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<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">Dear Reza,<br>
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Exploring the potential energy surface of glassy systems is not a trivial problem not to mention impurities in glassy systems. Depending on how deep you want to explore this,  you may want to explore PLUMED package which is compatible with PWscf.<br>
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<a href="http://www.plumed-code.org/" target="_blank">http://www.plumed-code.org/</a><br>
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For something quick, I would run an MD at very high temperature , take 100 snapshots from the run , and relax them at zero temperature. 
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Regards,<br>
Mostafa<br>
MIT<br>
</div>
</body>
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