<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    <div class="moz-cite-prefix">if you are performing a microcanonical
      MD simulation the total energy is conserved but not the kinetic
      energy that is related to the instantaneous temperature.<br>
      kinetic energy fluctuates around an average value. the larger the 
      number of atoms the smaller should be temperature fluctuation.<br>
      <br>
      stefano <br>
      <br>
      On 02/19/2013 08:12 PM, dev pe wrote:<br>
    </div>
    <blockquote
cite="mid:CAG1HzpEu4uZ1L+bw0eR77wAtL58mvgXRYqbn_qXsAoY5ZVrhqA@mail.gmail.com"
      type="cite">
      <pre wrap="">Dear QE users
I am trying to model amorphous Si using heat-and-quench by BO molecular
dynamics (based on example3). My starting temperature is 1600K. But, In my
output file, after every step, I see a different instantaneous temperature
printed. Why is that so? Am I missing any input parameter? My input file is
as given below:

 &control
    calculation='md'
    restart_mode='from_scratch',
    prefix = 'Si'
    pseudo_dir = '/home/deva/espresso-5.0.1/pseudo/',
    outdir='./',
    dt=20,
    nstep=60,
    disk_io='high'
 /
 &system
    ibrav= 1, celldm(1)=10.18, nat=  8, ntyp= 1,
    ecutwfc = 20.0, nosym=.true.
 /
 &electrons
    conv_thr =  1.0d-8,
    mixing_beta = 0.7
 /
 &ions
    ion_dynamics='verlet'
    pot_extrapolation='second-order'
    wfc_extrapolation='second-order'
    ion_temperature='reduce-T'
    tempw=1600.D0
    delta_t=-400.D0
    nraise=20
 /
ATOMIC_SPECIES
 Si  28.086  Si.pz-vbc.UPF
ATOMIC_POSITIONS
 Si -0.123 -0.123 -0.123
 Si  0.377  0.377 -0.123
 Si  0.377 -0.123  0.377
 Si -0.123  0.377  0.377
 Si  0.123  0.123  0.123
 Si  0.623  0.623  0.123
 Si  0.623  0.123  0.623
 Si  0.123  0.623  0.623
K_POINTS {automatic}
 1 1 1 0 0 0

Thanks in advance
Devan
PhD student
UMD
College Park

</pre>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
Pw_forum mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a></pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>