<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" id="owaParaStyle"></style>
</head>
<body fpstyle="1" ocsi="0">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">
<blockquote style="margin: 0 0 0 40px; border: none; padding: 0px;"></blockquote>
<font face="monospace" size="3">Dear Paolo:<br>
<br>
Thanks for your quick reply. But do you know the reason why different computing cores lead to different results? And How to fix it? I really confusing about this.<br>
<br>
Thanks for your time,<br>
Xiaoming<br>
Department of Materials Science and Engineering, </font>
<div><font face="monospace" size="3">University of Utah</font>
<div>
<div><br>
</div>
<div><br>
<div style="font-family: Times New Roman; color: #000000; font-size: 16px">
<hr tabindex="-1">
<div id="divRpF266754" style="direction: ltr;"><font face="Tahoma" size="2" color="#000000"><b>From:</b> pw_forum-bounces@pwscf.org [pw_forum-bounces@pwscf.org] on behalf of Paolo Giannozzi [p.giannozzi@gmail.com]<br>
<b>Sent:</b> Sunday, September 11, 2016 12:51 PM<br>
<b>To:</b> PWSCF Forum<br>
<b>Subject:</b> Re: [Pw_forum] different computing cores lead to different results when calculating phonon spectrum by ph.x<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div dir="ltr">
<div>The frequencies you report are 0 by definition, almost 0 when computed: <a href="redir.aspx?REF=4sg-3oovjh9dbihtpRKtW8iIgpzbkIFFdTzPFukAKJtulrBgM9vTCAFodHRwOi8vd3d3LnF1YW50dW0tZXNwcmVzc28ub3JnL2ZhcS9waG9ub25zLyM3LjI." target="_blank">
http://www.quantum-espresso.org/faq/phonons/#7.2</a> . No available solution other than imposing the Acoustic Sum Rule (ASR) afterwards.<br>
Basically, the ASR violation is numerical noise, and as such, rather unpredictable.<br>
<br>
</div>
<div>Paolo<br>
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Sun, Sep 11, 2016 at 8:10 PM, XIAOMING ZHANG <span dir="ltr">
<<a href="redir.aspx?REF=rcdX65FVruQA1h4tbMGDKMD1AbCtgbuH3RWw8G8Mz0pulrBgM9vTCAFtYWlsdG86eGlhb20uemhhbmdAdXRhaC5lZHU." target="_blank">xiaom.zhang@utah.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex; border-left:1px #ccc solid; padding-left:1ex">
<div>
<div style="direction:ltr; font-family:Tahoma; color:#000000; font-size:10pt">
<pre>Dear all,</pre>
<pre>I have several questions when calculating phonons by ph.x:</pre>
<pre>(1) Using the same input files, I got different output files of dynamical matrices when using different computing cores; </pre>
<pre>take q = (    0.000000000   0.000000000   0.000000000 ) as an example:</pre>
<pre>Using 96 computing cores, the results a<span style="font-size:10pt">fter the line "Dynamical Matrix in cartesian axes"</span></pre>
<pre>and the q-value are:</pre>
<pre> ******************************<wbr>******************************<wbr>**************
     freq (    1) =      -1.940214 [THz] =     -64.718584 [cm-1]
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.237593  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.237593  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.237593  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.237593  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.237593  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.237593  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.209687  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.209687  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.209687  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.209687  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.209687  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.209687  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.363998  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.363998  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.363998  0.000000 )
     freq (    2) =       0.946381 [THz] =      31.567870 [cm-1]
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.101981  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.101981  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.101979  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.101979  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.000001  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.000001  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.384498  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.384498  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.384493  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.384493  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.000005  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.000005  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.428402  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.428397  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.000006  0.000000 )
     freq (    3) =       0.946381 [THz] =      31.567870 [cm-1]
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.058877  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.058877  0.000000 )
 (  0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000 -0.058879  0.000000 )</pre>
<pre>However, when I using 128 computing cores, the corresponding results turn to be:</pre>
<pre>******************************<wbr>******************************<wbr>**************
     freq (    1) =      -1.941478 [THz] =     -64.760743 [cm-1]
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.237504  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.237504  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.237504  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.237504  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.237504  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.237504  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.209612  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.209612  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.209612  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.209612  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.209612  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.209612  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.364201  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.364201  0.000000 )
 ( -0.000000  0.000000 -0.000000  0.000000  0.364201  0.000000 )
     freq (    2) =      -0.797967 [THz] =     -26.617308 [cm-1]
 ( -0.217955  0.000000 -0.132999  0.000000 -0.000000  0.000000 )
 ( -0.217955  0.000000 -0.132999  0.000000 -0.000000  0.000000 )
 ( -0.212134  0.000000 -0.133209  0.000000  0.000000  0.000000 )
 ( -0.212134  0.000000 -0.133209  0.000000  0.000000  0.000000 )
 ( -0.215227  0.000000 -0.138145  0.000000  0.000000  0.000000 )
 ( -0.215227  0.000000 -0.138145  0.000000  0.000000  0.000000 )
 ( -0.230258  0.000000 -0.129133  0.000000 -0.000000  0.000000 )
 ( -0.230258  0.000000 -0.129133  0.000000 -0.000000  0.000000 )
 ( -0.205571  0.000000 -0.130026  0.000000  0.000000  0.000000 )
 ( -0.205571  0.000000 -0.130026  0.000000  0.000000  0.000000 )
 ( -0.218687  0.000000 -0.150959  0.000000  0.000000  0.000000 )
 ( -0.218687  0.000000 -0.150959  0.000000  0.000000  0.000000 )
 ( -0.228822  0.000000 -0.140474  0.000000  0.000000  0.000000 )
 ( -0.224086  0.000000 -0.140645  0.000000 -0.000000  0.000000 )
 ( -0.226602  0.000000 -0.144661  0.000000 -0.000000  0.000000 )
     freq (    3) =      -0.797967 [THz] =     -26.617308 [cm-1]
 ( -0.136570  0.000000  0.212256  0.000000 -0.000000  0.000000 )
 ( -0.136570  0.000000  0.212256  0.000000 -0.000000  0.000000 )
 ( -0.136360  0.000000  0.218077  0.000000  0.000000  0.000000 )</pre>
<pre>So, why do different computing cores lead to different results? Does someone encounter the same problems?</pre>
<pre>By the way, is it reasonable for the negative frequency (such as <span style="font-size:13.3333px">freq (    1) =      -1.940214 [THz] =     -64.718584 [cm-1]</span><span style="font-size:10pt">) ?</span></pre>
<pre><span style="font-size:10pt"><br></span></pre>
<pre><span style="font-size:10pt">(2) With different computing cores, I always get the p</span>honon spectrum with small imaginary frequency no matter how I <span style="font-size:10pt">adjust the parameters suggested by other guys</span><span style="font-size:10pt">. </span></pre>
<pre><span style="font-size:10pt">S</span><span style="font-size:10pt">o can someone give me some useful suggestions to </span>eliminate<span style="font-size:10pt"> the </span><span style="font-size:13.3333px">imaginary frequency</span><span style="font-size:10pt">?</span></pre>
<pre><br></pre>
<pre>Thanks for <font size="3">your time,</font></pre>
<pre><font size="3">Xiaoming</font></pre>
<pre><span style="white-space:normal"><font size="3">Department of Materials Science and Engineering, University of Utah</font></span></pre>
<pre><span style="font-size:10pt"><br></span></pre>
</div>
</div>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="redir.aspx?REF=EHU4J0HrWhueHm5YudQruShUz0Bc4ED6IfBZw8AT6HCTvLBgM9vTCAFtYWlsdG86UHdfZm9ydW1AcHdzY2Yub3Jn" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="redir.aspx?REF=3wivkGiIjv3_abLEftzZ7rrGTLe6UR2otU2wMbxCo-CTvLBgM9vTCAFodHRwOi8vcHdzY2Yub3JnL21haWxtYW4vbGlzdGluZm8vcHdfZm9ydW0." rel="noreferrer" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/<wbr>listinfo/pw_forum</a><br>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<br>
-- <br>
<div class="gmail_signature">
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>Paolo Giannozzi, Dip. Scienze Matematiche Informatiche e Fisiche,<br>
Univ. Udine, via delle Scienze 208, 33100 Udine, Italy<br>
Phone +39-0432-558216, fax +39-0432-558222<br>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>