<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-size:large">Dear qe users,</div><div class="gmail_default" style="font-size:large"><br></div><div class="gmail_default"><font size="4">Recently my ph.x job was interrupted by another workstation user who occupied the whole disk space causing ph.x not able to write files to disk. When I tried to resume it from the last run. The error occurred:</font></div>
<div class="gmail_default" style="font-size:large"><br></div><div class="gmail_default"><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">#################################################################################</font></div>
<div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"># FROM IOTK LIBRARY, VERSION 1.2.0</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"># UNRECOVERABLE ERROR (ierr=1)</font></div><div class="gmail_default">
<font size="1" color="#38761d"># ERROR IN: iotk_getline (iotk_scan.f90:947)</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"># CVS Revision: 1.23 </font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"># </font></div>
<div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">iostat=-1</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"># ERROR IN: iotk_scan_tag (iotk_scan.f90:593)</font></div><div class="gmail_default">
<font size="1" color="#38761d"># CVS Revision: 1.23 </font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"># ERROR IN: iotk_scan (iotk_scan.f90:821)</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"># CVS Revision: 1.23 </font></div>
<div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"># ERROR IN: iotk_scan_begin (iotk_scan.f90:98)</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"># CVS Revision: 1.23 </font></div><div class="gmail_default">
<font size="1" color="#38761d">########################################################################################################################</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">--------------------------------------------------------------------------</font></div>
<div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD </font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">with errorcode 1.</font></div>
<div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"><br></font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.</font></div><div class="gmail_default">
<font size="1" color="#38761d">You may or may not see output from other processes, depending on</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">exactly when Open MPI kills them.</font></div><div class="gmail_default">
<font size="1" color="#38761d">--------------------------------------------------------------------------</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">--------------------------------------------------------------------------</font></div>
<div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">mpirun has exited due to process rank 0 with PID 2898 on</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">node HotCarrier-Z820 exiting improperly. There are two reasons this could occur:</font></div>
<div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"><br></font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">1. this process did not call "init" before exiting, but others in</font></div>
<div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">the job did. This can cause a job to hang indefinitely while it waits</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">for all processes to call "init". By rule, if one process calls "init",</font></div>
<div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">then ALL processes must call "init" prior to termination.</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"><br></font></div><div class="gmail_default">
<font size="1" color="#38761d">2. this process called "init", but exited without calling "finalize".</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">By rule, all processes that call "init" MUST call "finalize" prior to</font></div>
<div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">exiting or it will be considered an "abnormal termination"</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"><br></font></div><div class="gmail_default">
<font size="1" color="#38761d">This may have caused other processes in the application to be</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">terminated by signals sent by mpirun (as reported here).</font></div>
<div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d">--------------------------------------------------------------------------</font></div><div class="gmail_default"><font size="1" color="#38761d"><br></font></div><div class="gmail_default">
<font size="1" color="#38761d">[1]+  Exit 1                  mpirun -np 8 ph.x < <a href="http://SnS62.ph.in">SnS62.ph.in</a> > SnS62.ph.out2</font></div><div style="font-size:large"><br></div></div><div class="gmail_default" style="font-size:large">
Any idea that can help me resume the job which has been running for weeks? I will cry for a day if I need to start it from scratch. I will appreciate any suggestion. Thanks a lot.</div><div class="gmail_default" style="font-size:large">
<br></div><div><br></div>-- <br><i>Best Regards,</i><br><div style="text-decoration:underline">Hongze Xia</div><div>PhD candidate in Photovoltaics Engineering</div><div>University of New South Wales</div><div>Sydney 2052 Australia</div>

</div>