<div dir="ltr"><div><div>Dear Developers and Experts,<br><br></div><div>I am interested in studying diffusion of metal clusters on oxide support. As a first step, I took a simplest case (<span class="" style="" id=":1cs.1" tabindex="-1">adatom</span> hopping) and obtained the transition state using CI-NEB method.  I want to find the rate constant for the above, I need to know the normal mode vibrational frequencies at initial and transition states. <br> <br></div>So I calculated the phonon frequencies using frozen atomic coordinate (<span class="" style="" id=":1cs.2" tabindex="-1">nat</span>_<span class="" style="" id=":1cs.3" tabindex="-1">todo</span> option only on metal <span class="" style="" id=":1cs.4" tabindex="-1">adatom</span>) since the system size is very large.  I expected the transition state to have one less real frequencies (3N-1) relative to initial state (3N). However, I am getting 3N real frequencies for the transition state (correct me if I am wrong).<br><br> I have also checked it by including more atoms in the linear response (up to 33 atoms) but still I got 3N real frequencies for the TS.<br><br></div><div>I have attached the input files and the output file generated by <span class="" style="" id=":1cs.5" tabindex="-1">dynmat</span>.x<br></div><div><br></div><div>Any suggestion will be highly appreciated.<br><br></div><div>Thanks in advance.<br><br></div><div>regards,<br></div><div><div><br clear="all"><div><div><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><b><font size="2"><span class="" style="" id=":1cs.7" tabindex="-1">NANDHA</span> <span class="" style="" id=":1cs.8" tabindex="-1">KUMAR</span> V.</font></b></span><br></div><span style="background-color:rgb(238,238,238)"><span></span></span><font color="#0b5394"><font face="tahoma,sans-serif">Research scholar,<br></font></font><div><div><div><div><div><span style="color:rgb(32,18,77)"><span class="" style="" id=":1cs.9" tabindex="-1">IISER</span>, <span class="" style="" id=":1cs.10" tabindex="-1">PUNE</span>.<span style="background-color:rgb(0,0,0)"><span></span></span><span style="background-color:rgb(243,243,243)"><span></span></span></span><br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div></div></div></div>