<div dir="ltr"><div>It works for me<br><br></div><div>Paolo<br></div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 11, 2016 at 12:23 PM, Paolo Giannozzi <span dir="ltr"><<a href="mailto:p.giannozzi@gmail.com" target="_blank">p.giannozzi@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">If this happens in a large memory run, typically it means "out of memory". If not: I  am not sure projected DOS is implemented for hybrid and Hartree-Fock calculations<br><div class="gmail_extra"><div><div class="h5"><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 11, 2016 at 12:17 PM, stefano <span dir="ltr"><<a href="mailto:stefano.di-sabatino@polytechnique.edu" target="_blank">stefano.di-sabatino@polytechnique.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear all,<br>
<br>
I'm trying to plot the projected DOS of a Hartree-Fock calculation. But<br>
I get the following error:<br>
<br>
*** Error in `projwfc.x': malloc(): smallbin double linked list<br>
corrupted: 0x0000000002fb7590 ***<br>
Program received signal SIGABRT: Process abort signal.<br>
Backtrace for this error:<br>
<br>
or<br>
<br>
Program received signal SIGSEGV: Segmentation fault - invalid memory<br>
reference.<br>
<br>
What does it mean? In the case of the total dos instead I have no problem.<br>
I tried to change some of the parameters but I always get an error from<br>
projwfc.x.<br>
<br>
<br>
Here follows the input files:<br>
<br>
#!/bin/sh<br>
####################################################################<br>
#<br>
# output in results_NiO_nm/<br>
#<br>
if [ ! -d results_NiO_nm ]; then<br>
    mkdir  results_NiO_nm<br>
fi<br>
<br>
# self-consistent calculation<br>
cat > <a href="http://nio_nm.scf.in" rel="noreferrer" target="_blank">nio_nm.scf.in</a> << EOF<br>
  &control<br>
     prefix='nio',<br>
  /<br>
  &system<br>
     ibrav=  0, celldm(1)=3.9468, nat=  2, ntyp= 2,<br>
     ecutwfc = 30.0, ecutrho = 120.0,<br>
     input_dft='hf', nqx1 = 1, nqx2 = 1, nqx3 = 1,<br>
     x_gamma_extrapolation = .TRUE.,<br>
     ecutvcut=0.7,<br>
     occupations='smearing', smearing='mp', degauss=0.02,<br>
     nspin=1,<br>
  /<br>
  &electrons<br>
     mixing_beta = 0.3<br>
  /<br>
CELL_PARAMETERS<br>
1 1 0<br>
1 0 1<br>
0 1 1<br>
ATOMIC_SPECIES<br>
  O    1.  O.pbe-mt.UPF<br>
  Ni   1.  Ni.pbe-mt_fhi.UPF<br>
ATOMIC_POSITIONS crystal<br>
  O  0.5 0.5 0.5<br>
  Ni 0.0 0.0 0.0<br>
K_POINTS automatic<br>
4 4 4 0 0 0<br>
EOF<br>
pw.x < <a href="http://nio_nm.scf.in" rel="noreferrer" target="_blank">nio_nm.scf.in</a>  > results_NiO_nm/nio.scfHF.out<br>
<br>
<br>
# non self-consistent calculation<br>
cat > <a href="http://nio_nm.nscf.in" rel="noreferrer" target="_blank">nio_nm.nscf.in</a> << EOF<br>
  &control<br>
     calculation='nscf'<br>
     prefix='nio',<br>
  /<br>
  &system<br>
     ibrav=  0, celldm(1)=3.9468, nat=  2, ntyp= 2,<br>
     ecutwfc = 30.0, ecutrho = 120.0,<br>
     occupations='smearing', smearing='mp', degauss=0.02,<br>
     nspin=1,<br>
  /<br>
  &electrons<br>
     mixing_beta = 0.3<br>
  /<br>
CELL_PARAMETERS<br>
1 1 0<br>
1 0 1<br>
0 1 1<br>
ATOMIC_SPECIES<br>
  O    1.  O.pbe-rrkjus.UPF<br>
  Ni   1.  Ni.pbe-nd-rrkjus.UPF<br>
ATOMIC_POSITIONS crystal<br>
  O  0.5 0.5 0.5<br>
  Ni 0.0 0.0 0.0<br>
K_POINTS automatic<br>
8 8 8 0 0 0<br>
EOF<br>
pw.x < <a href="http://nio_nm.nscf.in" rel="noreferrer" target="_blank">nio_nm.nscf.in</a>  > results_NiO_nm/nio.nscf.out<br>
<br>
cat > <a href="http://nio.dos.in" rel="noreferrer" target="_blank">nio.dos.in</a> << EOF<br>
  &dos<br>
     prefix='nio'<br>
     fildos='nio.dos'<br>
     degauss = 0.007d0,<br>
     ngauss = 0<br>
     DeltaE=0.1<br>
     Emin=-10<br>
     Emax=40<br>
  /<br>
EOF<br>
dos.x < <a href="http://nio.dos.in" rel="noreferrer" target="_blank">nio.dos.in</a> > results_NiO_nm/nio.dos.out<br>
<br>
<br>
cat > <a href="http://nio.pdos.in" rel="noreferrer" target="_blank">nio.pdos.in</a> << EOF<br>
  &projwfc<br>
     prefix='nio'<br>
     degauss = 0.007d0,<br>
     ngauss = 0<br>
     DeltaE=0.1<br>
     Emin=-10<br>
     Emax=40<br>
  /<br>
EOF<br>
projwfc.x < <a href="http://nio.pdos.in" rel="noreferrer" target="_blank">nio.pdos.in</a> > results_NiO_nm/nio.pdos.out<br>
<br>
mv nio.dos nio.pdos_* results_NiO_nm/<br>
_______________________________________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" rel="noreferrer" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><br></div></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">-- <br><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>Paolo Giannozzi, Dip. Scienze Matematiche Informatiche e Fisiche,<br>Univ. Udine, via delle Scienze 208, 33100 Udine, Italy<br>Phone <a href="tel:%2B39-0432-558216" value="+390432558216" target="_blank">+39-0432-558216</a>, fax <a href="tel:%2B39-0432-558222" value="+390432558222" target="_blank">+39-0432-558222</a><br><br></div></div></div></div></div>
</font></span></div></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>Paolo Giannozzi, Dip. Scienze Matematiche Informatiche e Fisiche,<br>Univ. Udine, via delle Scienze 208, 33100 Udine, Italy<br>Phone +39-0432-558216, fax +39-0432-558222<br><br></div></div></div></div></div>
</div>