<div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div style="text-align:left">I am a young researcher working on adsorption of organic molecules upon carbonate surface. I would like to evaluate the solvation effect on it, so, in order to do that I would like to employ the SCCS recently implemented on the QE. </div><div style="text-align:left"><br></div>As far as I understand to add the solvent environment to the system composed by the organic molecule adsorbed upon the surface, I have to set up the <a href="http://environ.in">environ.in</a> as:<br><br><span class=""> &ENVIRON</span><span class="">  </span><br>   !<br>   verbose = 0<br>   environ_thr = 10 (system is big, an orthorhombic dimension, which largest size is aroung 60 angstroms ) <br>   environ_type = 'input'<br>   eps_mode = 'full'<br>   tolrhopol = 1.D-11<br>   mixrhopol = 0.6<br>   env_static_permittivity = 1 (79 for water)<br>   env_surface_tension = 0    (50 for water)<br>   !<div>/</div><div><br>And we add the line:  </div><div><div>isolated_system='slabz'</div><div>to the &SYSTEM section of the QE input file.<br></div><div><br></div><div>Did I understand correctly? the <a href="http://environ.in">environ.in</a> is ok?</div><div><br></div><div>If so, I would like to follow with the next question. </div><div><br></div><div>As I was mention on the begging, I would like to calculate the adsorption energy of this molecule in the solvent environment, therefore I have to calculate two more systems: the surface and the molecule. For the surface I understand that the same conditions have to be applied (the same <a href="http://environ.in">environ.in</a> and the same 'isolated_system' in the QE file). Now, for the isolated molecule I understand we could use the same <a href="http://environ.in">environ.in</a> (just changing the  environ_thr to 0.1 as was indicating for molecules), but to maintain the same cell dimensions as for the surface case, it is correct to use 'isolated_system'='slabz' in this case? Because 'pcc' only applies for cubic systems, right?</div><div><br></div><div>I hope my questions were exposed in an understandable way and I apologize if my English is not fully correct.</div><div><br></div><div>I would be grateful for any suggestion on how to proceed with this calculation.</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div><br></div><div>Regards</div><div><br></div><div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div style="font-size:small">Dra. Verónica M. Sánchez</div><div style="font-size:small">CSC-CONICET</div><div style="font-size:small">Godoy Cruz 2390</div><div style="font-size:small">1425 Ciudad de Buenos Aires</div><div style="font-size:small">Argentina</div><div style="font-size:small">Tel 54 11 4899 5500 ext 5616</div></div></div></div></div>
</div></div></div>