<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">Dear all,</div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">I am trying to calculate all electron charge densities for Bader charge calculation. </div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">Since QE 5.1.1 (which I was using till now) does not have the all electron charge density </div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">option in it pp.x, I have switched to the latest version QE 5.4.0.</div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">I could compile 5.4.0 without any errors using the ./configure , make all routine.</div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">However, when I try to run the new compilation, it throws error:</div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">(Input file <a href="http://cuvac.2.scf.in">cuvac.2.scf.in</a> is attached with the mail)<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------<br></div><div class="gmail_default" style=""><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">[vaibhav@dhrupad test]$ /opt/intel/mpi-rt/4.1.0/intel64/bin/mpiexec -np 16 /home/vaibhav/opt/QE/5.4.0/espresso-5.4.0/bin/pw.x -inp <a href="http://cuvac.2.scf.in">cuvac.2.scf.in</a> </font></div><div class="gmail_default" style=""><br></div><div class="gmail_default" style=""><br></div></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">     Program PWSCF v.5.4.0 starts on  7Jun2016 at 19:16:45 <br></div><div class="gmail_default" style=""><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     for quantum simulation of materials; please cite</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">         "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">          URL <a href="http://www.quantum-espresso.org">http://www.quantum-espresso.org</a>", </font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     in publications or presentations arising from this work. More details at</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     <a href="http://www.quantum-espresso.org/quote">http://www.quantum-espresso.org/quote</a></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     Parallel version (MPI), running on    16 processors</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     R & G space division:  proc/nbgrp/npool/nimage =      16</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     Reading input from <a href="http://cuvac.2.scf.in">cuvac.2.scf.in</a></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">Warning: card &IONS ignored</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">Warning: card / ignored</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">Warning: card &CELL ignored</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">Warning: card / ignored</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     Current dimensions of program PWSCF are:</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     Max number of different atomic species (ntypx) = 10</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     Max number of k-points (npk) =  40000</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     Max angular momentum in pseudopotentials (lmaxx) =  3</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     Presently no symmetry can be used with electric field</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     IMPORTANT: XC functional enforced from input :</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     Exchange-correlation      = VDW-DF ( 1  4  4  0 1 0)</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     Any further DFT definition will be discarded</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     Please, verify this is what you really want</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">               file O.pbe-n-kjpaw_psl.0.1.UPF: wavefunction(s)  2P renormalized</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">               file H.pbe-kjpaw_psl.0.1.UPF: wavefunction(s)  1S renormalized</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     Subspace diagonalization in iterative solution of the eigenvalue problem:</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     one sub-group per band group will be used</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     scalapack distributed-memory algorithm (size of sub-group:  2*  2 procs)</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">  *                      1  *                      4  /=                      4</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">  *                      2  *                      4  /=                      4</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 7) - process 12</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 7) - process 11</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 7) - process 8</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"> %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     Error in routine  fft_dlay_set (7):</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">      inconsistent number of sticks</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"> %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%</font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif">     stopping ...</font></div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small">-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------</div></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">I run this same example with 5.1.1, and it runs smooth. (Rather, I chose the one that ran smooth with </div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">5.1.1).</div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><br></div><div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">​Is it a mesh related problem? </div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><a href="http://www.democritos.it/pipermail/pw_forum/2005-January/001876.html">http://www.democritos.it/pipermail/pw_forum/2005-January/001876.html</a></font><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">I wonder why it works fine in 5.1.1 but not in 5.4.0.</div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">I tried increasing the mesh values as nr1 = 144 , nr2 = 144 , nr3 = 288 </div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">in accordance with:</div><div class="gmail_default" style=""><font color="#444444" face="comic sans ms, sans-serif"><a href="http://www.democritos.it/pipermail/pw_forum/2011-April/020055.html">http://www.democritos.it/pipermail/pw_forum/2011-April/020055.html</a></font><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">but it did not help.</div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">Any and all help would be greatly appreciated.<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)">Thank you.</div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:'comic sans ms',sans-serif;font-size:small;color:rgb(68,68,68)"><span style="font-family:arial,sans-serif;color:rgb(34,34,34)">-- </span><br></div></div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><p><span>Vaibhav V.</span> Kaware<br>c/o Dr. Kavita Joshi<br>CSIR-National Chemical Laboratory<br>Dr. Homi Bhabha Road<br>Pune 411 008<br><span>India<br></span></p></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div>