<div dir="ltr"><div>Dear Lorenzo,</div>I apologize for getting back so late on this. I had posted a reply but looks like the email bounced back due to some size restriction on the attachment. But to answer your question, I did not find a negative frequency anywhere else in the q-point grid. I am attaching my scf, ph, q2r and matdyn input files. I am facing the same problem with another crystal structure of SiO2 as well (cristobalite). <span style="font-size:13px">I feel like I am making some mistake in the input files that is probably important for polar materials.</span><div><br></div><div><span style="font-size:13px">I would really appreciate it if someone could look into it. Thanks!</span><br></div><div><span style="font-size:13px">Sridhar</span></div><div><span style="font-size:13px">Purdue University</span></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Nov 17, 2014 at 2:34 AM, Lorenzo Paulatto <span dir="ltr"><<a href="mailto:lorenzo.paulatto@impmc.upmc.fr" target="_blank">lorenzo.paulatto@impmc.upmc.fr</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    Dear Sridhar,<br>
    normally the sum rules imposed by matdyn are enough to set the
    acoustic bands at gamma to exactly zero. If this is not the case, it
    normally means that you have some negative frequency somewhere else
    in the q-point grid. Please check the other matdyn files to see if
    this is the case: the frequencies are at the end of the file.<br>
    <br>
    kind regards<div><div class="h5"><br>
    <br>
    <br>
    <div>On 17/11/14 02:03, Sridhar Sadasivam
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite">
      <div dir="ltr">Dear Stefano,
        <div><br>
        </div>
        <div>Thanks for your reply. Here are the frequencies at gamma
          point when I set zasr and asr to 'simple'</div>
        <div>
          <div>  -12.8981  -12.8981   -4.5998  142.6073  168.0267
             168.0267</div>
          <div>  249.0588  249.0588  340.4760  344.4668  379.2589
             379.2589</div>
          <div>  417.0274  417.0274  429.6273  457.2113  657.8050
             657.8050</div>
          <div>  746.0641  755.8553  755.8553 1032.5200 1032.5200
            1037.0491</div>
          <div> 1048.5362 1136.7760 1136.7760</div>
        </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Thanks,</div>
        <div>Sridhar</div>
      </div>
      <div class="gmail_extra"><br>
        <div class="gmail_quote">On Sun, Nov 16, 2014 at 5:25 AM,
          stefano de gironcoli <span dir="ltr"><<a href="mailto:degironc@sissa.it" target="_blank">degironc@sissa.it</a>></span> wrote:<br>
          <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
            <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
              <div>dear Sridhar Sadasivam<br>
                      can you try to set zasr and asr to 'simple' in the
                q2r+matdyn case and report the results ?<br>
                      thanks<br>
                stefano
                <div>
                  <div><br>
                    <br>
                    <br>
                    On 11/15/2014 11:49 PM, Sridhar Sadasivam wrote:<br>
                  </div>
                </div>
              </div>
              <blockquote type="cite">
                <div>
                  <div>
                    <div dir="ltr">Dear espresso users and developers,
                      <div><br>
                      </div>
                      <div>I am trying to obtain the phonon dispersion
                        of alpha-quartz (SiO2) which has a 9 atom unit
                        cell. I ran ph.x on a 3 x 3 x 3 q-point grid. I
                        am seeing some strange behavior where there
                        seems to be a difference in the frequencies
                        output from dynmat.x and matdyn.x. I will
                        explain my problem below. </div>
                      <div><br>
                      </div>
                      <div>I diagonalized the dynamical matrix at the
                        gamma point using dynmat.x with acoustic sum
                        rule set to crsytal. Since SiO2 is a polar
                        material, LO-TO splitting will need to be
                        considered at the gamma point but I am ignoring
                        it currently (I did not specify any direction
                        for LO-TO splitting in the dynmat.x input). This
                        gave me the following 27 frequencies (in cm^-1)
                        at the gamma point: (0,0,0, 152.24, 175.57,
                        175.57, 256.32, 256.32, 341.09, 354.41, 376.86,
                        376.86, 419.01, 419.01, 435.37, 455.70, 659.12,
                        659.12, 744.54, 754.62, 1034.38, 1034.38,
                        1040.20, 1051.12, 1139.60, 1139.60) </div>
                      <div><br>
                      </div>
                      <div>I also used q2r.x (with zasr = 'crystal') to
                        obtain the force constants and then used
                        matdyn.x (with asr = 'crystal') to obtain the
                        frequencies at the gamma point. However with
                        matdyn.x, I obtain the following frequencies at
                        the gamma point:
                        (-29.4088,-22.2535,-22.2535,152.2412,175.8141,175.8141,
                        256.3373, 256.3373, 341.0892, 355.4227, 376.0495
                        , 376.0495, 418.6344, 418.6344, 435.3710,
                        453.6862, 659.7607, 659.7607, 746.4843,
                        754.8867, 754.8867, 1034.1751, 1034.1751,
                        1039.7590, 1051.1207, 1139.8191, 1139.8191)</div>
                      <div><br>
                      </div>
                      <div>Could someone please explain why I am getting
                        imaginary frequencies from matdyn.x while
                        dynmat.x gives real frequencies at the same
                        q-point (gamma in this case)? </div>
                      <div><br>
                      </div>
                      <div>Thanks,<br>
                        Sridhar</div>
                      <div>Purdue University</div>
                      <div><br>
                      </div>
                    </div>
                    <br>
                    <fieldset></fieldset>
                    <br>
                  </div>
                </div>
                <pre>_______________________________________________
Pw_forum mailing list
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a>
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a></pre>
              </blockquote>
              <br>
            </div>
            <br>
            _______________________________________________<br>
            Pw_forum mailing list<br>
            <a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
            <a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>
          </blockquote>
        </div>
        <br>
      </div>
      <br>
      <fieldset></fieldset>
      <br>
      <pre>_______________________________________________
Pw_forum mailing list
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a>
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a></pre>
    </blockquote>
    <br>
    </div></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><pre cols="72">-- 
Dr. Lorenzo Paulatto
IdR @ IMPMC -- CNRS & Université Paris 6
+33 (0)1 44 275 084 / skype: paulatz
<a href="http://www-int.impmc.upmc.fr/~paulatto/" target="_blank">http://www-int.impmc.upmc.fr/~paulatto/</a>
23-24/4é16 Boîte courrier 115, 4 place Jussieu 75252 Paris Cédex 05 </pre>
  </font></span></div>

<br>_______________________________________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a><br></blockquote></div><br></div>