<div>thank you for your detailed analysis.  your guess is right .my outdir is set to a place,not local to the nodes.i know the reason of my slow job,although i did not know it through.  as for how to use a local directory as outdir ,it seems another new thing for me.

</div>

<div>would it be possible to tell me about that ?</div>

<div>thank you in advance <br> </div>

<div> </div>

<div> </div>

<div>your sincerely </div>

<div> xuyuehua</div>

<div>   </div>

<div><span class="gmail_quote">2007/12/13, Lorenzo Paulatto <<a href="mailto:paulatto@sissa.it">paulatto@sissa.it</a>>:</span>

<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid"><br>On Thu, December 13, 2007 13:42, xu yuehua wrote:<br>> yes,maybe once i set  disk_io="none" ,when something goes wrong ,like

<br>> power<br>> is off suddenly,you have to start from  scratch .from this point ,it is<br>> wasting time in deed.<br>> but is there  an better idea ?<br>> i am wondering<br><br>I think it is highly unlikely that you have more RAM than disk space, so

<br>disk space should be no issue. Furthermore it should not be so slow, as<br>long as you are leaving wfc_collect=.false. which is the default.<br><br>From these assumptions I can guess that you are using a network share as

temporary directory for your calculation; in other words your outdir is set to some place, probably in you home directory, which is not local to nodes but stays on a server and is shared via NFS (network file system).

<br><br>If this is your case, every time wavefunctions are written the data has to<br>pass trough the network, it is somehow equivalent to collect_wfc=.true.<br>but done externally by the operating system. Furthermore if you are using

<br>the same network for NFS and mpi when the traffic from NFS suddenly bursts<br>it is likely to conflict with mpi and slow it down a lot.<br><br>To avoid this problem you must use a local directory as outdir (like<br>/tmp), but you to have to remember that if you want to restart a job you

have to use exactly the same node you used before in order for them to find their wavefunctions. Otherwise you may have to recollect the data by hand, which is probably not trivial (I have never tried). I hope what I wrote was not already known to you, goodbye.

<br>--<br>Lorenzo Paulatto<br>+39 040 3787 511<br><a href="http://people.sissa.it/~paulatto/">http://people.sissa.it/~paulatto/</a><br><br><br>----------------------------------------------------------------<br>SISSA Webmail 

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<br><br clear="all"><br>-- <br>Xu Yuehua<br>physics Department of Nanjing university<br>China 