<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">If I remember correctly, *.dyn is generated by ph.x, and dynmat.mold is generated by a post process run of dynmat.x, where a correct is posed upon the ph.x result. Therefore it is expected that you have some slight difference between the infomation in *.dyn and dynmat.mold. </div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">===================<br>Dr. Xiaochuan Ge (Giovanni)<div>Center for Functional Nanomaterials<br><div>Brookhaven national laboratory </div><div>===================</div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On 29 October 2015 at 10:53, <a href="mailto:liyincumt@gmail.com">liyincumt@gmail.com</a> <span dir="ltr"><<a href="mailto:liyincumt@gmail.com" target="_blank">liyincumt@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div>
<div><span></span>Dear Xiaochuan,</div><div><br></div><div>Thank you very much for your kind help!</div><div><br></div><div>Yes. I could find the information in dynmat.mold file as well. But the values in dynamic matrix file and dynamt.mold are different. Is this discrepancy caused by the different units employed by these two files? What is the unit of displacement unit in dynamic matrix file?Hartree/Angstrom?</div><div><br></div><div><br></div><div>Does  "0.000000" which is nearby each displacement value mean this atom in this direction is not constrained? </div><span class=""><div><span style="line-height:1.5;background-color:window"><br></span></div><div><span style="line-height:1.5;background-color:window">   Diagonalizing the dynamical matrix</span></div><div><pre>     q = (    0.000000000   0.000000000   0.000000000 )
 **************************************************************************
     omega(   1) =      -2.312626 [THz] =     -77.140906 [cm-1]
 ( -0.011802  0.000000 -0.026186  0.000000  0.140174  0.000000 )
 (  0.012060  0.000000 -0.043731  0.000000  0.139686  0.000000 )
 (  0.053284  0.000000 -0.004289  0.000000  0.016763  0.000000 )</pre></div><div><br></div><div><br></div></span><span class=""><div>Best Regards,</div><div>Yin</div><hr style="width:210px;min-height:1px" color="#b5c4df" size="1" align="left">
<div><span><div style="margin:10px;font-family:verdana;font-size:15px"><span style="color:rgb(0,0,0);background-color:rgba(0,0,0,0)">Dr. Yin Li <br>Department of Biophysics,Medical School, University of Pecs,<br>No.12 Szigeti Street, Pecs, H-7624, HUNGARY<br>Phone: <a href="tel:%2B36-72-535271" value="+3672535271" target="_blank">+36-72-535271</a>/36271</span></div></span></div>
</span></div><br>_______________________________________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" rel="noreferrer" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a><br></blockquote></div><br></div>