HI,<br><br>Yes it is. Please see the last two lines....<br><br>Thanks,<br>TaeBum<br><br><div class="gmail_quote">2010/4/27 archygu <span dir="ltr"><<a href="mailto:archygu@gmail.com">archygu@gmail.com</a>></span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">





<div style="font-size: 10pt; font-family: verdana;">
<div><font color="#000080" face="Verdana" size="2">Hi, is this your full out put file? 
it seams that the error happen has not been mentioned. </font></div>
<div><font color="#000080" face="Verdana" size="2"></font> </div>
<div><font color="#000080" face="Verdana" size="2"></font> </div>
<div><font color="#c0c0c0" face="Verdana" size="2">2010-04-28 </font></div><font color="#000080" face="Verdana" size="2">
<hr style="width: 122px; min-height: 2px;" size="2" align="left">
</font>
<div><font color="#c0c0c0" face="Verdana" size="2"><span>archygu</span> 
</font></div><font color="#000080" face="Verdana" size="2">
<hr>
</font>
<div><font face="Verdana" size="2"><b>发件人:</b> TAE BUM LEE </font></div>
<div><font face="Verdana" size="2"><b>发送时间:</b> 2010-04-28  09:12:14 
</font></div>
<div><font face="Verdana" size="2"><b>收件人:</b> <a href="mailto:pw_forum@pwscf.org" target="_blank">pw_forum@pwscf.org</a> 
</font></div>
<div><font face="Verdana" size="2"><b>抄送:</b> </font></div>
<div><font face="Verdana" size="2"><b>主题:</b> [Pw_forum] parallel version 
error in quad core Xeon </font></div><div><div></div><div class="h5">
<div><font face="Verdana" size="2"></font> </div>
<div><font face="Verdana" size="2">Hi,<br><br>Does anybody know the reason of 
following error? The same input is OK on SGI altix computer while my Intel xeon 
desktop generate error just after execution. Serial version is OK for both case. 
Which part should I check first? My system is Intel Xeon quad core with ubuntu 
10.04. MPICH2 is configured with pwscf.  
<br><br>Regards,<br>TaeBum<br><br>     Program 
PWSCF     v.4.1.3  starts 
...<br>     Today is 27Apr2010 at 20: 4: 7 
<br><br>     Parallel version 
(MPI)<br><br>     Number of processors in 
use:       4<br>     R & G 
space division:  proc/pool =    
4<br><br>     For Norm-Conserving or Ultrasoft (Vanderbilt) 
Pseudopotentials or PAW<br><br>     Current dimensions of 
program pwscf are:<br>     Max number of different atomic 
species (ntypx) = 10<br>     Max number of k-points (npk) 
=  40000<br>     Max angular momentum in 
pseudopotentials (lmaxx) =  3<br>     Waiting for 
input...<br><br>     Subspace diagonalization in iterative 
solution of the eigenvalue problem:<br>     a parallel 
distributed memory algorithm will be used,<br>     
eigenstates matrixes will be distributed block like 
on<br>     ortho sub-group =    
2*   2 procs<br><br>     warning: symmetry 
operation # 24 not allowed.   fractional 
translation:<br>       0.0001000  
0.0001000  0.0000000  in crystal 
coordinates<br><br>     Planes per process (thick) : nr3 = 
36 npp =   9 ncplane =  576<br>     Planes 
per process (smooth): nr3s= 25 npps=   7 ncplanes=  
225<br><br>     Proc/  planes 
cols     G    planes cols    
G      columns  G<br>     
Pool       (dense 
grid)       (smooth 
grid)      (wavefct 
grid)<br>        1     
9     85     1957    
7     41      
699     14      
146<br>        2     
9     85     1957    
6     41      
701     13      
139<br>        3     
9     82     1954    
6     40      
690     14      
144<br>        4     
9     85     1955    
6     41      
701     14      
144<br>     tot     36    
337     7823   25    
163     2791     
55      573<br><br><br><br>     
bravais-lattice index     
=            
4<br>     lattice parameter (a_0)   
=       6.1404  
a.u.<br>     unit-cell 
volume          
=     321.0853 (a.u.)^3<br>     number 
of atoms/cell      
=            
4<br>     number of atomic types    
=            
2<br>     number of 
electrons       
=        36.00<br>     
number of Kohn-Sham 
states=           
22<br>     kinetic-energy cutoff     
=      16.0000  Ry<br>     
charge density cutoff     =     
128.0000  Ry<br>     convergence 
threshold     =      
1.0E-08<br>     mixing 
beta               
=       0.7000<br>     number 
of iterations used 
=            8  
plain     mixing<br>     
Exchange-correlation      =  SLA  
PW   PBE  PBE (1434)<br><br>     
celldm(1)=   6.140400  celldm(2)=   0.000000  
celldm(3)=   1.601400<br>     
celldm(4)=   0.000000  celldm(5)=   0.000000  
celldm(6)=   0.000000<br><br>     crystal axes: 
(cart. coord. in units of 
a_0)<br>               
a(1) = (  1.000000  0.000000  0.000000 )  
<br>               
a(2) = ( -0.500000  0.866025  0.000000 )  
<br>               
a(3) = (  0.000000  0.000000  1.601400 )  
<br><br>     reciprocal axes: (cart. coord. in units 2 
pi/a_0)<br>               
b(1) = (  1.000000  0.577350 -0.000000 )  
<br>               
b(2) = (  0.000000  1.154701  0.000000 )  
<br>               
b(3) = (  0.000000 -0.000000  0.624454 )  
<br><br><br>     PseudoPot. # 1 for Zn read from file 
Zn.pbe-van.UPF<br>     Pseudo is Ultrasoft, Zval = 
12.0<br>     Generated by new atomic code, or converted to 
UPF format<br>     Using radial grid of  869 
points,  6 beta functions with: 
<br>                
l(1) =   
0<br>                
l(2) =   
0<br>                
l(3) =   
1<br>                
l(4) =   
1<br>                
l(5) =   
2<br>                
l(6) =   2<br>     Q(r) pseudized with  8 
coefficients,  rinner =    0.800   
0.800   
0.800<br>                                                       
0.800   0.800<br><br>     PseudoPot. # 2 for 
O  read from file O.pbe-van_ak.UPF<br>     Pseudo is 
Ultrasoft, Zval =  6.0<br>     Generated by new atomic 
code, or converted to UPF format<br>     Using radial grid 
of  737 points,  4 beta functions with: 
<br>                
l(1) =   
0<br>                
l(2) =   
0<br>                
l(3) =   
1<br>                
l(4) =   1<br>     Q(r) pseudized with  8 
coefficients,  rinner =    0.800   
0.800   0.800<br><br><br>     atomic 
species   valence    mass     
pseudopotential<br>        
Zn            
12.00    65.41000     Zn( 
1.00)<br>        
O              
6.00    16.00000     O ( 
1.00)<br><br>     No symmetry!<br><br>   Cartesian 
axes<br><br>     site n.     
atom                  
positions (a_0 units)<br>         
1           Zn  
tau(  1) = (   0.0000000   0.5772925   
0.0000000  )<br>         
2           Zn  
tau(  2) = (   0.4999500   0.2886463   
0.8007000  )<br>         
3           O   
tau(  3) = (   0.0000000   0.5772925   
0.6118949  )<br>         
4           O   
tau(  4) = (   0.4999500   0.2886463   
1.3531830  )<br><br>     number of k 
points=   36  gaussian broad. (Ry)=  
0.0200     ngauss =   
1<br>                       
cart. coord. in units 2pi/a_0<br>        
k(    1) = (   0.0000000   
0.0000000   0.0000000), wk =   
0.0312500<br>        k(    2) 
= (   0.0000000   0.0000000   0.1561134), wk 
=   0.0625000<br>        
k(    3) = (   0.0000000   0.0000000  
-0.3122268), wk =   
0.0312500<br>        k(    4) 
= (   0.0000000   0.2886751   0.0000000), wk 
=   0.0625000<br>        
k(    5) = (   0.0000000   
0.2886751   0.1561134), wk =   
0.0625000<br>        k(    6) 
= (   0.0000000   0.2886751  -0.3122268), wk 
=   0.0625000<br>        
k(    7) = (   0.0000000  -0.5773503   
0.0000000), wk =   
0.0312500<br>        k(    8) 
= (   0.0000000  -0.5773503   0.1561134), wk 
=   0.0625000<br>        
k(    9) = (   0.0000000  -0.5773503  
-0.3122268), wk =   
0.0312500<br>        k(   10) = 
(   0.2500000   0.4330127   0.0000000), wk 
=   0.0625000<br>        
k(   11) = (   0.2500000   0.4330127   
0.1561134), wk =   
0.0625000<br>        k(   12) = 
(   0.2500000   0.4330127  -0.3122268), wk 
=   0.0625000<br>        
k(   13) = (  -0.2500000   0.1443376   
0.0000000), wk =   
0.0625000<br>        k(   14) = 
(   0.2500000   0.1443376   0.0000000), wk 
=   0.0625000<br>        
k(   15) = (   0.0000000  -0.2886751   
0.1561134), wk =   
0.0625000<br>        k(   16) = 
(  -0.2500000   0.1443376   0.1561134), wk 
=   0.0625000<br>        
k(   17) = (   0.2500000   0.1443376   
0.1561134), wk =   
0.0625000<br>        k(   18) = 
(  -0.2500000  -0.1443376   0.1561134), wk =   
0.0625000<br>        k(   19) = 
(   0.2500000  -0.1443376   0.1561134), wk 
=   0.0625000<br>        
k(   20) = (  -0.2500000   0.1443376  -0.3122268), 
wk =   0.0625000<br>        
k(   21) = (   0.2500000   0.1443376  
-0.3122268), wk =   
0.0625000<br>        k(   22) = 
(   0.5000000  -0.2886751   0.0000000), wk 
=   0.0312500<br>        
k(   23) = (  -0.5000000  -0.2886751   0.0000000), 
wk =   0.0312500<br>        
k(   24) = (   0.5000000  -0.2886751   
0.1561134), wk =   
0.0625000<br>        k(   25) = 
(  -0.5000000  -0.2886751   0.1561134), wk =   
0.0625000<br>        k(   26) = 
(   0.5000000  -0.2886751  -0.3122268), wk =   
0.0312500<br>        k(   27) = 
(  -0.5000000  -0.2886751  -0.3122268), wk =   
0.0312500<br>        k(   28) = 
(  -0.2500000   0.4330127   0.0000000), wk 
=   0.0625000<br>        
k(   29) = (   0.5000000   0.0000000   
0.0000000), wk =   
0.0625000<br>        k(   30) = 
(  -0.2500000  -0.4330127   0.1561134), wk =   
0.0625000<br>        k(   31) = 
(  -0.2500000   0.4330127  -0.1561134), wk =   
0.0625000<br>        k(   32) = 
(   0.2500000  -0.4330127  -0.1561134), wk =   
0.0625000<br>        k(   33) = 
(   0.5000000   0.0000000   0.1561134), wk 
=   0.0625000<br>        
k(   34) = (  -0.5000000   0.0000000   
0.1561134), wk =   
0.0625000<br>        k(   35) = 
(  -0.2500000   0.4330127   0.3122268), wk 
=   0.0625000<br>        
k(   36) = (   0.5000000   0.0000000  
-0.3122268), wk =   0.0625000<br><br>     G cutoff 
=  122.2485  (   7823 G-vectors)     FFT 
grid: ( 24, 24, 36)<br>     G cutoff =   
61.1243  (   2791 G-vectors)  smooth grid: ( 15, 15, 
25)<br>rank 3 in job 37  Lynx_60167   caused collective abort of 
all ranks<br>  exit status of rank 3: killed by signal 9 <br><br clear="all"><br>-- <br>########################################<br>TAE BUM 
LEE<br>Dept. Chem. & Biochem<br>Auburn Univ. AL. 36849<br>TEL.: 
334-844-6912<br>e-mail: <a href="mailto:taebumlee@gmail.com" target="_blank">taebumlee@gmail.com</a><br>########################################<br></font></div></div></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Pw_forum mailing list<br>
<a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
<a href="http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>########################################<br>TAE BUM LEE<br>Dept. Chem. & Biochem<br>Auburn Univ. AL. 36849<br>TEL.: 334-844-6912<br>e-mail: <a href="mailto:taebumlee@gmail.com">taebumlee@gmail.com</a><br>
########################################<br>