.029980859</div>
<div>Li       0.333333333   0.666666667   0.068185624</div>
<div>O       -0.000000000  -0.000000000   0.107235071</div>
<div>Co       0.666666667   0.333333333   0.138069939</div>
<div>O        0.333333333   0.666666667   0.163633536</div>
<div>K_POINTS {automatic}</div>
<div>  8 8 1 1 1 1</div>
</div>
<div><br>
</div>
<div>------------------------------<wbr>-----------</div>
<div>2. Environment input-> <a href="http://environ.in" target="_blank">environ.in</a></div>
<div>------------------------------<wbr>-----------</div>
<div>
<div>&ENVIRON</div>
<div>  verbose = 0</div>
<div>  environ_thr = 1.0d-1</div>
<div>  environ_type = 'input'</div>
<div>  eps_mode='full'</div>
<div>  tolrhopol = 5.0d-13</div>
<div>  mixrhopol = 0.6</div>
<div>  env_static_permittivity = 80</div>
<div>  env_surface_tension = 0.d0</div>
<div>  env_pressure = 0.d0</div>
<div>/</div>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" rel="noreferrer" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/<wbr>listinfo/pw_forum</a><br>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<br>
-- <br>
<div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>Paolo Giannozzi, Dip. Scienze Matematiche Informatiche e Fisiche,<br>
Univ. Udine, via delle Scienze 208, 33100 Udine, Italy<br>
Phone +39-0432-558216, fax +39-0432-558222<br>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>