<html>
<head>
<style><!--
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Tahoma
}
--></style>
</head>
<body class='hmmessage'><div dir='ltr'>
The list of q-points are in crystal coordinates, while matdyn.x requires the list in units of 2pi/a_0. That is G-M-K-G goes form (0.0, 0.0) - (0.0, 1/sqrt(3)) - (1/3, 1/sqrt(3)) - (0.0, 0.0).<br><br>Good luck,<br>Vasse<br><br><div><hr id="stopSpelling">From: yhho@pub.iams.sinica.edu.tw<br>To: pw_forum@pwscf.org<br>Date: Thu, 16 Jun 2011 11:20:58 +0800<br>Subject: Re: [Pw_forum] graphene phonon dispersion<br><br>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=unicode">
<meta name="Generator" content="Microsoft SafeHTML">


<style>
</style>


<div><font size="2">
<div><font size="2">Sorry I forgot it.</font></div>
<div><font size="2">This is matdyn.in. Thank you very much.</font></div>
<div> </div>
<div><font size="2">(matdyn.in)</font> </div>
<div><font size="2">&input<br>    asr='simple',  
amass(1)=12.0107,<br>    flfrc='AuC444.fc', 
flfrq='AuC.freq'<br> /<br>  121<br>  0.00000000  
0.00000000  0.00000000    1<br>  0.00000000  
-.01250000  0.00000000    2<br>  0.00000000  
-.02500000  0.00000000    3<br>  0.00000000  
-.03750000  0.00000000    4<br>  0.00000000  
-.05000000  0.00000000    5<br>  0.00000000  
-.06250000  0.00000000    6<br>  0.00000000  
-.07500000  0.00000000    7<br>  0.00000000  
-.08750000  0.00000000    8<br>  0.00000000  
-.10000000  0.00000000    9<br>  0.00000000  
-.11250000  0.00000000   10<br>  0.00000000  
-.12500000  0.00000000   11<br>  0.00000000  
-.13750000  0.00000000   12<br>  0.00000000  
-.15000000  0.00000000   13<br>  0.00000000  
-.16250000  0.00000000   14<br>  0.00000000  
-.17500000  0.00000000   15<br>  0.00000000  
-.18750000  0.00000000   16<br>  0.00000000  
-.20000000  0.00000000   17<br>  0.00000000  
-.21250000  0.00000000   18<br>  0.00000000  
-.22500000  0.00000000   19<br>  0.00000000  
-.23750000  0.00000000   20<br>  0.00000000  
-.25000000  0.00000000   21<br>  0.00000000  
-.26250000  0.00000000   22<br>  0.00000000  
-.27500000  0.00000000   23<br>  0.00000000  
-.28750000  0.00000000   24<br>  0.00000000  
-.30000000  0.00000000   25<br>  0.00000000  
-.31250000  0.00000000   26<br>  0.00000000  
-.32500000  0.00000000   27<br>  0.00000000  
-.33750000  0.00000000   28<br>  0.00000000  
-.35000000  0.00000000   29<br>  0.00000000  
-.36250000  0.00000000   30<br>  0.00000000  
-.37500000  0.00000000   31<br>  0.00000000  
-.38750000  0.00000000   32<br>  0.00000000  
-.40000000  0.00000000   33<br>  0.00000000  
-.41250000  0.00000000   34<br>  0.00000000  
-.42500000  0.00000000   35<br>  0.00000000  
-.43750000  0.00000000   36<br>  0.00000000  
-.45000000  0.00000000   37<br>  0.00000000  
-.46250000  0.00000000   38<br>  0.00000000  
-.47500000  0.00000000   39<br>  0.00000000  
-.48750000  0.00000000   40<br>  0.00000000  
-.50000000  0.00000000   41<br>  0.00833750  
-.50416950  0.00000000   42<br>  0.01667500  
-.50833900  0.00000000   43<br>  0.02501250  
-.51250850  0.00000000   44<br>  0.03335000  
-.51667800  0.00000000   45<br>  0.04168750  
-.52084750  0.00000000   46<br>  0.05002500  
-.52501700  0.00000000   47<br>  0.05836250  
-.52918650  0.00000000   48<br>  0.06670000  
-.53335600  0.00000000   49<br>  0.07503750  
-.53752550  0.00000000   50<br>  0.08337500  
-.54169500  0.00000000   51<br>  0.09171250  
-.54586450  0.00000000   52<br>  0.10005000  
-.55003400  0.00000000   53<br>  0.10838750  
-.55420350  0.00000000   54<br>  0.11672500  
-.55837300  0.00000000   55<br>  0.12506250  
-.56254250  0.00000000   56<br>  0.13340000  
-.56671200  0.00000000   57<br>  0.14173750  
-.57088150  0.00000000   58<br>  0.15007500  
-.57505100  0.00000000   59<br>  0.15841250  
-.57922050  0.00000000   60<br>  0.16675000  
-.58339000  0.00000000   61<br>  0.17508750  
-.58755950  0.00000000   62<br>  0.18342500  
-.59172900  0.00000000   63<br>  0.19176250  
-.59589850  0.00000000   64<br>  0.20010000  
-.60006800  0.00000000   65<br>  0.20843750  
-.60423750  0.00000000   66<br>  0.21677500  
-.60840700  0.00000000   67<br>  0.22511250  
-.61257650  0.00000000   68<br>  0.23345000  
-.61674600  0.00000000   69<br>  0.24178750  
-.62091550  0.00000000   70<br>  0.25012500  
-.62508500  0.00000000   71<br>  0.25846250  
-.62925450  0.00000000   72<br>  0.26680000  
-.63342400  0.00000000   73<br>  0.27513750  
-.63759350  0.00000000   74<br>  0.28347500  
-.64176300  0.00000000   75<br>  0.29181250  
-.64593250  0.00000000   76<br>  0.30015000  
-.65010200  0.00000000   77<br>  0.30848750  
-.65427150  0.00000000   78<br>  0.31682500  
-.65844100  0.00000000   79<br>  0.32516250  
-.66261050  0.00000000   80<br>  0.33350000  
-.66678000  0.00000000   81<br>  0.32516250  
-.65011050  0.00000000   82<br>  0.31682500  
-.63344100  0.00000000   83<br>  0.30848750  
-.61677150  0.00000000   84<br>  0.30015000  
-.60010200  0.00000000   85<br>  0.29181250  
-.58343250  0.00000000   86<br>  0.28347500  
-.56676300  0.00000000   87<br>  0.27513750  
-.55009350  0.00000000   88<br>  0.26680000  
-.53342400  0.00000000   89<br>  0.25846250  
-.51675450  0.00000000   90<br>  0.25012500  
-.50008500  0.00000000   91<br>  0.24178750  
-.48341550  0.00000000   92<br>  0.23345000  
-.46674600  0.00000000   93<br>  0.22511250  
-.45007650  0.00000000   94<br>  0.21677500  
-.43340700  0.00000000   95<br>  0.20843750  
-.41673750  0.00000000   96<br>  0.20010000  
-.40006800  0.00000000   97<br>  0.19176250  
-.38339850  0.00000000   98<br>  0.18342500  
-.36672900  0.00000000   99<br>  0.17508750  
-.35005950  0.00000000  100<br>  0.16675000  
-.33339000  0.00000000  101<br>  0.15841250  
-.31672050  0.00000000  102<br>  0.15007500  
-.30005100  0.00000000  103<br>  0.14173750  
-.28338150  0.00000000  104<br>  0.13340000  
-.26671200  0.00000000  105<br>  0.12506250  
-.25004250  0.00000000  106<br>  0.11672500  
-.23337300  0.00000000  107<br>  0.10838750  
-.21670350  0.00000000  108<br>  0.10005000  
-.20003400  0.00000000  109<br>  0.09171250  
-.18336450  0.00000000  110<br>  0.08337500  
-.16669500  0.00000000  111<br>  0.07503750  
-.15002550  0.00000000  112<br>  0.06670000  
-.13335600  0.00000000  113<br>  0.05836250  
-.11668650  0.00000000  114<br>  0.05002500  
-.10001700  0.00000000  115<br>  0.04168750  
-.08334750  0.00000000  116<br>  0.03335000  
-.06667800  0.00000000  117<br>  0.02501250  
-.05000850  0.00000000  118<br>  0.01667500  
-.03333900  0.00000000  119<br>  0.00833750  
-.01666950  0.00000000  120<br>  0.00000000  
0.00000000  0.00000000  121<br></font></div>
<div><font size="2">--<br></font><font size="2"></font></div><font size="2"></font>
<div><font size="2">Message: 3<br>Date: Wed, 15 Jun 2011 14:11:42 +0300<br>From: 
"yccheng.nju" <<a href="mailto:yccheng.nju@gmail.com">yccheng.nju@gmail.com</a>><br>Subject: 
Re: [Pw_forum] graphene phonon dispersion<br>To: PWSCF Forum <<a href="mailto:pw_forum@pwscf.org">pw_forum@pwscf.org</a>><br>Cc: yhho <<a href="mailto:yhho@pub.iams.sinica.edu.tw">yhho@pub.iams.sinica.edu.tw</a>><br>Message-ID: 
<<a href="mailto:4DF8936E.7090107@gmail.com">4DF8936E.7090107@gmail.com</a>><br>Content-Type: 
text/plain; charset="big5"<br><br>>Why dont you show us your input file for 
matdyn.x ? I think it is due to<br>>the wrong q-point 
setting.<br></font></div>
<div><font size="2">>On 15/06/11 12:28, yhho wrote:<br>> Dear all,<br>> I 
have tried many different way as I saw on pw_forum<br>> but I still can't get 
a good result which is similar to tthe figure<br>> from paper I 
found.<br>> In this figure, red line is what I got and gray line is from 
reference<br>> ref: *Physics Reports*<br>> <<a href="http://www.sciencedirect.com/science/journal/03701573%3E*Volume" target="_blank">http://www.sciencedirect.com/science/journal/03701573>*Volume</a> 
409,<br>> Issue 2*<br>> <<a href="http://www.sciencedirect.com/science?_ob=PublicationURL&_tockey=%23TOC%235540%232005%23995909997%23576885%23FLA%23&_cdi=5540&_pubType=J&view=c&_auth=y&_acct=C000053459&_version=1&_urlVersion=0&_userid=2446484&md5=88a06068733ddc56ccfa1fbe6299d583" target="_blank">http://www.sciencedirect.com/science?_ob=PublicationURL&_tockey=%23TOC%235540%232005%23995909997%23576885%23FLA%23&_cdi=5540&_pubType=J&view=c&_auth=y&_acct=C000053459&_version=1&_urlVersion=0&_userid=2446484&md5=88a06068733ddc56ccfa1fbe6299d583</a>>*,<br>> 
March 2005, Pages 47-99*<br>> <a href="http://imageshack.us/photo/my-images/853/c2phdosvc1.jpg/" target="_blank">http://imageshack.us/photo/my-images/853/c2phdosvc1.jpg/</a><br>> 
I also found another paper shows a little different phonon dispersion<br>> 
figure of graphite:<br>> red line is my result and gray line is from 
reference<br>> ref: *10.1103/PhysRevLett.92.075501*<br>> <a href="http://imageshack.us/photo/my-images/851/c2phdosvc3.jpg/" target="_blank">http://imageshack.us/photo/my-images/851/c2phdosvc3.jpg/</a><br>> 
I have no idea to improve this<br>> because I have tried vc-relax and relax 
and the structure didn't<br>> change a lot due to that.<br>> And I also 
tried increasing q-points, there's no much different from<br>> the fewer 
q-points results.<br>> Please give me some suggestion. Thanks very 
much.<br>> *input file*<br>> *(scf.in)*<br>> &control<br>> 
calculation ='scf'<br>> restart_mode ='from_scratch'<br>> pseudo_dir 
='/lustre/lwork/dyyang/bin/espresso-4.0.3/pseudo/'<br>> outdir ='./'<br>> 
prefix ='AuC'<br>> /<br>> &system<br>> ibrav =0<br>> celldm(1)= 
4.6514<br>> nat = 2 ,<br>> ntyp = 1 ,<br>> ecutwfc = 24.0,<br>> 
ecutrho = 240.0,<br>> occupations ='smearing',<br>> degauss= 0.02<br>> 
/<br>> &electrons<br>> diagonalization= 'david'<br>> conv_thr = 
1.0d-12<br>> mixing_beta = 0.7<br>> /<br>> ATOMIC_SPECIES<br>> C 
12.0107 C.pz-rrkjus.UPF<br>> CELL_PARAMETERS (alat)<br>> 0.984533834 
0.000000000 0.000000000<br>> -0.492266917 0.852631311 0.000000000<br>> 
0.000000000 0.000000000 5.328569075<br>> ATOMIC_POSITIONS {crystal}<br>> C 
0.481112321 1.128944752 0.517391300<br>> C 0.814471461 0.795556146 
0.517391309<br>> K_POINTS<br>> 7<br>> 0.0000000 0.0000000 0.0000000 
0.1250000<br>> 0.0000000 0.2932100 0.0000000 0.2500000<br>> 0.0000000 
-0.5864199 0.0000000 0.1250000<br>> 0.2539273 0.1466050 0.0000000 
0.5000000<br>> 0.2539273 0.4398150 0.0000000 0.5000000<br>> -0.5078546 
-0.2932100 0.0000000 0.2500000<br>> -0.5078546 0.0000000 0.0000000 
0.2500000<br>> (*ph.in*)<br>> phonons of AuC<br>> &inputph<br>> 
tr2_ph=1.0d-12,<br>> ldisp=.true.,<br>> nq1=4, nq2=4, nq3=1<br>> 
amass(1)= 12.0107<br>> prefix='AuC',<br>> outdir='./'<br>> 
fildyn='AuC.dyn',<br>> /<br>> --<br>> Yu-Han Ho<br>> Research 
Assistant<br>> Institute of Atomic and Molecular Sciences(IAMS), 
lab503<br>> No. 1, Roosevelt Rd., Sec. 4, Taipei, 10617, Taiwan<br>> Tel: 
886-2-2362-0212<br></font></div><font size="2"></font></font></div>
<br>_______________________________________________
Pw_forum mailing list
Pw_forum@pwscf.org
http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum</div>                                    </div></body>
</html>