<br><br><div class="gmail_quote">On Sun, Dec 30, 2012 at 8:27 PM, vijaya subramanian <span dir="ltr"><<a href="mailto:vijaya65@hotmail.com" target="_blank">vijaya65@hotmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">



<div><div dir="ltr"><br><br><div><div></div><hr>From: <a href="mailto:vijaya65@hotmail.com" target="_blank">vijaya65@hotmail.com</a><br>To: <a href="mailto:pw_users@pwscf.org" target="_blank">pw_users@pwscf.org</a><br>Subject: Error in routine cdiaghg (81):      S matrix not positive definite<br>
Date: Mon, 31 Dec 2012 04:24:43 +0000<br><br>


<div dir="ltr">Hi<br>I am trying to run a relaxation calculation on a polymer crystal and get the following error message:<br><br>     Program PWSCF v.5.0.1 starts on 30Dec2012 at 10:30:12 <br><br>     This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite<br>
     for quantum simulation of materials; please cite<br>         "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);<br>          URL <a href="http://www.quantum-espresso.org" target="_blank">http://www.quantum-espresso.org</a>", <br>
     in publications or presentations arising from this work. More details at<br>     <a href="http://www.quantum-espresso.org/quote.php" target="_blank">http://www.quantum-espresso.org/quote.php</a><br><br>     Serial version<br>
<br>     Current dimensions of program PWSCF are:<br>     Max number of different atomic species (ntypx) = 10<br>     Max number of k-points (npk) =  40000<br>     Max angular momentum in pseudopotentials (lmaxx) =  3<br>
     Waiting for input...<br>     Reading input from standard input<br>     Found symmetry operation: I + ( -0.5000 -0.5000  0.0000)<br>     This is a supercell, fractional translations are disabled<br><br>     G-vector sticks info<br>
     --------------------<br>     sticks:   dense  smooth     PW     G-vecs:    dense   smooth      PW<br>     Sum        3587    1913    597                63877    24887    4339<br><br><br><br>     bravais-lattice index     =            0<br>
     lattice parameter (alat)  =      16.2138  a.u.<br>     unit-cell volume          =     727.7673 (a.u.)^3<br>     number of atoms/cell      =           24<br>     number of atomic types    =            3<br>     number of electrons       =        96.00<br>
     number of Kohn-Sham states=           48<br>     kinetic-energy cutoff     =      40.0000  Ry<br>     charge density cutoff     =     300.0000  Ry<br>     convergence threshold     =      1.0E-05<br>     mixing beta               =       0.9000<br>
     number of iterations used =            8  plain     mixing<br>     Exchange-correlation      =  SLA  PW   PBE  PBE ( 1 4 3 4 0)<br>     EXX-fraction              =        0.00<br>     nstep                     =           50<br>
<br><br>     celldm(1)=   0.000000  celldm(2)=   0.000000  celldm(3)=   0.000000<br>     celldm(4)=   0.000000  celldm(5)=   0.000000  celldm(6)=   0.000000<br><br>     crystal axes: (cart. coord. in units of alat)<br>               a(1) = (   1.000000   0.000000   0.000000 )  <br>
               a(2) = (   0.000000   0.572259   0.000000 )  <br>               a(3) = (   0.000000   0.000000   0.298363 )  <br><br>     reciprocal axes: (cart. coord. in units 2 pi/alat)<br>               b(1) = (  1.000000  0.000000  0.000000 )  <br>
               b(2) = (  0.000000  1.747459  0.000000 )  <br>               b(3) = (  0.000000  0.000000  3.351621 )  <br><br><br>     PseudoPot. # 1 for C  read from file:<br>     /home/vijaya/espresso-5.0.1/pseudo/C.pbe-van_ak.UPF<br>
     MD5 check sum: 208ba58bdb8fe35738797ed1568e775a<br>     Pseudo is Ultrasoft, Zval =  4.0<br>     Generated by new atomic code, or converted to UPF format<br>     Using radial grid of  721 points,  4 beta functions with: <br>
                l(1) =   0<br>                l(2) =   0<br>                l(3) =   1<br>                l(4) =   1<br>     Q(r) pseudized with  8 coefficients,  rinner =    0.800   0.800   0.800<br><br><br>     PseudoPot. # 2 for F  read from file:<br>
     /home/vijaya/espresso-5.0.1/pseudo/F.pbe-n-van.UPF<br>     MD5 check sum: 5af8ef079e3593d0ade90c3850d63ba5<br>     Pseudo is Ultrasoft + core correction, Zval =  7.0<br>     Generated by new atomic code, or converted to UPF format<br>
     Using radial grid of  799 points,  6 beta functions with: <br>                l(1) =   0<br>                l(2) =   0<br>                l(3) =   0<br>                l(4) =   1<br>                l(5) =   1<br>                l(6) =   1<br>
     Q(r) pseudized with  6 coefficients,  rinner =    1.200   1.200   1.200<br><br><br>     PseudoPot. # 3 for H  read from file:<br>     /home/vijaya/espresso-5.0.1/pseudo/H.pbe-van_ak.UPF<br>     MD5 check sum: 077eb6d537518a38cb46c6de387227b7<br>
     Pseudo is Ultrasoft, Zval =  1.0<br>     Generated by new atomic code, or converted to UPF format<br>     Using radial grid of  615 points,  1 beta functions with: <br>                l(1) =   0<br>     Q(r) pseudized with  8 coefficients,  rinner =    0.800<br>
<br>     atomic species   valence    mass     pseudopotential<br>        C              4.00    12.01100     C ( 1.00)<br>        F              7.00    18.99800     F ( 1.00)<br>        H              1.00     1.00794     H ( 1.00)<br>
<br>      2 Sym. Ops. (no inversion) found<br><br><br><br>   Cartesian axes<br><br>     site n.     atom                  positions (alat units)<br>         1           C   tau(   1) = (   0.0000000   0.0000000   0.0000000  )<br>
         2           C   tau(   2) = (   0.0000000   0.0995737   0.1491846  )<br>         3           C   tau(   3) = (   0.0000000   0.0000000   0.2983692  )<br>         4           C   tau(   4) = (   0.0000000   0.0995737   0.4475538  )<br>
         5           F   tau(   5) = (   0.1260004   0.2031533   0.1491846  )<br>         6           F   tau(   6) = (  -0.1260004   0.2031533   0.1491846  )<br>         7           F   tau(   7) = (   0.1260004   0.2031533   0.4475538  )<br>
         8           F   tau(   8) = (  -0.1260004   0.2031533   0.4475538  )<br>         9           H   tau(   9) = (   0.1050003  -0.0709606   0.0000000  )<br>        10           H   tau(  10) = (  -0.1050003  -0.0709606   0.0000000  )<br>
        11           H   tau(  11) = (   0.1050003  -0.0709606   0.2983692  )<br>        12           H   tau(  12) = (  -0.1050003  -0.0709606   0.2983692  )<br>        13           C   tau(  13) = (   0.5000015   0.2861314   0.0000000  )<br>
        14           C   tau(  14) = (   0.5000015   0.3857052   0.1491846  )<br>        15           C   tau(  15) = (   0.5000015   0.2861314   0.2983692  )<br>        16           C   tau(  16) = (   0.5000015   0.3857052   0.4475538  )<br>
        17           F   tau(  17) = (   0.6260019   0.4892847   0.1491846  )<br>        18           F   tau(  18) = (   0.3740012   0.4892847   0.1491846  )<br>        19           F   tau(  19) = (   0.6260019   0.4892847   0.4475538  )<br>
        20           F   tau(  20) = (   0.3740012   0.4892847   0.4475538  )<br>        21           H   tau(  21) = (   0.6050019   0.2151708   0.0000000  )<br>        22           H   tau(  22) = (   0.3950012   0.2151708   0.0000000  )<br>
        23           H   tau(  23) = (   0.6050019   0.2151708   0.2983692  )<br>        24           H   tau(  24) = (   0.3950012   0.2151708   0.2983692  )<br><br>     number of k points=     4<br>                       cart. coord. in units 2pi/alat<br>
        k(    1) = (   0.0000000   0.0000000   0.0000000), wk =   0.5000000<br>        k(    2) = (   0.0000000   0.0000000  -1.6758103), wk =   0.5000000<br>        k(    3) = (   0.0000000  -0.8737296   0.0000000), wk =   0.5000000<br>
        k(    4) = (   0.0000000  -0.8737296  -1.6758103), wk =   0.5000000<br><br>     Dense  grid:    63877 G-vectors     FFT dimensions: (  90,  54,  27)<br><br>     Smooth grid:    24887 G-vectors     FFT dimensions: (  72,  40,  20)<br>
<br>     Largest allocated arrays     est. size (Mb)     dimensions<br>        Kohn-Sham Wavefunctions         2.30 Mb     (   3144,   48)<br>        NL pseudopotentials             8.06 Mb     (   3144,  168)<br>        Each V/rho on FFT grid          2.00 Mb     ( 131220)<br>
        Each G-vector array             0.49 Mb     (  63877)<br>        G-vector shells                 0.07 Mb     (   8822)<br>     Largest temporary arrays     est. size (Mb)     dimensions<br>        Each subspace H/S matrix        0.04 Mb     (  48,  48)<br>
        Each <psi_i|beta_j> matrix      0.12 Mb     (    168,   48)<br>        Arrays for rho mixing          16.02 Mb     ( 131220,   8)<br><br>     Check: negative/imaginary core charge=   -0.000001    0.000000<br>
<br>     Initial potential from superposition of free atoms<br><br>     starting charge   95.99960, renormalised to   96.00000<br>     Starting wfc are   72 randomized atomic wfcs<br><br>     total cpu time spent up to now is        9.6 secs<br>
<br>     per-process dynamical memory:    41.3 Mb<br><br>     Self-consistent Calculation<br><br>     iteration #  1     ecut=    40.00 Ry     beta=0.90<br></div></div></div></div></blockquote><div> you can try with default value of beta=0.7 then see what happens. <br>
</div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">     CG style diagonalization<br><br> %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br>
     Error in routine cdiaghg (81):<br>     S matrix not positive definite<br> %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br><br>     stopping ...<br><br><br>I have searched the forum but not found any solution to the problem.  Does anyone know what is wrong in the input<br>
that gives me this error?<br>Thanks<br>Vijaya<br><br>UNM<br>                                        </div></div>                                        </div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://pwscf.org/mailman/listinfo/pw_forum</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Thanks and Regards<br>Bramha Prasad Pandey<br>Indian School of Mines(ISM)<br>
Dhanbad, INDIA.<br>