<div dir="ltr"><div class="gmail_quote"><div dir="ltr"><div>Dear all,</div><div><br></div><div>I have a problem with running examples in the PHonon folder using ./run_all_examples command although the same command works well when doing it for PW examples. There must be something special with the way ph.x runs...</div>

<div>I have Mac 10.8.5 and QE 5.0.2, which was installed without any errors just with couple warnings. The examples I was running are in its PHonon/examples folder.</div><div>I would be grateful to you for your help. May be my installation of QE lacks something...</div>

<div>Thank you</div><div><br></div><div>Please see the beginning of my log below:</div><div><br></div><div>alexey-sorokin:examples admin$ ./run_all_examples<br></div><div><br></div><div>run_all_examples: starting</div><div>

<br></div><div>/Applications/Quantum_ESPRESSO/espresso-5.0.2/PHonon/examples/example01 : starting</div><div><br></div><div>This example shows how to use pw.x and ph.x to calculate phonon</div><div>frequencies at Gamma and X for Si and C in the diamond structure and</div>

<div>for fcc-Ni.</div><div><br></div><div>  executables directory: /Applications/Quantum_ESPRESSO/espresso-5.0.2/bin</div><div>  pseudo directory:      /Applications/Quantum_ESPRESSO/espresso-5.0.2/pseudo</div><div>  temporary directory:   /Users/admin/tmp</div>

<div><br></div><div>  checking that needed directories and files exist... done</div><div><br></div><div>  running pw.x as:   /Applications/Quantum_ESPRESSO/espresso-5.0.2/bin/pw.x  -nband 1 -ntg 1 </div><div>  running ph.x as:   /Applications/Quantum_ESPRESSO/espresso-5.0.2/bin/ph.x  -nband 1 -ntg 1 </div>

<div><br></div><div>  cleaning /Users/admin/tmp... done</div><div>  running the scf calculation for Si... done</div><div>  running the phonon calculation at Gamma for Si...</div><div>Program received signal SIGSEGV: Segmentation fault - invalid memory reference.</div>

<div><br></div><div>Backtrace for this error:</div><div>#0  0x104991f92</div><div>#1  0x10499275e</div><div>#2  0x7fff8b4e3909</div><div>#3  0x7fff90aabd15</div><div>#4  0x10343a3c4</div><div>#5  0x103486d78</div><div>#6  0x10343b353</div>

<div>#7  0x103445170</div><div>#8  0x1033edc3e</div><div>#9  0x1033ce55e</div><div>#10  0x1037eeb0e</div><div>example01/run_example: line 140: 16360 Segmentation fault: 11  $PH_COMMAND < <a href="http://si.phG.in" target="_blank">si.phG.in</a> > si.phG.out</div>

<div> done</div><div>  running the phonon calculation at X for Si...</div><div>Program received signal SIGSEGV: Segmentation fault - invalid memory reference.</div><div><br></div><div>Backtrace for this error:</div><div>
#0  0x105ad2f92</div>
<div>#1  0x105ad375e</div><div>#2  0x7fff8b4e3909</div><div>#3  0x7fff90aabd15</div><div>#4  0x1045aba21</div><div>#5  0x104583901</div><div>#6  0x10450d5a6</div><div>#7  0x10492db0e</div><div>example01/run_example: line 156: 16366 Segmentation fault: 11  $PH_COMMAND < <a href="http://si.phX.in" target="_blank">si.phX.in</a> > si.phX.out</div>

<div>Error condition encountered during test: exit status = 139</div><div>Aborting</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div><br></div><div><br></div></font></span></div></div><div>-- <br></div>Best regards,<br>
Anna
</div>