<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Difficult to say, without any knowledge of you input data, etc. Can you locate the region of the code where the error occur?<div><div><div>Among the many things that may give such an error (others may know much more than me) is two parallel primitive vectors for the Bravais lattice ...</div><div>SB</div><div><br></div><div>On Nov 30, 2009, at 7:26 AM, Lim Chiang Huay, Freda wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="State"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="country-region"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="place"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="Street"><o:smarttagtype namespaceuri="urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags" name="address"><div class="Section1"><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">Dear all,<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p> </o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">I am trying to run<span class="Apple-converted-space"> </span><st1:state w:st="on"><st1:place w:st="on">NEB</st1:place></st1:state><span class="Apple-converted-space"> </span>to find out the activation energy required to transform one configuration (sandwiched) of a sandwich-molecular wire to another configuration (zigged-zagged).<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p> </o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">And I get this error msg:<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p> </o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">     task #         3<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">     from  invmat  : error #         1<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">      singular matrix<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "> %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p> </o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">I can’t find any clue as to what’s wrong with my job from previous forum postings.<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p> </o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">Can anyone help?<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p> </o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">Thanks,<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">Rgds<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p> </o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">Freda Lim<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">Institute of High Performance Computing<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><st1:street w:st="on"><st1:address w:st="on"><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">1 Fusionopolis Way, #16-16</span></font></st1:address></st1:street><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><span class="Apple-converted-space"> </span>Connexis<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><st1:place w:st="on"><st1:country-region w:st="on"><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">Singapore</span></font></st1:country-region></st1:place><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><span class="Apple-converted-space"> </span>138632<o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; ">Email:<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:limch@ihpc.a-star.edu.sg" style="color: blue; text-decoration: underline; ">limch@ihpc.a-star.edu.sg</a><o:p></o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p> </o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p> </o:p></span></font></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; margin-left: 0in; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman'; "><font size="2" face="Arial"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial; "><o:p> </o:p></span></font></div></div><br><hr><font face="Arial" color="Gray" size="2">This email is confidential and may be privileged. If you are not the intended recipient, please delete it and notify us immediately. Please do not copy or use it for any purpose, or disclose its contents to any other person. Thank you.<br></font>_______________________________________________<br>Pw_forum mailing list<br><a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org" style="color: blue; text-decoration: underline; ">Pw_forum@pwscf.org</a><br><a href="http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum" style="color: blue; text-decoration: underline; ">http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum</a><br></o:smarttagtype></o:smarttagtype></o:smarttagtype></o:smarttagtype></o:smarttagtype></div></span></blockquote></div><br><div apple-content-edited="true"> <span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">---</span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">Stefano Baroni - SISSA</span></font><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">  </span></font><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">&</span></font><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">  </span></font><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">DEMOCRITOS National Simulation Center - Trieste</span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; "><a href="http://stefano.baroni.me">http://stefano.baroni.me</a> [+39] 040 3787 406 (tel) -528 (fax) / stefanobaroni (skype)</span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; min-height: 14px; font-size: 12px; "><br style="font-size: 12px; "></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; min-height: 14px; font-size: 12px; "><span class="Apple-style-span" style="font-size: 14px; "><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">La morale est une logique de l'action comme la logique est une morale de la pensée - Jean Piaget</span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; "><br></span></font></div></span></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">Please, if possible, don't</span></font><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">  </span></font><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">send me MS Word or PowerPoint attachments</span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">Why? See:</span></font><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">  </span></font><font class="Apple-style-span" color="#0023E9" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; "><a href="http://www.gnu.org/philosophy/no-word-attachments.html">http://www.gnu.org/philosophy/no-word-attachments.html</a></span></font></div><div><font class="Apple-style-span" color="#0023E9" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; "><br class="webkit-block-placeholder"></span></font></div></div></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"> </div><br></div></body></html>