<div dir="ltr"><div><div><div><div>Dear Sir,<br></div>Thats a useful information provided by you. I am actually not confident about shell script writing. Could you please provide some simple and useful scripts which would do a lot of help? For now my script is working well for changes in ecut and k points.<br>
</div>Sir, I need to know one important thing from you.. While searching for convergence point, we change many parameters like ecut, k-point grid, vacuum etc. Sir how do I go about searching this convergence point? I mean I am right now running program for variable ecut. After getting the least total energy for a corresponding ecut value; SHOULD I USE THIS ECUT VALUE FIXED FOR FURTHER CONVERGENCE TESTS like k-points? After this test then should I use both ecut and k-point for third variation? Is this the right process?<br>
</div>Could you list the most important parameters for convergence? I am right now running QE on my laptop with i3 2.2 GHz processor. It has 2x2 cores. I really want to get an estimate into the CPU times needed for scf run, phonon, band structure and transmission runs.<br>
<br></div>Regards,<br><div><div><div><br></div></div></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jul 15, 2014 at 1:45 PM, Giovanni Cantele <span dir="ltr"><<a href="mailto:giovanni.cantele@spin.cnr.it" target="_blank">giovanni.cantele@spin.cnr.it</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word">the shell script is not able to make mathematical operations, so if you write <div>ecutrho=$ecut*8</div>
<div>then it just replaces $ecut with current value, whereas the input file should contain something like</div><div>ecutrho=180</div><div>(so no mathematical operations, just value!).</div><div><br></div><div>You must use mathematical commands, like bc :</div>
<div><br></div><div>ecutrho=`echo $ecut*8 | bc -l`</div><div><br></div><div>be careful with `, it is different from ‘      </div><div><br></div><div>Giovanni</div><div><br></div><div><div><div class="h5"><br><div><div>On 15 Jul 2014, at 09:45, siddheshwar chopra <<a href="mailto:sidhusai@gmail.com" target="_blank">sidhusai@gmail.com</a>> wrote:</div>
<br><blockquote type="cite"><div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Dear Sir,<br></div>Yes I too had the same doubt that ecutrho syntax must be a problem. Thanks for the help Sir.<br></div>Actually I am using a script file to run for different "ecutrho" values.<br>

<br>ecutrho=$ecut*8;<br></div>and then ecutrho=$ecutrho  inside &system<br><br></div>Could you tell me what wrong I am doing here?<br><br></div>Regards,<br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">

On Tue, Jul 15, 2014 at 11:47 AM, Paolo Giannozzi <span dir="ltr"><<a href="mailto:paolo.giannozzi@uniud.it" target="_blank">paolo.giannozzi@uniud.it</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

Syntax "ecutrho=8*20" is not allowed in a namelist<br>
<span><font color="#888888"><br>
P.<br>
</font></span><div><div><br>
On Tue, 2014-07-15 at 11:00 +0530, siddheshwar chopra wrote:<br>
> Dear Dr. Giovanni Pizzi,<br>
><br>
> I re ran the i/p file.. i corrected the ecutrho value. But<br>
> unfortunately the same error persists. Please find attached the i/p,<br>
> o/p and crash files.<br>
><br>
> I have tried running it from a script and also directly from terminal<br>
> using "mpirun -n 3 pw.x -i <a href="http://graphene.scf20.in/" target="_blank">graphene.scf20.in</a>" .<br>
><br>
><br>
> Regards,<br>
><br>
><br>
><br>
> On Mon, Jul 14, 2014 at 9:39 PM, Giovanni Pizzi<br>
> <<a href="mailto:giovanni.pizzi@epfl.ch" target="_blank">giovanni.pizzi@epfl.ch</a>> wrote:<br>
>         Dear Siddheshwar,<br>
>         it is quite improbable that this error did not occur in your<br>
>         first run. You must have changed something between the two<br>
>         runs (and probably forgotten about it).<br>
><br>
>         In any case, in the input file you wrote 'ecutrho=' but did<br>
>         not specify any value. This for sure is (one of the possible)<br>
>         causes of the error.<br>
><br>
>         Best,<br>
>         Giovanni<br>
><br>
><br>
><br>
>         On 07/14/2014 02:01 PM, siddheshwar chopra wrote:<br>
><br>
>         > Dear Users,<br>
>         ><br>
>         > I ran the pw.x successfully using 4 processors. But again<br>
>         > when I am running the same i/p file, I am getting this<br>
>         > error:<br>
>         ><br>
>         > %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br>
>         > %%%%%%%%%%%%%%%%%%<br>
>         >      Error in routine  read_namelists (5010):<br>
>         >       reading namelist system<br>
>         >  %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br>
>         > %%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br>
>         ><br>
>         >      stopping ...<br>
>         ><br>
>         > ===================================================================================<br>
>         > =   BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES<br>
>         > =   EXIT CODE: 1<br>
>         > =   CLEANING UP REMAINING PROCESSES<br>
>         > =   YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES<br>
>         > ===================================================================================<br>
>         ><br>
>         ><br>
>         > Please tell me how to resolve this issue.<br>
>         ><br>
>         ><br>
>         > Regards,<br>
>         ><br>
>         > --<br>
>         > Dr. Siddheshwar chopra,<br>
>         > M.Sc., Ph.D (Physics)<br>
>         > Assistant Professor (Physics),<br>
>         ><br>
>         > Amity University, Noida, India.<br>
>         ><br>
>         ><br>
>         ><br>
>         ><br>
>         ><br>
>         > _______________________________________________<br>
>         > Pw_forum mailing list<br>
>         > <a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
>         > <a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>
><br>
><br>
>         --<br>
>         Giovanni Pizzi<br>
>         Post-doctoral Research Scientist<br>
>         EPFL STI IMX THEOS<br>
>         MXC 340 (Bātiment MXC)<br>
>         Station 12<br>
>         CH-1015 Lausanne (Switzerland)<br>
>         Phone: +41 21 69 31124<br>
><br>
>         _______________________________________________<br>
>         Pw_forum mailing list<br>
>         <a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
>         <a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>
><br>
><br>
><br>
> --<br>
> Dr. Siddheshwar chopra,<br>
> M.Sc., Ph.D (Physics)<br>
> Assistant Professor (Physics),<br>
><br>
> Amity University, Noida, India.<br>
><br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> Pw_forum mailing list<br>
> <a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
> <a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a></div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr"><div dir="ltr"><span style="color:rgb(204,0,0)"><span style="color:rgb(153,0,255)"><b>Dr. Siddheshwar chopra,</b></span><br>

</span><span style="color:rgb(116,27,71)"><i>M.Sc., Ph.D (Physics)<br>Assistant Professor (Physics),<br></i></span></div><span style="color:rgb(116,27,71)"><i>Amity University, Noida, India.</i></span><span style="color:rgb(116,27,71)"><i><br>

</i></span><br></div>
</div>
_______________________________________________<br>Pw_forum mailing list<br><a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" target="_blank">Pw_forum@pwscf.org</a><br><a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a></blockquote>
</div><br></div></div><div>
-- <br><br>Giovanni Cantele, PhD<br>CNR-SPIN<br>c/o Dipartimento di Fisica<br>Universita' di Napoli "Federico II"<br>Complesso Universitario M. S. Angelo - Ed. 6<br>Via Cintia, I-80126, Napoli, Italy<br>e-mail: <a href="mailto:giovanni.cantele@spin.cnr.it" target="_blank">giovanni.cantele@spin.cnr.it</a><br>
Phone: +39 081 676910<br>Skype contact: giocan74<br><br>ResearcherID: <a href="http://www.researcherid.com/rid/A-1951-2009" target="_blank">http://www.researcherid.com/rid/A-1951-2009</a><br>Web page: <a href="http://people.na.infn.it/~cantele" target="_blank">http://people.na.infn.it/~cantele</a><br>


</div>
<br></div></div><br>_______________________________________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr"><div dir="ltr"><span style="color:rgb(204,0,0)"><span style="color:rgb(153,0,255)"><b>Dr. Siddheshwar chopra,</b></span><br>
</span><span style="color:rgb(116,27,71)"><i>M.Sc., Ph.D (Physics)<br>Assistant Professor (Physics),<br></i></span></div><span style="color:rgb(116,27,71)"><i>Amity University, Noida, India.</i></span><span style="color:rgb(116,27,71)"><i><br>
</i></span><br></div>
</div>