Dear Paolo, <br><br>Thanks a lot for your quick response! We are using intel compiler and openmpi. Actually, someone else configured our cluster, and I had to use mpirun with option "bind-to-core" to run a job over more than one nodes. If I do not use "--bind-to-core" option, the job will be submitted to only one node with np processors. There was no problem to run other program with "--bind-to-core" option except QE, for which I got "processor affinity failure". That's why I posted my question on pw_forum. Thanks again for your reply!<br><br>Best,<br><br>Xing<br><br><br>> -----原始邮件-----<br>> 发件人: "Paolo Giannozzi" <paolo.giannozzi@uniud.it><br>> 发送时间: 2014年8月29日 星期五<br>> 收件人: "PWSCF Forum" <pw_forum@pwscf.org><br>> 抄送: <br>> 主题: Re: [Pw_forum] running PWSCF on IB-based cluster<br>> <br>> QE knows nothing about which processor is on which node.<br>> It must be related to the MPI libraries ("openmpi" and <br>> "intel mpi" are different, by the way, and one should<br>> be careful not to mix up the two) and to how MPI is<br>> started on your machine<br>> <br>> P.<br>> <br>> On Fri, 2014-08-29 at 17:53 +0800, 高星 wrote:<br>> > <br>> > Dear QE community,<br>> > <br>> > We have an infini-band based cluster with 8 computing nodes and each<br>> > nodes contains 16 cores. I compiled QE package on this cluster<br>> > successfully with compiler mpif90 (openmpi intel compiler) and there<br>> > was no problem to run  pw.x on one node with 16 processors. However,<br>> > when I tried to use two nodes (that is, -np 32), I met "processor<br>> > affinity failure". It says, "an attempt to set processor affinity has<br>> > failed - please check to ensure that your system supports such<br>> > functionality. If so, then this is probably something that should be<br>> > reported to the OMPI developers". Actually, there is no such problem<br>> > when I run other program. I am wondering if someone else met the<br>> > similar question before? And please give me any hint which may help me<br>> > on this problem! Thanks in advance!<br>> > <br>> > Best,<br>> > <br>> > Xing<br>> > <br>> > <br>> > <br>> > <br>> > <br>> > <br>> > _______________________________________________<br>> > Pw_forum mailing list<br>> > Pw_forum@pwscf.org<br>> > http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum<br>> <br>> -- <br>>  Paolo Giannozzi, Dept. Chemistry&Physics&Environment, <br>>  Univ. Udine, via delle Scienze 208, 33100 Udine, Italy<br>>  Phone +39-0432-558216, fax +39-0432-558222 <br>> <br>> _______________________________________________<br>> Pw_forum mailing list<br>> Pw_forum@pwscf.org<br>> http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum<br><br><br><span></span><br><br><br><br>