Well, Dear Mighfar,<br>        What I am talking about is the new script, there are only one Cu atom in it, while the only one didn't show up under <a href="http://scf.in">scf.in</a> file. <br>        Thanks all the same.<br>
<br><br><br><div class="gmail_quote">2010/6/22 Mighfar Imam <span dir="ltr"><<a href="mailto:mighfar@jncasr.ac.in">mighfar@jncasr.ac.in</a>></span><br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Dear Chengyu,<br>
your Cu atom is quite showing up in xcrysden! It<br>
is a Cu chain along the axis of your cnt.<br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
<br>
<br>
> Dear Professor and everyone,<br>
>      I  have successfully run the scf<br>
> calculation for a (6,6) cnt, and get<br>
> converged. Thanks for all your advice. Now my<br>
> boss want me to add a copper<br>
> atom in it, and do more calculations. I added<br>
> one, but the copper atom<br>
> cannot show in xcrysden, although again show in<br>
> .xyz files. I don't know<br>
> what the problem is , and I don't know if my<br>
> script is right for a cnt+<br>
> copper calculation, may anyone have a look at<br>
> it?At least I need to find the<br>
> copper atom out first.<br>
><br>
>         &CONTROL<br>
>                  calculation = 'scf' ,<br>
>                 restart_mode = 'from_scratch' ,<br>
>                        prefix = 'cnt' ,<br>
>  /<br>
>  &SYSTEM<br>
>                        ibrav = 6,<br>
>                    celldm(1) =<br>
> 21.764541128,celldm(3)=0.213765379<br>
>                          nat = 25,<br>
>                         ntyp = 2,<br>
>                      ecutwfc = 75 ,<br>
>  /<br>
>  &ELECTRONS<br>
>                     conv_thr = 1.0d-8 ,<br>
>                  mixing_beta = 0.7 ,<br>
>  /<br>
> ATOMIC_SPECIES<br>
>     C   12.01100  C.pz-vbc.UPF<br>
>     Cu  63.55     Cu.pz-d-rrkjus.UPF<br>
><br>
> ATOMIC_POSITIONS angstrom<br>
>   C        4.085165    -0.000000    -1.231010<br>
>   C        3.838021     1.399343    -1.231010<br>
>   C        3.537856     2.042582     0.000000<br>
>   C        2.624152     3.130877     0.000000<br>
>   C        2.042582     3.537856    -1.231010<br>
>   C        0.707144     4.023496    -1.231010<br>
>   C        0.000000     4.085165     0.000000<br>
>   C       -1.399343     3.838021     0.000000<br>
>   C       -2.042582     3.537856    -1.231010<br>
>   C       -3.130877     2.624152    -1.231010<br>
>   C       -3.537856     2.042582     0.000000<br>
>   C       -4.023496     0.707144     0.000000<br>
>   C       -4.085165     0.000000    -1.231010<br>
>   C       -3.838021    -1.399343    -1.231010<br>
>   C       -3.537856    -2.042582     0.000000<br>
>   C       -2.624152    -3.130877     0.000000<br>
>   C       -2.042582    -3.537856    -1.231010<br>
>   C       -0.707144    -4.023496    -1.231010<br>
>   C       -0.000000    -4.085165     0.000000<br>
>   C        1.399343    -3.838021     0.000000<br>
>   C        2.042582    -3.537856    -1.231010<br>
>   C        3.130877    -2.624152    -1.231010<br>
>   C        3.537856    -2.042582     0.000000<br>
>   C        4.023496    -0.707144     0.000000<br>
>   Cu       0            0            0<br>
><br>
> K_POINTS automatic<br>
>     1 1 5 0 0 0<br>
><br>
><br>
> Best regards.<br>
><br>
> Sincerely,<br>
> Chengyu Yang<br>
</div></div><div><div></div><div class="h5">> _______________________________________________<br>
> Pw_forum mailing list<br>
> <a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
> <a href="http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>
><br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>