Dear Amin:<br>
<div class="gmail_quote">
<div> </div>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">1 I understand that the task of this example is to find the minimum geometry. but how does it decide to to put the molecule in a box of side 12 bohr? where does 12 come from?</div></div></blockquote>
<div>You have to do a convergence test to decide the length of box.</div>
<div>In my experience, keeping the nearest neighbor atoms between period image above 10 angstrom is ok. However, if you are dealing with dipole moleculor, you have to pay much attention.</div>
<div> </div>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">Do we have to assign ibrav to zero whenever we want to optimize the geometry of an electronic system?</div></div></blockquote>
<div>It is up to the symmetry of your meleculor.</div>
<div> </div>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div dir="ltr">
<div dir="ltr"><br>2 How do you decide to set ecutwfc to 24? /Doc/INPUT_PW.txt just says that it is a cutoff energy for wavefunctions. I have no clue how much it should be<br></div></div></blockquote>
<div> </div>
<div>
<div>You have to do a convergence test to decide it.</div></div>
<div> </div>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div dir="ltr">
<div dir="ltr"><br>3 How do you set the x-component of the atomic position of carbon to be at 2.256 and all the other one to be zero?<br></div></div></blockquote>
<div> </div>
<div>2.256 0 0</div>
<div> </div>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div dir="ltr">
<div dir="ltr"><br>If you can guide me to a file or a link which explains these kind of questions, it would be great<br></div></div></blockquote>
<div> </div>
<div><a href="http://www.quantum-espresso.org/wiki/index.php/QESB09">http://www.quantum-espresso.org/wiki/index.php/QESB09</a></div>
<div><font face="Times New Roman">DFT in Practice:Some“Fundae” </font></div>
<div> </div>
<div> </div>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div dir="ltr">
<div dir="ltr"><br>Thanks<br>Amin<br></div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>____________________________________<br>Hui Wang<br>School of physics, Fudan University, Shanghai, China<br>