<div dir="ltr"><pre> Dear  Arles V. Gil Rebaza,<br></pre><pre>What is the significance of cos60 and sin60. I don't know much.<br></pre><pre>Thanks in advance<br><br></pre><pre>Venkat<br></pre><pre>PhD student <br></pre><pre>IIT Bombay<br></pre><pre>Mumbai <br></pre><pre><br>Dear Venkataramana, if you have a FCC(111) surface, probabily you should

have these lattice vectors (is a option representation)

a            0          0

b*cos60  b*sin60 0

0            0          c+h

where a, b, and c are the distance that you are reporting, and "h" is the

vacuum to simulate a surface.

Best.

Arles V. Gil Rebaza

IFLP-Argentina</pre><br><br><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, Sep 25, 2015 at 9:46 PM, Venkataramana Imandi <span dir="ltr"><<a href="mailto:venkataramana.imandi@gmail.com" target="_blank">venkataramana.imandi@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Dear all,<br><br>I generated cubic fcc(111) in the form of 3x2x2 type structure (6 layers and each layer has 12 atoms) with Iridium (lattice constant:3.839 angstroms).<br>In the generated coordinates file, crystal axes are 8.14374880, 9.40359112, 13.29868610 (generated coordinate are attached). Can i represent<br>CELL_PARAMETERS angstrom in addition to ibrav=0 in the system namelist as shown below (for whole Iridium structure).<br>8.14374880Â  0.00000000Â Â Â  0.000000000<br>0.00000000Â  9.40359112Â Â Â  0.000000000<br>0.00000000Â  0.00000000Â Â Â  13.29868610<br><br>Is the above representation correct (maintains cubic fcc), if not, please suggest me how to represent CELL_PARAMETERS for whole Iridium structure.<br>I am new user and please suggest me correct way of doing calculations.<br><br></div>Again, I want to keep manually methane molecule on the top of Iridium (on the top of z-axis, above 5 angstroms from the top atom in the z-axis), then the resultant whole structure maintain fcc cubic. Please give some suggestions. I am new to quantum espresso calculations.Â  <br><div><br>Â Â Â Â Â  72Â Â Â Â Â  72Â Â Â Â Â  72Â Â Â Â Â  72<br>Â Â Â Â  8.14374880Â Â Â Â  9.40359112Â Â Â  13.29868610Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â  0.00000000Â  MD time =Â Â  0.000E+00 ps<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.78645733Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.48542817Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.64934305<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.42916587Â Â Â Â Â Â Â Â Â  7.83632593Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.64934305<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.42916587Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.70179556Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.43289536<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.78645733Â Â Â Â Â Â Â Â Â  7.05269336Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.43289536<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.42916587Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.26906075Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.21644768<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.78645733Â Â Â Â Â Â Â Â Â  8.61995854Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.21644768<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.07187440Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.48542817Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.64934305<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.71458293Â Â Â Â Â Â Â Â Â  7.83632593Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.64934305<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.71458293Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.70179556Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.43289536<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.07187440Â Â Â Â Â Â Â Â Â  7.05269336Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.43289536<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.71458293Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.26906075Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.21644768<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.07187440Â Â Â Â Â Â Â Â Â  8.61995854Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.21644768<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.35729146Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.48542817Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.64934305<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  7.83632593Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.64934305<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.70179556Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.43289536<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.35729146Â Â Â Â Â Â Â Â Â  7.05269336Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.43289536<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.26906075Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.21644768<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.35729146Â Â Â Â Â Â Â Â Â  8.61995854Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.21644768<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.78645733Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.78363261Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.64934305<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.42916587Â Â Â Â Â Â Â Â Â  3.13453037Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.64934305<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.42916587Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.43289536<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.78645733Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.35089780Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.43289536<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.42916587Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.56726519Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.21644768<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.78645733Â Â Â Â Â Â Â Â Â  3.91816298Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.21644768<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.07187440Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.78363261Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.64934305<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.71458293Â Â Â Â Â Â Â Â Â  3.13453037Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.64934305<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.71458293Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.43289536<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.07187440Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.35089780Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.43289536<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.71458293Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.56726519Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.21644768<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.07187440Â Â Â Â Â Â Â Â Â  3.91816298Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.21644768<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.35729146Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.78363261Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.64934305<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  3.13453037Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.64934305<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.43289536<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.35729146Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.35089780Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.43289536<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.56726519Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.21644768<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.35729146Â Â Â Â Â Â Â Â Â  3.91816298Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.21644768<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.78645733Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.48542817Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.42916587Â Â Â Â Â Â Â Â Â  7.83632593Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.42916587Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.70179556Â Â Â Â Â Â Â Â  -2.21644769<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.78645733Â Â Â Â Â Â Â Â Â  7.05269336Â Â Â Â Â Â Â Â  -2.21644769<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.42916587Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.26906075Â Â Â Â Â Â Â Â  -4.43289537<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.78645733Â Â Â Â Â Â Â Â Â  8.61995854Â Â Â Â Â Â Â Â  -4.43289537<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.07187440Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.48542817Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.71458293Â Â Â Â Â Â Â Â Â  7.83632593Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.71458293Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.70179556Â Â Â Â Â Â Â Â  -2.21644769<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.07187440Â Â Â Â Â Â Â Â Â  7.05269336Â Â Â Â Â Â Â Â  -2.21644769<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.71458293Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.26906075Â Â Â Â Â Â Â Â  -4.43289537<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.07187440Â Â Â Â Â Â Â Â Â  8.61995854Â Â Â Â Â Â Â Â  -4.43289537<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.35729146Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.48542817Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  7.83632593Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.70179556Â Â Â Â Â Â Â Â  -2.21644769<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.35729146Â Â Â Â Â Â Â Â Â  7.05269336Â Â Â Â Â Â Â Â  -2.21644769<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.26906075Â Â Â Â Â Â Â Â  -4.43289537<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.35729146Â Â Â Â Â Â Â Â Â  8.61995854Â Â Â Â Â Â Â Â  -4.43289537<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.78645733Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.78363261Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.42916587Â Â Â Â Â Â Â Â Â  3.13453037Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.42916587Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â  -2.21644769<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.78645733Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.35089780Â Â Â Â Â Â Â Â  -2.21644769<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  5.42916587Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.56726519Â Â Â Â Â Â Â Â  -4.43289537<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  6.78645733Â Â Â Â Â Â Â Â Â  3.91816298Â Â Â Â Â Â Â Â  -4.43289537<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.07187440Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.78363261Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.71458293Â Â Â Â Â Â Â Â Â  3.13453037Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.71458293Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â  -2.21644769<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.07187440Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.35089780Â Â Â Â Â Â Â Â  -2.21644769<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.71458293Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.56726519Â Â Â Â Â Â Â Â  -4.43289537<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  4.07187440Â Â Â Â Â Â Â Â Â  3.91816298Â Â Â Â Â Â Â Â  -4.43289537<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.35729146Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.78363261Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  3.13453037Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â  -2.21644769<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.35729146Â Â Â Â Â Â Â Â Â  2.35089780Â Â Â Â Â Â Â Â  -2.21644769<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  0.00000000Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.56726519Â Â Â Â Â Â Â Â  -4.43289537<br>IrÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â  1.35729146Â Â Â Â Â Â Â Â Â  3.91816298Â Â Â Â Â Â Â Â  -4.43289537<br><br></div><div>Venkat<br></div><div>PhD research scholar<br></div><div>IIT Bombay<br></div><div>Mumbai<br></div><div><br></div></div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div class="gmail_signature">venkataramana</div>

</div></div>