<br clear="all">~Best Regards<br>...........................................................<br>Sanjay D. Gupta<br>Research Fellow<br>Department of Physics,<br>Bhavnagar University, Bhavnagar-364 022<br>Gujarat, Mobile-9879666643<br>
<a href="mailto:email%3Aguptasanjay_56@yahoo.co.in" target="_blank">email:guptasanjay_56@yahoo.co.in</a><br>...........................................................<br>
<br><br><div class="gmail_quote">On Sun, Sep 4, 2011 at 6:07 PM,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:pw_forum-request@pwscf.org">pw_forum-request@pwscf.org</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
Send Pw_forum mailing list submissions to<br>
        <a href="mailto:pw_forum@pwscf.org">pw_forum@pwscf.org</a><br>
<br>
To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
        <a href="http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>
or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
        <a href="mailto:pw_forum-request@pwscf.org">pw_forum-request@pwscf.org</a><br>
<br>
You can reach the person managing the list at<br>
        <a href="mailto:pw_forum-owner@pwscf.org">pw_forum-owner@pwscf.org</a><br>
<br>
When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
than "Re: Contents of Pw_forum digest..."<br>
<br>
<br>
Today's Topics:<br>
<br>
   1. Problem while Reading celldm of triclinic structure<br>
      (Sanjay D. Gupta)<br>
   2. Re: Problem while Reading celldm of triclinic structure<br>
      (Paolo Giannozzi)<br>
   3. problems with the new Martins-Troullier O pseudo<br>
      (<a href="mailto:giuseppe.mattioli@mlib.ism.cnr.it">giuseppe.mattioli@mlib.ism.cnr.it</a>)<br>
   4. about PWscf PP generation (Robin H)<br>
<br>
<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
<br>
Message: 1<br>
Date: Sun, 4 Sep 2011 14:30:17 +0530<br>
From: "Sanjay D. Gupta" <<a href="mailto:guptasanjay.56@gmail.com">guptasanjay.56@gmail.com</a>><br>
Subject: [Pw_forum] Problem while Reading celldm of triclinic<br>
        structure<br>
To: <a href="mailto:pw_forum@pwscf.org">pw_forum@pwscf.org</a><br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:CAOPqkQZS_iw-0rO1GCMRc1BDeOLoO%2BozW4oJJoXQ2RfA7_Gk3w@mail.gmail.com">CAOPqkQZS_iw-0rO1GCMRc1BDeOLoO+ozW4oJJoXQ2RfA7_Gk3w@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>
<br>
Dear,<br>
Dear QE professionals,<br>
I am running a scf  calcuation for triclinic strcture but while reading<br>
input file it shows<br>
"Bad data for namelist object celldm<br>
Bad data for namelist object celldm"<br>
<br>
But program running without any error and giving output without considering<br>
the celldm(4) and celldm(5) from the input file.<br>
<br>
Here with i am pasting the output portion  of reading the name list  and<br>
input file.<br>
<br>
**************************************************<br>
Part of out put program<br>
<br>
<br>
     Program PWSCF v.4.3        starts on  4Sep2011 at 14:17:47<br>
<br>
     This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite<br>
     for quantum simulation of materials; please cite<br>
         "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);<br>
          URL <a href="http://www.quantum-espresso.org" target="_blank">http://www.quantum-espresso.org</a>",<br>
     in publications or presentations arising from this work. More details<br>
at<br>
     <a href="http://www.quantum-espresso.org/wiki/index.php/Citing_Quantum-ESPRESSO" target="_blank">http://www.quantum-espresso.org/wiki/index.php/Citing_Quantum-ESPRESSO</a><br>
<br>
     Parallel version (MPI), running on     4 processors<br>
     R & G space division:  proc/pool =    4<br>
<br>
     Current dimensions of program PWSCF are:<br>
     Max number of different atomic species (ntypx) = 10<br>
     Max number of k-points (npk) =  40000<br>
     Max angular momentum in pseudopotentials (lmaxx) =  3<br>
     Waiting for input...<br>
<br>
     Subspace diagonalization in iterative solution of the eigenvalue<br>
problem:<br>
     a serial algorithm will be used<br>
<br>
<br>
   Stick Mesh<br>
   ----------<br>
   nst =  3101,  nstw =   449, nsts =  1537<br>
               <a href="http://n.st" target="_blank">n.st</a>   n.stw   n.sts    n.g    <a href="http://n.gw" target="_blank">n.gw</a>   <a href="http://n.gs" target="_blank">n.gs</a><br>
   min         775     112     384   30335    1673   10698<br>
   max         776     113     385   30338    1674   10713<br>
       3101     449    1537  121343    6695   42829<br>
<br>
<br>
<br>
     bravais-lattice index     =           14<br>
     lattice parameter (a_0)   =       8.8896  a.u.<br>
     unit-cell volume          =     897.7308 (a.u.)^3<br>
     number of atoms/cell      =            6<br>
     number of atomic types    =            3<br>
     number of electrons       =        49.00<br>
     number of Kohn-Sham states=           30<br>
     kinetic-energy cutoff     =      50.0000  Ry<br>
     charge density cutoff     =     400.0000  Ry<br>
     convergence threshold     =      1.0E-08<br>
     mixing beta               =       0.7000<br>
     number of iterations used =            8  local-TF  mixing<br>
     Exchange-correlation      =  SLA  PW   PBE  PBE (1434)<br>
     EXX-fraction              =        0.00<br>
<br>
     celldm(1)=   8.889603  celldm(2)=   1.241632  celldm(3)=   1.037384<br>
     celldm(4)=   0.000000  celldm(5)=   0.000000  celldm(6)=   0.125247<br>
<br>
     crystal axes: (cart. coord. in units of a_0)<br>
               a(1) = (   1.000000   0.000000   0.000000 )<br>
               a(2) = (   0.155510   1.231855   0.000000 )<br>
               a(3) = (   0.000000   0.000000   1.037384 )<br>
<br>
     reciprocal axes: (cart. coord. in units 2 pi/a_0)<br>
               b(1) = (  1.000000 -0.126241  0.000000 )<br>
               b(2) = (  0.000000  0.811784  0.000000 )<br>
               b(3) = (  0.000000  0.000000  0.963964 )<br>
*********************************************************************<br>
<br>
<br>
here with i am also pasting the input file for further details.<br>
<br>
&control<br>
    calculation = 'scf',<br>
    prefix='CuWO4',<br>
    restart_mode='from_scratch',<br>
    outdir='./'<br>
    pseudo_dir = '/PWSCF/pseudo/',<br>
    tstress = .true.<br>
    tprnfor = .true.<br>
    wf_collect = .true.<br>
    etot_conv_thr = 1.0d-5,<br>
    forc_conv_thr = 1.0d-4,<br>
 /<br>
 &system<br>
    ibrav= 14,<br>
    celldm(1) = 8.889603025,<br>
    celldm(2) = 1.241632288,<br>
    celldm(3) = 1.037383575,<br>
    celldm(4) = -0.029264993,<br>
    celldm(5) = -0.043078844,<br>
    celldm(6) =  0.1252466553,<br>
    nosym = .true.,<br>
    nat= 6,<br>
    ntyp= 3,<br>
    ecutwfc = 50,<br>
    ecutrho= 400,<br>
    occupations= 'smearing',<br>
    smearing= 'm-p',<br>
    degauss= 0.05,<br>
 /<br>
 &electrons<br>
     mixing_mode     = "local-TF",<br>
     mixing_beta     =  0.700000,<br>
     conv_thr        =  1.0d-08,<br>
/<br>
ATOMIC_SPECIES<br>
Cu  63.546  Cu.pbe-n-van_ak.UPF<br>
W   183.84  W.pbe-nsp-van.UPF<br>
O   15.9994 O.pbe-van_ak.UPF<br>
ATOMIC_POSITIONS (crystal)<br>
Cu   0.4953300000E+00    0.6597600000E+00    0.2448100000E+00<br>
W    0.2106000000E-01    0.1734800000E+00    0.2542900000E+00<br>
O    0.2491000000E+00    0.3535000000E+00    0.4245000000E+00<br>
O    0.2145000000E+00    0.8812000000E+00    0.4309000000E+00<br>
O    0.7353000000E+00    0.3803000000E+00    0.9810000000E-01<br>
O    0.7826000000E+00    0.9079000000E+00    0.5330000000E-01<br>
K_POINTS automatic<br>
6 6 6 0 0 0<br>
<br>
Please suggest me more.<br>
<br>
Waiting for positive reply.<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
~Best Regards<br>
...........................................................<br>
Sanjay D. Gupta<br>
Research Fellow<br>
Department of Physics,<br>
Bhavnagar University, Bhavnagar-364 022<br>
Gujarat, Mobile-9879666643<br>
<a href="mailto:email%3Aguptasanjay_56@yahoo.co.in">email:guptasanjay_56@yahoo.co.in</a><br>
...........................................................<br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <a href="http://www.democritos.it/pipermail/pw_forum/attachments/20110904/a94d6e2b/attachment-0001.htm" target="_blank">http://www.democritos.it/pipermail/pw_forum/attachments/20110904/a94d6e2b/attachment-0001.htm</a><br>

<br>
------------------------------<br>
<br>
Message: 2<br>
Date: Sun, 4 Sep 2011 11:19:24 +0200<br>
From: Paolo Giannozzi <<a href="mailto:giannozz@democritos.it">giannozz@democritos.it</a>><br>
Subject: Re: [Pw_forum] Problem while Reading celldm of triclinic<br>
        structure<br>
To: PWSCF Forum <<a href="mailto:pw_forum@pwscf.org">pw_forum@pwscf.org</a>><br>
Message-ID: <<a href="mailto:65A2705B-9FDC-47DE-B6D9-E1BC630CA25A@democritos.it">65A2705B-9FDC-47DE-B6D9-E1BC630CA25A@democritos.it</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset=UTF-8; format=flowed<br>
<br>
<br>
On Sep 4, 2011, at 11:00 , Sanjay D. Gupta wrote:<br>
<br>
>     celldm(4) = ?0.029264993,<br>
>     celldm(5) = ?0.043078844,<br>
<br>
the "minus" sign in front of the numbers is not a minus,<br>
it is a dash. Compare with the correct character: </blockquote><div>Dear Sir,<br></div><div>Thank you very much <br>This was my silly mistake now its working fine.<br>Thanks once again for quick reply.<br>With kind Regards<br>
Sanjay D Gupta<br><br> <br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
>     celldm(4) = -0.029264993,<br>
>     celldm(5) = -0.043078844,<br>
<br>
P.<br>
---<br>
Paolo Giannozzi, Dept of Chemistry&Physics&Environment,<br>
Univ. Udine, via delle Scienze 208, 33100 Udine, Italy<br>
Phone +39-0432-558216, fax +39-0432-558222<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Message: 3<br>
Date: Sun,  4 Sep 2011 13:37:49 +0200<br>
From: <a href="mailto:giuseppe.mattioli@mlib.ism.cnr.it">giuseppe.mattioli@mlib.ism.cnr.it</a><br>
Subject: [Pw_forum] problems with the new Martins-Troullier O pseudo<br>
To: PWSCF Forum <<a href="mailto:pw_forum@pwscf.org">pw_forum@pwscf.org</a>><br>
Message-ID: <<a href="mailto:20110904133749.3x4zy8ri84c8www0@webmail.sic.rm.cnr.it">20110904133749.3x4zy8ri84c8www0@webmail.sic.rm.cnr.it</a>><br>
Content-Type: text/plain;       charset=ISO-8859-1;     DelSp="Yes";<br>
        format="flowed"<br>
<br>
<br>
Dear all<br>
<br>
My 4.3.2 QE version (but I tried also with older ones) crashes when<br>
used with the new O.pbe-mt.UPF pseudopotential. No problems with other<br>
ones, so the error  should depend on the new PP file.<br>
The output stops at<br>
<br>
      Program PWSCF v.4.3.2      starts on  4Sep2011 at 13:25:53<br>
<br>
      This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite<br>
      for quantum simulation of materials; please cite<br>
          "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);<br>
           URL <a href="http://www.quantum-espresso.org" target="_blank">http://www.quantum-espresso.org</a>",<br>
      in publications or presentations arising from this work. More details at<br>
      <a href="http://www.quantum-espresso.org/wiki/index.php/Citing_Quantum-ESPRESSO" target="_blank">http://www.quantum-espresso.org/wiki/index.php/Citing_Quantum-ESPRESSO</a><br>
<br>
      Parallel version (MPI), running on     4 processors<br>
      R & G space division:  proc/pool =    4<br>
<br>
      Current dimensions of program PWSCF are:<br>
      Max number of different atomic species (ntypx) = 10<br>
      Max number of k-points (npk) =  40000<br>
      Max angular momentum in pseudopotentials (lmaxx) =  3<br>
      Waiting for input...<br>
      Reading input from stdin<br>
rank 0 in job 17  debian_53881   caused collective abort of all ranks<br>
   exit status of rank 0: killed by signal 9<br>
<br>
and my nohup.out file contains<br>
<br>
##################################################################<br>
# FROM IOTK LIBRARY, VERSION 1.2.0<br>
# UNRECOVERABLE ERROR (ierr=1)<br>
# ERROR IN: iotk_scan_attr (iotk_attr+CHARACTER1_0.f90:207)<br>
# CVS Revision: 1.21<br>
#################################################################<br>
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0<br>
<br>
What's wrong?<br>
<br>
Yours<br>
<br>
Giuseppe<br>
<br>
<br>
Giuseppe Mattioli<br>
ISM-CNR<br>
Italy<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Message: 4<br>
Date: Sun, 4 Sep 2011 20:37:09 +0800<br>
From: Robin H <<a href="mailto:robinshy@gmail.com">robinshy@gmail.com</a>><br>
Subject: [Pw_forum] about PWscf PP generation<br>
To: <a href="mailto:pw_forum@pwscf.org">pw_forum@pwscf.org</a><br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:CALd2EARMm3Sk6hLhviY2mx-m6rZFS6KetYAyzfZp36cyQmQ2Bw@mail.gmail.com">CALd2EARMm3Sk6hLhviY2mx-m6rZFS6KetYAyzfZp36cyQmQ2Bw@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>
<br>
Hello everyone, I used revisedPBE to generate  PWscf  PP of La atom.But for<br>
the first time I met a mistake like this<br>
  Program LD1 v.4.3.1        starts on  4Sep2011 at 19:53:36<br>
     This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite<br>
     for quantum simulation of materials; please cite<br>
         "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);<br>
          URL <a href="http://www.quantum-espresso.org" target="_blank">http://www.quantum-espresso.org</a>",<br>
     in publications or presentations arising from this work. More details<br>
at<br>
     <a href="http://www.quantum-espresso.org/wiki/index.php/Citing_Quantum-ESPRESSO" target="_blank">http://www.quantum-espresso.org/wiki/index.php/Citing_Quantum-ESPRESSO</a><br>
     Parallel version (MPI), running on     1 processors<br>
 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br>
     from el_config : error #        12<br>
     wavefunction 5S found too many times<br>
 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br>
     stopping ...<br>
[unset]: aborting job:<br>
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 0) - process 0<br>
since the input is like this<br>
 &input<br>
    title='La'<br>
    zed=57.<br>
    rel=1,<br>
    config='[Xe] 5s2.00 5p6.00 6s2.00 5d1.00',<br>
    iswitch=3,<br>
    dft='revPBE'<br>
 /<br>
 &inputp<br>
   lloc=1,<br>
   pseudotype=3,<br>
   nlcc=.true.,<br>
   tm=.true.,<br>
   file_pseudopw='La.revPBE.UPF',<br>
 /<br>
5<br>
5D  3  2  1.00   0.00  2.20  2.20<br>
5D  3  2  0.00   0.05  2.20  2.20<br>
6S  1  0  2.00   0.00  2.20  2.20<br>
6S  1  0  0.00   0.05  2.20  2.20<br>
5P  2  1  6.00   0.00  2.20  2.00<br>
 Is there anything wrong in my electric configuration of La?<br>
as I changed like this :<br>
&input<br>
    title='La'<br>
    zed=57.<br>
    rel=1,<br>
    config='[Xe] 5s2.00 5p6.00 6s1.50 5d1.00 6p0.50',<br>
    iswitch=3,<br>
    dft='revPBE'<br>
 /<br>
 &inputp<br>
   lloc=1,<br>
   pseudotype=3,<br>
   nlcc=.true.,<br>
   tm=.true.,<br>
   file_pseudopw='La.revPBE.UPF',<br>
 /<br>
5<br>
5S  1  0  2.00   0.00  2.20  2.20<br>
5P  2  1  6.00   0.00  2.20  2.20<br>
5D  3  2  1.00   0.00  2.20  2.20<br>
6S  1  0  1.50   0.00  2.20  2.20<br>
6P  2  1  0.50   0.00  2.20  2.00<br>
the error is still exist like the fomer.what's the error suggest ?I'm<br>
wondered that how to write the list of states following the namelist of<br>
&inputp.I tried to find some information in the reference of PWscf to make<br>
me clear,but this part seemed  hard to understand,hope everyone who is<br>
sophisticated at PP generation to give me some tips, I'm appreciated.<br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <a href="http://www.democritos.it/pipermail/pw_forum/attachments/20110904/f9fdfd99/attachment.htm" target="_blank">http://www.democritos.it/pipermail/pw_forum/attachments/20110904/f9fdfd99/attachment.htm</a><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>
<br>
<br>
End of Pw_forum Digest, Vol 51, Issue 7<br>
***************************************<br>
</blockquote></div><br>